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J-GLOBAL ID：202102261127113396   整理番号：21A1903632

6種のバラ科種における若い重複を駆動する適応進化【JST・京大機械翻訳】

Adaptive evolution driving the young duplications in six Rosaceae species

著者 (4件)： Zhong Yan (College of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China) ,  Zhang Xiaohui (School of Life Science, Nanjing University, Nanjing, China) ,  Shi Qinglong (College of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China) ,  Cheng Zong-Ming (College of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 22  号： 1  ページ： 1-16  発行年： 2021年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 植物ゲノムにおいて,重複コピーの高い比率は,遺伝子重複が植物種の進化過程において重要な役割をしていることを明らかにした。植物ゲノムにおける最近の重複事象後の正の選択下の一連の遺伝子ファミリーは,適応進化により駆動される複製の進化を示した。しかし,近縁種間の若い重複遺伝子のゲノムワイド進化特徴はほとんど報告されていない。本研究では,6つのRosaceae種間のゲノムワイドレベルでの若い複製遺伝子の系統的調査を行い,その全ゲノム配列決定データを近年,連続的に放出した。合計35,936の遺伝子ファミリーが6つの種の間で検出され,60.25%が若い重複によって発生した。21,650の若い複製遺伝子ファミリーは,それらの重複パターン,種特異的および系統特異的拡張に基づく2つの拡大タイプに分けることができた。著者らの結果は,系統特異的拡張を越えている種特異的膨張を示した。2種類の拡大において,高周波複製ドメインは環境ストレスに応答して機能的選好を示した。両拡大型における若い複製遺伝子の機能的選好は,それらが非生物的または生物的刺激に応答する傾向があることを示した。さらに,種特異的および系統特異的拡大の両方における正の選択下の若い複製遺伝子は,それらがRosaceae種の環境因子に適応するために発生することを示唆した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  HF【周波数】 ,  ゲノム ,  *バラ科 ,  遺伝子重複
準シソーラス用語： オーバーラップ遺伝子 ,  植物ゲノム ,  環境ストレス ,  ドメイン構造 ,  ゲノム配列 ,  環境因子 ,  近縁種 ,  *適応進化 ,  遺伝子ファミリー ,  進化過程 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 若い重複 ,  バラ科種 ,  種特異的拡大 ,  系統特異的拡大 ,  環境ストレス ,  適応進化

分類 (1件)： 進化論一般  (EC03010Q)

引用文献 (89件)：

• Evolution by gene duplication; 1970; CR1; S Ohno; citation_publisher=Springer
• Science; Natural selection and the origin of jingwei, a chimeric processed functional gene in Drosophila; M Long, CH Langley; 260; 5104; 1993; 91-95; 10.1126/science.7682012; citation_id=CR2
• Curr Opin Plant Biol; The evolutionary dynamics of plant duplicate genes; RC Moore, MD Purugganan; 8; 2; 2005; 122-128; 10.1016/j.pbi.2004.12.001; citation_id=CR3
• Front Plant Sci.; Alignment of Rutaceae genomes reveals lower genome fractionation level than Eudicot genomes affected by extra Polyploidization; JQ Yuan, JP Wang, JG Yu, FB Meng, YH Zhao, J Li, PC Sun, SR Sun, ZK Zhang, C Liu; 10; 2019; 986; 10.3389/fpls.2019.00986; citation_id=CR4
• Science; The evolutionary fate and consequences of duplicate genes; M Lynch, JS Conery; 290; 5494; 2000; 1151-1155; 10.1126/science.290.5494.1151; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (2件)： バラ科 ,  適応進化