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J-GLOBAL ID：202102263888256096   整理番号：21A0044302

新規コロナウイルス鍵受容体ACE2遺伝子プロモーターのバイオインフォマティクス分析【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics Analysis of ACE2 Gene Promoter Region,SARS-CoV-2 Key Receptor

著者 (2件)： Wang Dao (中南大学湘雅二医院婦産科,中国 長沙 410011) ,  Liu Dan (中南大学湘雅二医院婦産科,中国 長沙 410011)
資料名： Hunan Shifan Daxue. Ziran Kexue Xuebao  (Hunan Shifan Daxue. Ziran Kexue Xuebao)
巻： 43  号： 5  ページ： 30-38  発行年： 2020年 
JST資料番号： T0633A  ISSN： 2096-5281  CODEN： HSDXEL  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 新規コロナウイルス(SARS-CoV-2)の鍵受容体ACE2遺伝子のプロモーター、CpG島、転写因子及びSNP部位を探求するため、GeneBankデータベースからヒトACE2ゲノム配列と染色体の定位情報を獲得した。また、多種のバイオインフォマティクスツールを利用して、その上流の5’端のプロモーター、転写因子結合部位、CpG島、SNPなどの予測と分析を行った。結果は,ヒトACE2遺伝子5’調節領域の2100bp領域がプロモーター配列を含むことを示した。Promoter2.0とNNPPデータベースは、その区間にそれぞれ1つ、2つのプロモーターが存在すると推測した。AliBaba2.1とPROMOデータベースから、そのプロモーターの保守領域に共通の転写因子結合部位が24個であることを予測した。Relativeprofilescorethresholdが95%であり、JASPARサイトが7つの潜在的転写因子EOMESの結合部位を予測する。さらに、EMBOSS、MethPrimer及びCpGfinderはいずれも1つのCpGアイランドが存在し、282558bpに位置し、大きさは277bpであった。SNPfunctionpredictionは7つのSNP部位も発見した。本研究はSARS-CoV-2のワクチン開発と新薬開発に新たな考え方を提供した。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  保全 ,  *遺伝子 ,  染色体 ,  *受容体 ,  ヒト ,  結合部位 ,  *プロモーター領域 ,  定位 ,  転写因子
準シソーラス用語： CpGアイランド ,  *バイオインフォマティクス ,  創薬 ,  ゲノム配列 ,  転写因子結合部位 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (7件)： コロナウイルス ,  鍵 ,  受容体 ,  ACE2 ,  遺伝子プロモーター ,  バイオインフォマティクス ,  分析