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J-GLOBAL ID：202102260428715766   整理番号：21A0313752

イネOsURGT1遺伝子のバイオインフォマティクス及び発現プロファイリング【JST・京大機械翻訳】

Expression Profile and Bioinformatics Analysis of OsURGT1 Gene

著者 (9件)： Su Ying (湖南農業大学 農学院,水稻油菜抗病育種湖南省重点実験室,作物基因工程湖南省重点実験室,湖南 長沙 410128) ,  Du Qiang (湖南農業大学 農学院,水稻油菜抗病育種湖南省重点実験室,作物基因工程湖南省重点実験室,湖南 長沙 410128) ,  Guo Chongyan (gan州市花卉研究所,江西 gan州 341413) ,  Zhou Min (湖南農業大学 農学院,水稻油菜抗病育種湖南省重点実験室,作物基因工程湖南省重点実験室,湖南 長沙 410128) ,  Shi Weijie (湖南農業大学 農学院,水稻油菜抗病育種湖南省重点実験室,作物基因工程湖南省重点実験室,湖南 長沙 410128) ,  Zhao Qiong (湖南農業大学 農学院,水稻油菜抗病育種湖南省重点実験室,作物基因工程湖南省重点実験室,湖南 長沙 410128) ,  Wu Xiaoyu (湖南農業大学 農学院,水稻油菜抗病育種湖南省重点実験室,作物基因工程湖南省重点実験室,湖南 長沙 410128) ,  Wang Zhilong (湖南農業大学 農学院,水稻油菜抗病育種湖南省重点実験室,作物基因工程湖南省重点実験室,湖南 長沙 410128) ,  Chen Qiuhong (湖南農業大学 農学院,水稻油菜抗病育種湖南省重点実験室,作物基因工程湖南省重点実験室,湖南 長沙 410128)
資料名： Huabei Nongxuebao  (Huabei Nongxuebao)
巻： 35  号： 5  ページ： 1-10  発行年： 2020年 
JST資料番号： C2462A  ISSN： 1000-7091  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： NSTsは細胞中でヌクレオチド単糖類をゴルジ体(Golgi)/小胞体(ER)に輸送し、細胞壁多糖分子の生合成に基質を提供し、水稲NSTs遺伝子の研究が植物のNSTsタンパク質の機能の深い理解に良好な基礎を築く。シロイヌナズナAtURGT遺伝子配列の相同比較により、イネにおいて、UDP-ラムノース/UDP-ガラクトース活性を有する遺伝子を発見した。OsURGT1(UDP-L-Rha/UDP-D-Galtransporters)と命名した。アミノ酸組成,進化関係,物理化学的特性,膜貫通ドメイン,および高次構造を予測し,そのプロモーター配列のシス作用要素を分析し,イネにおけるOsURGT1遺伝子の転写発現プロファイルと発現を分析した。ホルモンおよび非生物的ストレスは,発現プロファイルを誘導した。結果は以下を示した。OsURGT1遺伝子の全長は3421bpであり、5つのエクソンを含む。CDSの全長は996bpであり、331アミノ酸の長さのタンパク質をコードし、このタンパク質は疎水性タンパク質であり、9つの膜貫通ドメインを含む。蛋白質の高次構造モデリングの結果、NSTテンプレートタンパク質と高度に似ていることが分かった。遺伝子プロモーターのシス作用要素分析の結果、OsURGT1遺伝子は多種のホルモン制御経路とストレス制御経路に関与している可能性がある。転写発現プロファイリングの結果,OsURGT1遺伝子は,イネの全成長期と各組織部位で発現し,葉における発現量が最も高かった。6種類のホルモン(ABA、Eth、GA、SA、MeJA、2,4-D)の処理に対して、いずれも強い応答発現があった。干ばつ、低温、塩、酸化、高温、重金属などのストレスストレスに対しても、ある程度の応答発現がある。まとめると、OsURGT1遺伝子は一つのNSTタンパク質ファミリーメンバーをコードし、一部のホルモン調節とストレス応答過程に関与する可能性がある。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 低温 ,  重金属 ,  生合成 ,  疎水性 ,  多糖類 ,  *遺伝子 ,  Golgi体 ,  タンパク質 ,  ヌクレオチド ,  ホルモン ,  干ばつ ,  プロモーター領域 ,  Arabidopsis thaliana
準シソーラス用語： *バイオインフォマティクス ,  非生物的ストレス , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  稲作  (FC03020C)

タイトルに関連する用語 (5件)： イネ ,  遺伝子 ,  バイオインフォマティクス ,  発現 ,  プロファイリング