文献

J-GLOBAL ID：202102263277277103   整理番号：21A0898292

末梢血トランスクリプトームは結核治療の成功中の肺炎症のPET測定と相関する【JST・京大機械翻訳】

The Peripheral Blood Transcriptome Is Correlated With PET Measures of Lung Inflammation During Successful Tuberculosis Treatment

著者 (49件)： Odia Trust (1Division of Molecular Biology and Human Genetics, Department of Biomedical Sciences, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Odia Trust (2DSI-NRF Centre of Excellence for Biomedical Tuberculosis Research, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Odia Trust (3South African Medical Research Council Centre for Tuberculosis Research, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Odia Trust (4Bioinformatics Unit, South African Tuberculosis Bioinformatics Initiative, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Odia Trust (5Centre for Bioinformatics and Computational Biology, Stellenbosch University, Stellenbosch, South Africa) ,  Malherbe Stephanus T. (1Division of Molecular Biology and Human Genetics, Department of Biomedical Sciences, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Malherbe Stephanus T. (2DSI-NRF Centre of Excellence for Biomedical Tuberculosis Research, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Malherbe Stephanus T. (3South African Medical Research Council Centre for Tuberculosis Research, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Meier Stuart (1Division of Molecular Biology and Human Genetics, Department of Biomedical Sciences, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Meier Stuart (2DSI-NRF Centre of Excellence for Biomedical Tuberculosis Research, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Meier Stuart (3South African Medical Research Council Centre for Tuberculosis Research, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Meier Stuart (4Bioinformatics Unit, South African Tuberculosis Bioinformatics Initiative, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Meier Stuart (5Centre for Bioinformatics and Computational Biology, Stellenbosch University, Stellenbosch, South Africa) ,  Maasdorp Elizna (1Division of Molecular Biology and Human Genetics, Department of Biomedical Sciences, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Maasdorp Elizna (2DSI-NRF Centre of Excellence for Biomedical Tuberculosis Research, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Maasdorp Elizna (3South African Medical Research Council Centre for Tuberculosis Research, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Maasdorp Elizna (4Bioinformatics Unit, South African Tuberculosis Bioinformatics Initiative, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Maasdorp Elizna (5Centre for Bioinformatics and Computational Biology, Stellenbosch University, Stellenbosch, South Africa) ,  Kleynhans Leanie (1Division of Molecular Biology and Human Genetics, Department of Biomedical Sciences, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Kleynhans Leanie (2DSI-NRF Centre of Excellence for Biomedical Tuberculosis Research, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Kleynhans Leanie (3South African Medical Research Council Centre for Tuberculosis Research, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  du Plessis Nelita (1Division of Molecular Biology and Human Genetics, Department of Biomedical Sciences, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  du Plessis Nelita (2DSI-NRF Centre of Excellence for Biomedical Tuberculosis Research, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  du Plessis Nelita (3South African Medical Research Council Centre for Tuberculosis Research, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Loxton Andre G. (1Division of Molecular Biology and Human Genetics, Department of Biomedical Sciences, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Loxton Andre G. (2DSI-NRF Centre of Excellence for Biomedical Tuberculosis Research, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Loxton Andre G. (3South African Medical Research Council Centre for Tuberculosis Research, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Zak Daniel E. (6Center for Infectious Disease Research, Seattle, WA, United States) ,  Thompson Ethan (6Center for Infectious Disease Research, Seattle, WA, United States) ,  Duffy Fergal J. (6Center for Infectious Disease Research, Seattle, WA, United States) ,  Duffy Fergal J. (7Seattle Children’s Research Institute, Center for Global Infectious Disease Research, Seattle, WA, United States) ,  Kuivaniemi Helena (1Division of Molecular Biology and Human Genetics, Department of Biomedical Sciences, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Kuivaniemi