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J-GLOBAL ID：202102260140087025   整理番号：21A0793189

多様な系統ゲノムデータセットは,ラウラシアの間関係の調和シナリオを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Diverse phylogenomic datasets uncover a concordant scenario of laurasiatherian interordinal relationships

著者 (13件)： Lv Xue (State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Bio-Resources in Yunnan, Yunnan University, Kunming, China) ,  Lv Xue (School of Life Sciences, Yunnan University, Kunming, China) ,  Hu Jingyang (State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Bio-Resources in Yunnan, Yunnan University, Kunming, China) ,  Hu Jingyang (School of Life Sciences, Yunnan University, Kunming, China) ,  Hu Jingyang (Kunming College of Life Science, University of Chinese Academy of Sciences, Kunming, China) ,  Hu Yiwen (State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Bio-Resources in Yunnan, Yunnan University, Kunming, China) ,  Hu Yiwen (School of Life Sciences, Yunnan University, Kunming, China) ,  Li Yitian (State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Bio-Resources in Yunnan, Yunnan University, Kunming, China) ,  Li Yitian (School of Life Sciences, Yunnan University, Kunming, China) ,  Xu Dongming (State Key Laboratory of Genetic Resources and Evolution, Kunming Institute of Zoology, Kunming, China) ,  Ryder Oliver A. (Institute for Conservation Research, San Diego Zoo Global, Escondido, CA, USA) ,  Irwin David M. (Department of Laboratory Medicine and Pathobiology, University of Toronto, Toronto, Canada) ,  Yu Li (State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Bio-Resources in Yunnan, Yunnan University, Kunming, China)
資料名： Molecular Phylogenetics and Evolution  (Molecular Phylogenetics and Evolution)
巻： 157  ページ： Null  発行年： 2021年 
JST資料番号： W1678A  ISSN： 1055-7903  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 哺乳類の超順序Laurasiatheriaにおける相互関係の解決は,高レベル哺乳類系統学における最も難治性の問題であり,多くの矛盾する仮説が提案されてきた。本研究は,2つの蛋白質コードデータセット(2,761,247アミノ酸残基から成るアミノ酸データセットのための186の蛋白質コード遺伝子,および1番目および2番目のコドン位置からの516,340のヌクレオチドからなるヌクレオチドデータセット,1,162,723ヌクレオチドから成る1210イントロン)および7つの非ラウラシアテリアのグループを含む4つの蛋白質コードデータセット(1,10,2,723ヌクレオチドから成る1,246,1,1210イントロン,1,162,723ヌクレオチドから成る1210イントロン)および1,1,1,1,1,2,1,2,1,2,1,4,7,注目すべきことに,異なる樹木構築法(RAxML,FastTree,ASTRALおよびMP-EST)を用いた4つのデータセットで再構築された系統樹は,すべての関係(Eulipo typhila,(Chiroptera,((Carnivora,Pholidota),(Cartiodactyla,Perissodactyla)))を支持した。本研究で使用したマーカーのすべてのタイプ間のLaurasiatheriaの相互関係の分解能を見出し,樹木比較の尤度比試験は,現在の樹木トポロジーが他の試験仮説と比較して最適な仮説であることを確認した。Jackknifingのサブサンプリング分析は,ララシアテリアの木の再構成の結果が,用いた遺伝子座と順序の代表数によって変化し,これは,以前の研究で見られたLaurasiatheriaの系統発生的不一致に対する2つの主要な寄与者であるらしいことを示している。本研究は,ララシアテリアの進化への重要な洞察を提供し,さらに,系統発生学の分野で長年の挑戦である適応放射線の系統学を解決するための重要な方法論的戦略と参照を提供する。Copyright 2021 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 位相幾何学 ,  放射線 ,  アミノ酸 ,  遺伝子 ,  コドン ,  タンパク質 ,  *ヌクレオチド ,  哺乳類 ,  系統樹 ,  系統発生 ,  コウモリ ,  アミノ酸残基 ,  イントロン
準シソーラス用語： ゲノミクス ,  系統学 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ラウラシア ,  適応放射 ,  系統ゲノミクス解析 ,  イントロンデータセット ,  UCEデータセット ,  符号化データセット

分類 (2件)： 動物分類学  (EJ01030T) ,  進化論一般  (EC03010Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： 系統 ,  ゲノム ,  データセット ,  調和 ,  シナリオ