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J-GLOBAL ID：202102261632564050   整理番号：21A0050569

バイオインフォマティクスの方法を用いて,HCCの予後に関連する鍵となる遺伝子をスクリーニングした。【JST・京大機械翻訳】

Screening and validation of key genes related to prognosis of hepatocellular carcinoma by bioinformatics analysis

著者 (8件)： Shi Liwen (武漢大学中南医院消化内科 湖北省腸病医学臨床研究中心湖北省腸病重点実験室 430071) ,  Wang Huaqiao (武漢大学中南医院胃腸外科 武漢市腹膜癌臨床医学研究中心 湖北省腫瘤医学臨床研究中心 腫瘤生物学行為湖北省重点実験室 430071) ,  Yang Tiecheng (武漢大学中南医院胃腸外科 武漢市腹膜癌臨床医学研究中心 湖北省腫瘤医学臨床研究中心 腫瘤生物学行為湖北省重点実験室 430071) ,  Yang Lijie (武漢大学中南医院胃腸外科 武漢市腹膜癌臨床医学研究中心 湖北省腫瘤医学臨床研究中心 腫瘤生物学行為湖北省重点実験室 430071) ,  Wang Danwen (武漢大学中南医院胃腸外科 武漢市腹膜癌臨床医学研究中心 湖北省腫瘤医学臨床研究中心 腫瘤生物学行為湖北省重点実験室 430071) ,  Li Xuanfei (武漢大学中南医院胃腸外科 武漢市腹膜癌臨床医学研究中心 湖北省腫瘤医学臨床研究中心 腫瘤生物学行為湖北省重点実験室 430071) ,  Feng Maohui (武漢大学中南医院胃腸外科 武漢市腹膜癌臨床医学研究中心 湖北省腫瘤医学臨床研究中心 腫瘤生物学行為湖北省重点実験室 430071) ,  Chen Zhifen (武漢大学中南医院消化内科 湖北省腸病医学臨床研究中心湖北省腸病重点実験室 430071)
資料名： Zhonghua Shiyan Waike Zazhi  (Zhonghua Shiyan Waike Zazhi)
巻： 37  号： 9  ページ： 1724-1727  発行年： 2020年 
JST資料番号： C2337A  ISSN： 1001-9030  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:バイオインフォマティクス方法による肝癌におけるキー遺伝子をスクリーニングし、肝癌の発生における潜在的な分子メカニズム及び肝癌の予後への影響を予測する。方法:遺伝子発現総合データベース(GEO)により3つの肝癌マイクロアレイデータセットをダウンロードし,差異分析を行い,その交集を行った。DAVIDデータベースを用いて、187個の差異発現遺伝子(DEGs)に対して機能濃縮分析を行った。DEGsの蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)ネットワーク及びスクリーニングキー遺伝子をSTRINGデータベース及びCytoscapeソフトウェアにより構築した。GEPIA、GSCALiteデータベースを用いて、キー遺伝子パス、発現検証及び予後分析を行った。結果:185の3つのデータセットの交差したDEGsが得られ、54のアップレギュレーション遺伝子と131のダウンレギュレーション遺伝子を含み、これらの遺伝子の生物機能は主に細胞分裂と細胞アポトーシスに富み、主に細胞周期、DNA複製、Rap1シグナル経路の調節に関与する。PPIネットワークにおいて,10のキー遺伝子をスクリーニングし,それぞれチミジンキナーゼ1(TK1),細胞分裂周期関連5(CDCA5),甲状腺ホルモン受容体相互作用体13(TRIP13),動原体蛋白質M(CENPM),およびCENPMであった。異常紡錘形微小管モジュール(ASPM),動原体蛋白質F(CENPF),マイクロ染色体維持複合体アセンブリー49(MCM4),ホリディン結合体認識蛋白質(HJURP),母体胚ロイシンジッパーキナーゼ(MELK)。非染色体構造は凝縮蛋白質I複合体Gサブユニット(NCAPG)を保持する。肝がんにおけるキー遺伝子は高発現しており、UBE2Cを除いて、肝がん患者の総生存率と低相関する。結論:肝がんの発生と予後不良と関係がある。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 凝縮 ,  相互作用 ,  データベース ,  ネットワーク ,  *遺伝子 ,  細胞分裂 ,  タンパク質 ,  複合体 ,  ソフトウェア ,  *予後 ,  遺伝子発現 ,  肝臓腫瘍 ,  ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション
準シソーラス用語： *バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 消化器の腫よう  (GH04000D) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

タイトルに関連する用語 (6件)： バイオインフォマティクス ,  HCC ,  予後 ,  鍵 ,  遺伝子 ,  スクリーニング