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J-GLOBAL ID：202102264086026164   整理番号：21A0534852

腫瘍型を正確に予測するための77,044ゲノムおよびトランスクリプトームプロファイルを用いた機械学習解析【JST・京大機械翻訳】

Machine learning analysis using 77,044 genomic and transcriptomic profiles to accurately predict tumor type

著者 (19件)： Abraham Jim (Caris Life Sciences, 4610 South 44th Place, Phoenix, AZ 85040, USA) ,  Abraham Jim (Arizona State University, Phoenix, AZ, USA) ,  Heimberger Amy B. (Department of Neurosurgery, The University of Texas MD Anderson Cancer Center, Houston, TX, USA) ,  Marshall John (Ruesch Center for The Cure of Gastrointestinal Cancers, Lombardi Comprehensive Cancer Center, Georgetown University Medical Center, Washington, DC, USA) ,  Heath Elisabeth (Wayne State University/Karmanos Cancer Institute, Detroit, MI, USA) ,  Drabick Joseph (Division of Hematology and Oncology, Penn State Hershey Cancer Institute, Hershey, PA, USA) ,  Helmstetter Anthony (Caris Life Sciences, 4610 South 44th Place, Phoenix, AZ 85040, USA) ,  Xiu Joanne (Caris Life Sciences, 4610 South 44th Place, Phoenix, AZ 85040, USA) ,  Magee Daniel (Caris Life Sciences, 4610 South 44th Place, Phoenix, AZ 85040, USA) ,  Stafford Phillip (Caris Life Sciences, 4610 South 44th Place, Phoenix, AZ 85040, USA) ,  Nabhan Chadi (Caris Life Sciences, 4610 South 44th Place, Phoenix, AZ 85040, USA) ,  Nabhan Chadi (Department of Clinical Pharmacy and Outcomes Sciences, University of South Carolina, Columbia, SC, USA) ,  Antani Sourabh (Caris Life Sciences, 4610 South 44th Place, Phoenix, AZ 85040, USA) ,  Johnston Curtis (Caris Life Sciences, 4610 South 44th Place, Phoenix, AZ 85040, USA) ,  Oberley Matthew (Caris Life Sciences, 4610 South 44th Place, Phoenix, AZ 85040, USA) ,  Korn Wolfgang Michael (Caris Life Sciences, 4610 South 44th Place, Phoenix, AZ 85040, USA) ,  Korn Wolfgang Michael (Division of Hematology and Oncology, University of California in San Francisco, San Francisco, CA, USA) ,  Spetzler David (Caris Life Sciences, 4610 South 44th Place, Phoenix, AZ 85040, USA) ,  Spetzler David (Arizona State University, Phoenix, AZ, USA)
資料名： Translational Oncology  (Translational Oncology)
巻： 14  号： 3  ページ： Null  発行年： 2021年 
JST資料番号： W2898A  ISSN： 1936-5233  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 標準的な組織学的診断試験が転移性癌の起源を決定できない場合,未知原発(CUP)の癌は患者の3~5%で生じる。典型的には,CUP診断は経験的に治療され,1年未満の全生存中央値で,非常に不良な転帰を有する。遺伝子発現プロファイリングのみは,起源の組織を同定するために使用されたが,同定がしばしば必要とされる転移部位において低い腫瘍割合を有するストラガルスを strす。ゲノム有病率スコアであるMI GPSaiは,癌の診断を助けるために,機械学習と結合したDNA配列決定と全トランスクリプトームデータを使用する。34,352症例および23,137症例からのゲノムおよびトランスクリプトームデータからゲノムデータで訓練されたアルゴリズムについて,19,555症例について検証した。MI GPSaiは,標識したデータセットの腫瘍型を,症例の93%で94%以上の精度で予測し,一方,癌の21の可能性のあるカテゴリーの間で剥離した。2番目に高い予測を考慮すると,精度は97%に増加した。さらに,MI GPSaiは,CUP症例の71.7%の予測を与えた。提出された診断とMI GPSai予測の間の不一致の病理学者評価は,時間の41.3%における診断の変化をもたらした。MI GPSaiはCUP症例の大部分で臨床的に意味のある情報を提供し,臨床ルーチンにおけるMI GPSaiの包含は診断忠実度を改善する。さらに,治療選択に必須の全てのゲノムマーカーをこのアッセイで評価し,単一試験内の患者の臨床的有用性を最大化する。Copyright 2021 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  *腫瘍 ,  *ゲノム ,  *機械学習 ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： 遺伝子発現プロファイリング ,  転移性腫瘍 ,  DNA配列 ,  ルーチン , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 腫ようの診断  (GE03020J) ,  消化器の腫よう  (GH04000D)

タイトルに関連する用語 (5件)： 腫瘍 ,  予測 ,  ゲノム ,  機械学習 ,  解析