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J-GLOBAL ID：202102266222422448   整理番号：21A0107109

口腔扁平上皮癌患者の予後関連遺伝子マーカーのバイオインフォマティクス分析【JST・京大機械翻訳】

Identification of potential genetic markers in prognosis of oral squamous cell carcinoma patients by bioinfor-matic analysis

著者 (3件)： Wang Liye (山西医科大学口腔医学院・口腔医院,山西 太原 030001) ,  Gao Ying (山西医科大学口腔医学院・口腔医院,山西 太原 030001;山西医科大学第一医院口腔科,山西 太原 030001) ,  Tian Chun (山西医科大学第一医院口腔科,山西 太原 030001)
資料名： Kouqiangjibing Fangzhi  (Kouqiangjibing Fangzhi)
巻： 29  号： 1  ページ： 27-33  発行年： 2021年 
JST資料番号： C4248A  ISSN： 2096-1456  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】口腔扁平上皮癌と隣接組織の間の差次的発現遺伝子を生物情報分析によってスクリーニングし,潜在的バイオマーカーを同定する。方法:遺伝子発現データベース(GeneExpressionOmnibus,GEO)から、口腔扁平上皮癌関連チップデータセットGSE23558、GSE37991、GSE30784をダウンロードした。GEOオンライン分析ツールを用い、差次的発現遺伝子を選別し、遺伝子オントロジー、京都遺伝子とゲノム百科全書分析を行った。STRINGオンラインデータベースを利用して、差異遺伝子タンパク質相互作用(protein-proteininteraction、PPI)ネットワークを構築し、Cytoscapeによりキー遺伝子を選別した。さらに、KaplanMeierオンラインソフトを用いて、差次的発現遺伝子に対して予後分析を行い、GEPIA(http://gepia.cancer-pku.cn/)を用いてその発現状況を検証した。結果:合計212個の差次的発現遺伝子を選別し、さらに16個のコア遺伝子を発見し、そのうち、予後に関連するコア遺伝子も含めた。オーロラキナーゼA(aurorakinaseA,AURKA),オーロラキナーゼB(aurorakinaseB,AURKB)。アポトーシス抑制因子5(baculoviralIAPrepeatcontaing5、BIRC5)、細胞分裂周期タンパク質6(celldivisioncycle6,CDC6)。E2F転写因子7(E2Ftranscriptionfactor7,E2F7);ユビキチン様はPHDとループフィンガードメインタンパク質1(ubiquitin-likewithPHDandringfingerdomains1,UHRF1)を含む。これらのキー遺伝子は,隣接組織と比較して,口腔扁平上皮癌組織において,高い発現を示し,そして,患者の生存期間は,より短かった(P<0.05)。結論:AURKA、AURKB、BIRC5、CDC6、E2F7とUHRF1は口腔扁平上皮癌患者の予後の潜在的なマーカーである。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ネットワーク ,  *遺伝子 ,  タンパク質 ,  ゲノム ,  細胞周期 ,  *予後 ,  京都府 ,  ユビキチン ,  バイオマーカー
準シソーラス用語： *遺伝子マーカ ,  *バイオインフォマティクス ,  蛋白質間相互作用 ,  遺伝子オントロジー ,  差次的遺伝子発現 ,  遺伝子発現データ , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  歯と口腔の腫よう  (GT04000N)

タイトルに関連する用語 (5件)： 口腔扁平上皮癌 ,  患者の予後 ,  遺伝子マーカー ,  バイオインフォマティクス ,  分析