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J-GLOBAL ID：202102261443729909   整理番号：21A2364309

CRISPR遺伝子編集のための重要なカロチノイド遺伝子を同定するためのOrnithogalum dubiumの葉と花のトランスクリプトームプロファイリング【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome Profiling of Ornithogalum dubium Leaves and Flowers to Identify Key Carotenoid Genes for CRISPR Gene Editing

著者 (8件)： Wei Zunzheng (Institute of Plant Science, The Volcani Center, Agricultural Research Organization, Bet Dagan 50250, Israel) ,  Arazi Tzahi (Institute of Plant Science, The Volcani Center, Agricultural Research Organization, Bet Dagan 50250, Israel) ,  Hod Nofar (Institute of Plant Science, The Volcani Center, Agricultural Research Organization, Bet Dagan 50250, Israel) ,  Zohar Matat (Newe Yaar Research Center, Agricultural Research Organization, Ramat Yishay 30095, Israel) ,  Isaacson Tal (Newe Yaar Research Center, Agricultural Research Organization, Ramat Yishay 30095, Israel) ,  Doron-Faigenboim Adi (Institute of Plant Science, The Volcani Center, Agricultural Research Organization, Bet Dagan 50250, Israel) ,  Reznik Noam (Institute of Plant Science, The Volcani Center, Agricultural Research Organization, Bet Dagan 50250, Israel) ,  Yedidia Iris (Institute of Plant Science, The Volcani Center, Agricultural Research Organization, Bet Dagan 50250, Israel)
資料名： Plants (Web)  (Plants (Web))
巻： 9  号： 4  ページ： 540  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7261A  ISSN： 2223-7747  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Ornithogalum dubiumは,純粋な白色から深いオレンジまでの花色を有する南アフリカに固有の一般的な観賞用単子葉植物である。CRISPR/Cas9システムに基づく遺伝子編集は,観賞用花作物における色改善の可能性を保持することが最近示された。このアプローチをOrithogalumカラー操作に適用するためには,ゲノムまたはトランスクリプトミクスデータを最初に収集しなければならない。ここでは,O.dubiumの葉と花のcDNAライブラリーを構築し,Illumina HiSeq2500を用いて配列決定した。155百万100bpの対端読取を360,689コンティグのトランスクリプトームデータベースに組み立て,そのうち18,660コンティグを葉と花の間で差次的に発現させた。カロチノイドはオレンジ色のO.dubium花への主な色素付与スペクトルである。データベースを問い合わせ,Ornithogalumのカロチノイド生合成経路に関与すると予測される合計16のユニークな転写物(unigenes)を同定した。カロチノイドプロファイルを組み合わせて,O.dubiumにおける花の着色と蓄積に関与するいくつかの重要な単一遺伝子をさらに推論し,その遺伝子LCYB/comp146645_c0が,O.dubiumの潜在的に赤い花品種を生成する適切な標的として見出された。したがって,本研究は,この観賞作物を改善するためにCRISPR/Cas9技術の適用のためのフレームワークを提供する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  農作物 ,  *カロチノイド ,  *遺伝子 ,  オレンジ ,  色素 ,  スペクトル ,  ゲノム ,  単子葉植物 ,  品種 ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： トランスクリプトーム解析 ,  cDNAライブラリー ,  コンティグ ,  花色 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： カロテノイド経路 ,  装飾 ,  Ornithogalum dubium ,  トランスクリプトーム

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (51件)：

• Noman, A.; Aqeel, M.; Deng, J.; Khalid, N.; Sanaullah, T.; He, S. Biotechnological advancements for improving floral attributes in ornamental plants. Front. Plant Sci. 2017, 8, 530.
• Tun, O.M.; Lipsky, A.; Knaan, T.L.; Kerem, Z.; Yedidia, I. The plant activator BTH promotes Ornithogalum dubium and O. thyrsoides differentiation and regeneration in vitro. Biol. Plant. 2013, 57, 41-48.
• Lipsky, A.; Cohen, A.; Ion, A.; Yedidia, I. Genetic transformation of Ornithogalum via particle bombardment and generation of Pectobacterium carotovorum-resistant plants. Plant Sci. 2014, 228, 150-158.
• Jaganathan, D.; Ramasamy, K.; Sellamuthu, G.; Jayabalan, S.; Venkataraman, G. CRISPR for crop improvement: An update review. Front. Plant Sci. 2018, 9, 985.
• Francis, D.; Finer, J.J.; Grotewold, E. Challenges and opportunities for improving food quality and nutrition through plant biotechnology. Curr. Opin. Biotechnol. 2017, 44, 124-129.

タイトルに関連する用語 (8件)： CRISPR ,  遺伝子編集 ,  カロチノイド ,  遺伝子 ,  同定 ,  Ornithogalum ,  葉 ,  花