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J-GLOBAL ID：202102260273143669   整理番号：21A1473437

15のマイクロサテライトマーカーにより明らかにした長野県におけるマツタケ(Tricholoma matsutake)個体群の局所レベル遺伝的多様性と構造【JST・京大機械翻訳】

Local-Level Genetic Diversity and Structure of Matsutake Mushroom (Tricholoma matsutake) Populations in Nagano Prefecture, Japan, Revealed by 15 Microsatellite Markers

著者 (6件)： Kurokochi Hiroyuki (Asian Natural Environmental Science Center, the University of Tokyo, 1-1-8 Midori-cho, Nishitokyo, Tokyo 188-0002, Japan) ,  Zhang Shijie (Asian Natural Environmental Science Center, the University of Tokyo, 1-1-8 Midori-cho, Nishitokyo, Tokyo 188-0002, Japan) ,  Takeuchi Yoshie (Nagano Prefectural College of Forestry, 4385-1 Shinkai, Kiso, Kiso-gun, Nagano 397-0002, Japan) ,  Tan Engkong (Graduate School of Agricultural and Life Sciences, the University of Tokyo, 1-1-1 Yayoi, Bunkyo-Ku, Tokyo 113-8657, Japan) ,  Asakawa Shuichi (Graduate School of Agricultural and Life Sciences, the University of Tokyo, 1-1-1 Yayoi, Bunkyo-Ku, Tokyo 113-8657, Japan) ,  Lian Chunlan (Asian Natural Environmental Science Center, the University of Tokyo, 1-1-8 Midori-cho, Nishitokyo, Tokyo 188-0002, Japan)
資料名： Journal of Fungi (Web)  (Journal of Fungi (Web))
巻： 3  号： 2  ページ： 23  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7219A  ISSN： 2309-608X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： マツタケ(Tricholoma matsuake)の年間収量は,過去数十年にわたって日本で一貫して減少した。次世代シークエンシングを用いて開発された15の多型および共優性単純配列反復(SSR)マーカーを用いて,日本の長野における10の集団の遺伝子解析を行った。SSRを用いて,223の遺伝子型を同定し,そのどれも1つ以上の集団で観察されなかった。平均予想ヘテロ接合性と標準化対立遺伝子豊富度は,それぞれ0.67と4.05であった。多くの対立遺伝子は,10の個体群のうちの1つだけに現れた。これらの民間対立遺伝子の34は,3.4の個体群当たりの平均数で検出された。固定指数(FST)と標準化された遺伝的分化(G′ST)値は,それぞれ0.019と0.028であった。分子分散分析(AMOVA)の解析は,個体群内の個体群,個体群内の遺伝子間,および全変動に対する遺伝子変化内の寄与が,それぞれ,2.91%,11.62%,および85.47%であり,遺伝的分化がすべてのソースで検出されたことを示した。”その遺伝子多様性は,それぞれ,2.91%,11.62%,および85.47%であった,そして,全変動に対する遺伝的分化は,それぞれ,2.91%,11.62%,および85.47%であった。45のペアワイズFST値の28は,ゼロより大きく,距離による分離のパターンは,10の集団の間で検出されなかった。Bayesベースのクラスタ化は個体群間で明確な差を示さなかった。これらの結果は,コロニーの再確立が圃場内での移植によって最もよく達成されることを示唆する。これが可能でないならば,数10キロメートル以内の移植は,元の集団遺伝構造にほとんど損傷を起こさない。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 標準化 ,  分散分析 ,  遺伝子 ,  遺伝子型 ,  クラスタ化 ,  対立遺伝子 ,  コロニー ,  *マツタケ ,  優性 ,  *個体群 ,  種分化
準シソーラス用語： 遺伝子解析 ,  ヘテロ接合性 ,  *マイクロサテライトマーカー ,  次世代シークエンシング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 遺伝的多様性 ,  個人の対立遺伝子 ,  マイクロサテライトマーカー ,  遺伝子 ,  遺伝子保存

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (29件)：

• Yamanaka, K.; Aimi, T.; Wan, J.; Cao, H.; Chen, M. Species of host trees associated with Tricholoma matsutake and close allies in Asia. Mushroom Sci. Biotechnol. 2011, 19, 79-87.
• Kobayashi, F.; Ito, T.; Fujita, H. Cultivation of Matsutake in field in Kyoto prefecture: Standards of selection for suitable site and controlling of environments. Jpn. Soc. For. Environ. 1980, 22, 1-7.
• Matsushita, N.; Kikuchi, K.; Sasaki, Y.; Guerin-Laguette, A.; Lapeyrie, F.; Vaario, L.M.; Suzuki, K. Genetic relationship of Tricholoma matsutake and T. nauseosum from the Northern Hemisphere based on analyses of ribosomal DNA spacer regions. Mycoscience 2005, 46, 90-96.
• Murata, H.; Babasaki, K.; Saegusa, T.; Takemoto, K.; Yamada, A.; Ohta, A. Traceability of Asian Matsutake, specialty mushrooms produced by the ectomycorrhizal basidiomycete Tricholoma matsutake, on the basis of retroelement-based DNA markers. Appl. Environ. Microbiol. 2008, 74, 2023-2031.
• Wan, J.; Kiuke, A.; Yamanaka, K.; Saotome, K.; Morinaga, T.; Tanaka, C.; Terashima, Y.; Aimi, T. Genetic diversity of Tricholoma matsutake and close allies associated with broad-leaved trees in Asia. Mushroom Sci. Biotechnol. 2012, 19, 167-174.

タイトルに関連する用語 (6件)： マイクロサテライトマーカー ,  長野 ,  マツタケ ,  Tricholoma ,  個体 ,  遺伝的多様性