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J-GLOBAL ID:202102265829868169   整理番号:21A3083257

スイカにおいて暗い緑の縞葉を支配するClGS遺伝子の微細マッピング【JST・京大機械翻訳】

Fine mapping a ClGS gene controlling dark-green stripe rind in watermelon
著者 (12件):
資料名:
巻: 291  ページ: Null  発行年: 2022年 
JST資料番号: W1940A  ISSN: 0304-4238  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: オランダ (NLD)  言語: 英語 (EN)
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ストライプパターンはスイカの重要な農業形質であり,果実リンドパターンと消費者選択を決定する。しかし,これらの形質を制御する遺伝子は,まだほとんど知られていない。本研究では,暗緑色ストライプ近交系WT2と網状ストライプ近交系WM204を遺伝子解析に用い,暗緑色ストライプが単一優性遺伝子ClGSによって制御されることを明らかにした。バルク分離分析(BSA)により,ClGSは,WT2とWM204の間の交雑から発達したF_2植物を用いてスイカ染色体6上に主にマッピングされた。次世代配列決定支援マーカー発見と1206F_2植物から成る大きなマッピング集団を用いて,ClGS遺伝子の微細マッピングを行い,さらに107kb候補領域へマッピングした。この候補領域には11の遺伝子があり,それらのうちの10は2つの親系統間の1-DAP果実外皮で差次的に発現した。さらに,64のSNPと3つのIndelsが,これらの候補遺伝子のCDS領域で検出された。ClGSの候補遺伝子をさらに確認するために,著者らはin silicoバルク分離分析により74の再配列天然スイカ系統間の配列変異を調べた。3-bp挿入は,Cla019205の8番目のエキソンに位置するすべての非暗緑色ストライプスイカアクセッショングループで同定された。挿入を持つIndelマーカーはF_2マッピング集団における表現型と共分離を示し,電気泳動解析により他の25スイカ系統と完全に一致した。これらの証拠は,Cla019205がスイカの暗緑色ストライプを制御する候補遺伝子であることを示唆する。本研究の結果は,スイカにおけるストライプ形成とマーカー支援選択のより良い理解に役立つであろう。Copyright 2021 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (3件):
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果樹  ,  集団遺伝学  ,  遺伝子の構造と化学 
タイトルに関連する用語 (5件):
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