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J-GLOBAL ID：202102260707476620   整理番号：21A2358924

前立腺癌の確立された予後バイオマーカーに対する説明可能性の限界【JST・京大機械翻訳】

Limitations of Explainability for Established Prognostic Biomarkers of Prostate Cancer

著者 (9件)： Manjang Kalifa (Predictive Society and Data Analytics Lab, Faculty of Information Technology and Communication Sciences, Tampere University, Tampere, Finland) ,  Yli-Harja Olli (Computational Systems Biology, Tampere University, Tampere, Finland) ,  Yli-Harja Olli (Institute for Systems Biology, Seattle, WA, United States) ,  Yli-Harja Olli (Faculty of Medicine and Health Technology, Institute of Biosciences and Medical Technology, Tampere University, Tampere, Finland) ,  Dehmer Matthias (Department of Computer Science, Swiss Distance University of Applied Sciences, Brig, Switzerland) ,  Dehmer Matthias (Department of Mechatronics and Biomedical Computer Science, University for Health Sciences, Medical Informatics and Technology (UMIT), Hall, Austria) ,  Dehmer Matthias (College of Artificial Intelligence, Nankai University, Tianjin, China) ,  Emmert-Streib Frank (Predictive Society and Data Analytics Lab, Faculty of Information Technology and Communication Sciences, Tampere University, Tampere, Finland) ,  Emmert-Streib Frank (Faculty of Medicine and Health Technology, Institute of Biosciences and Medical Technology, Tampere University, Tampere, Finland)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 12  ページ： 649429  発行年： 2021年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ハイスループット技術は,基本的な生物学的研究だけでなく,病院における臨床応用にも新しい手段を提供する。例えば,癌進行を予測するための予後バイオマーカーとしての遺伝子発現プロファイルの利用は,広範な興味を見出した。患者の進行の予測とは別に,そのような予後バイオマーカーは疾患メカニズムに関する貴重な情報と障害の原因となる根底にある分子過程も提供すると考えられている。しかし,後者の仮定は挑戦されている。本稿では,前立腺癌に対するこの問題を検討した。特に,遺伝子発現プロファイルに基づく前立腺癌の多数の以前に発表された予後シグネチャを調べ,これらが前立腺癌の根底にある疾患病因に関するユニークな情報を提供できないことを示した。したがって,著者らの解析は,研究した署名のどれも,明白な生物学的意味を持たないことを明らかにした。全体として,これは,検討した全ての予後シグネチャが,前立腺癌結果の顕在的予測を可能にする唯一のブラックボックスモデルであるが,前立腺癌の理解を増強する原因説明を提供できないことを示す。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 生物統計学 ,  ブラックボックス ,  *予後 ,  *前立腺腫瘍 ,  *バイオマーカー ,  病因
準シソーラス用語： 生存率分析 ,  腫瘍進行 ,  ハイスループット ,  臨床応用 ,  遺伝子プロファイル , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 前立腺癌 ,  バイオマーカー ,  予後バイオマーカー ,  生存解析 ,  データ科学 ,  計算生物学 ,  生物統計学

分類 (2件)： 腫ようの診断  (GE03020J) ,  泌尿生殖器の腫よう  (GM04000S)

引用文献 (56件)：

• Agell L., Hernández S., Nonell L., Lorenzo M., Puigdecanet E., de Muga S., et al. (2012). A 12-gene expression signature is associated with aggressive histological in prostate cancer: Sec14l1 and tceb1 genes are potential markers of progression. Am. J. Pathol. 181, 1585-1594. doi: 10.1016/j.ajpath.2012.08.005
• Ashburner M., Ball C., Blake J., Botstein D., Butler H., et al. (2000). Gene Ontology: tool for the unification of biology. The Gene ontology consortium. Nat. Genet. 25, 25-29. doi: 10.1038/75556
• Bibikova M., Chudin E., Arsanjani A., Zhou L., Garcia E. W., Modder J., et al. (2007). Expression signatures that correlated with gleason score and relapse in prostate cancer. Genomics 89, 666-672. doi: 10.1016/j.ygeno.2007.02.005
• Bismar T. A., Demichelis F., Riva A., Kim R., Varambally S., He L., et al. (2006). Defining aggressive prostate cancer using a 12-gene model. Neoplasia 8:59. doi: 10.1593/neo.05664
• Breiman L. (2001). Statistical modeling: the two cultures. Stat. Sci. 16, 199-231. doi: 10.1214/ss/1009213726

タイトルに関連する用語 (6件)： 前立腺癌 ,  予後 ,  バイオマーカー ,  説明 ,  可能性 ,  限界