Helena (2DSI-NRF Centre of Excellence for Biomedical Tuberculosis Research, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Kuivaniemi Helena (3South African Medical Research Council Centre for Tuberculosis Research, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Ronacher Katharina (1Division of Molecular Biology and Human Genetics, Department of Biomedical Sciences, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Ronacher Katharina (2DSI-NRF Centre of Excellence for Biomedical Tuberculosis Research, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Ronacher Katharina (3South African Medical Research Council Centre for Tuberculosis Research, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Ronacher Katharina (8Translational Research Institute, Mater Research Institute - The University of Queensland, Brisbane, QLD, Australia) ,  Winter Jill (9Catalysis Foundation for Health, San Ramon, CA, United States) ,  Walzl Gerhard (1Division of Molecular Biology and Human Genetics, Department of Biomedical Sciences, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Walzl Gerhard (2DSI-NRF Centre of Excellence for Biomedical Tuberculosis Research, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Walzl Gerhard (3South African Medical Research Council Centre for Tuberculosis Research, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Walzl Gerhard (4Bioinformatics Unit, South African Tuberculosis Bioinformatics Initiative, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Tromp Gerard (1Division of Molecular Biology and Human Genetics, Department of Biomedical Sciences, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Tromp Gerard (2DSI-NRF Centre of Excellence for Biomedical Tuberculosis Research, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Tromp Gerard (3South African Medical Research Council Centre for Tuberculosis Research, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Tromp Gerard (4Bioinformatics Unit, South African Tuberculosis Bioinformatics Initiative, Stellenbosch University, Cape Town, South Africa) ,  Tromp Gerard (5Centre for Bioinformatics and Computational Biology, Stellenbosch University, Stellenbosch, South Africa) ,  the Catalysis TB-Biomarker Consortium
資料名： Frontiers in Immunology (Web)  (Frontiers in Immunology (Web))
巻： 11  ページ： 596173  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7074A  ISSN： 1664-3224  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 肺結核(PTB)は肺肉芽腫,炎症および組織破壊を特徴とする。ここでは,肺炎症の全分解能の根底にある生物学的過程および経路を同定するために,陽電子放出断層撮影(PET)により測定した被験者内肺代謝活性と相関するため,被験者内末梢血遺伝子発現を用いた。次世代RNA配列決定および[18F]FDG PET-CTデータを用い,診断,第4週および第24週で,75人の治癒したPTB患者を,肺炎症の代用として[18F]FDG活性を用い,成功した。著者らの線形混合効果モデルは,各個体に対して,結果における[18F]FDGデータの直線の傾きと末梢血転写物発現データの勾配が相関し,すなわち,結果の傾きと説明変数が類似していることを示した。時間の関数として変化した10,295の遺伝子のうち,著者らは,その発現プロファイルが肺における[18F]FDG取り込みレベルの減少と相関する639の遺伝子を同定した。遺伝子濃縮過剰発現分析は,多数の生物学的プロセスが,血小板脱顆粒やインターフェロンγに対する応答のようなTBトランスクリプトミクスでよく知られる639の遺伝子において有意に濃縮され,従って著者らの新規アプローチを検証することを明らかにした。TB病理生物学と以前に関連していない他のものは,平滑筋収縮,ミトコンドリア機能および細胞死に関連する一連の経路,ならびに転写,翻訳および小胞形成を連結する一連の経路を含んだ。B細胞に関連した遺伝子のアップレギュレーションと血小板活性化に関連する遺伝子のダウンレギュレーションを観察した。254の転写因子結合部位が639の遺伝子プロモーターの間で濃縮されることを見出した。結論として,末梢血における10,295の遺伝子発現変化のうち,639の遺伝子のサブセットのみが肺の炎症と相関し,濃縮経路は末梢血で検出可能な肺炎症の分解能の生物学の記述を提供することを示した。驚くべきことに,PTB炎症の解消は平滑筋収縮と正相関し,ミトコンドリア遺伝子に関する我々の以前の観察を拡張することは,ミトコンドリアストレスの存在を示す。TBに対する宿主応答の治療標的発見と潜在的調節を可能にする経路分析に焦点を当てた。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  *炎症 ,  血小板 ,  *肺炎 ,  ミトコンドリア ,  遺伝子発現 ,  インターフェロンγ ,  PET【トモグラフィー】 ,  ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション ,  細胞死 ,  *末梢血 ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： 過剰発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： 遺伝子発現 ,  [18F]FDG PET-CT ,  RNAシークエンシング ,  混合効果モデル ,  経路解析 ,  転写因子結合部位 ,  結核 ,  治療反応

分類 (2件)： 腫ようの診断  (GE03020J) ,  放射線を利用した診断  (GC04020K)

引用文献 (102件)：

• World Health Organization. Global tuberculosis report 2019. (2019). p. 283.
• GadkowskiLBStoutJE. Cavitary pulmonary disease. Clin Microbiol Rev (2008) 21:305-33. doi: doi: 10.1128/cmr.00060-07
• Silva MirandaMBreimanAAllainSDeknuydtFAltareF. The tuberculous granuloma: an unsuccessful host defence mechanism providing a safety shelter for the bacteria? Clin Dev Immunol (2012) 2012:139127. doi: doi: 10.1155/2012/139127
• RyuYJ. Diagnosis of pulmonary tuberculosis: recent advances and diagnostic algorithms. Tuberc Respir Dis (Seoul) (2015) 78:64-71. doi: doi: 10.4046/trd.2015.78.2.64
• SkouraEZumlaABomanjiJ. Imaging in tuberculosis. Int J Infect Dis (2015) 32:87-93. doi: doi: 10.1016/j.ijid.2014.12.007

タイトルに関連する用語 (8件)： 末梢血 ,  トランスクリプトーム ,  結核 ,  治療 ,  成功 ,  肺炎症 ,  PET ,  相関