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J-GLOBAL ID：202102267971764714   整理番号：21A0720069

がんにおける変異は,プロテオームレベルにおけるアルギニンの正味損失の増加においてシステイン,ヒスチジンおよびトリプトファンの利得を引き起こす【JST・京大機械翻訳】

Mutations in Cancer Cause Gain of Cysteine, Histidine, and Tryptophan at the Expense of a Net Loss of Arginine on the Proteome Level

著者 (6件)： Tsuber Viktoriia (Science for Life Laboratory, Division of Translational Medicine and Chemical Biology, Department of Medical Biochemistry and Biophysics, Karolinska Institutet, Stockholm, S171 21, Sweden) ,  Tsuber Viktoriia (Department of Medical, Bioorganic and Biological Chemistry, Ukrainian Medical Stomatological Academy, Poltava, 36011, Ukraine) ,  Kadamov Yunus (Department of Medical, Bioorganic and Biological Chemistry, Ukrainian Medical Stomatological Academy, Poltava, 36011, Ukraine) ,  Brautigam Lars (Science for Life Laboratory, Division of Translational Medicine and Chemical Biology, Department of Medical Biochemistry and Biophysics, Karolinska Institutet, Stockholm, S171 21, Sweden) ,  Berglund Ulrika Warpman (Science for Life Laboratory, Division of Translational Medicine and Chemical Biology, Department of Medical Biochemistry and Biophysics, Karolinska Institutet, Stockholm, S171 21, Sweden) ,  Helleday Thomas (Science for Life Laboratory, Division of Translational Medicine and Chemical Biology, Department of Medical Biochemistry and Biophysics, Karolinska Institutet, Stockholm, S171 21, Sweden)
資料名： Biomolecules (Web)  (Biomolecules (Web))
巻： 7  号： 3  ページ： 49  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7148A  ISSN： 2218-273X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 体細胞変異の蓄積は,正常細胞の癌への移行に重要である。変異は蛋白質の性質を変化させるアミノ酸置換を引き起こす。しかし,細胞プロテオームの組成とそれに応じた化学的性質が癌における突然変異負荷増加の結果としてどのように変化するかについては研究されていない。ここでは,782の癌細胞系のヌクレオチドとアミノ酸の変化に関する情報を含む,癌細胞系統Encycediaからの約2000の蛋白質コード遺伝子における変異により生じるアミノ酸置換に関するデータを分析し,circa 18000腫瘍試料中の癌(COSMIC;v78)のSomatic変異のCatalogueにおける蛋白質の同じセットに対するアミノ酸置換に関する情報による分析を検証した。分析したプロテオームサブセットにおける非同義単一ヌクレオチド置換が最終的にアルギニンの正味損失を犠牲にしてシステイン,ヒスチジン及びトリプトファンの正味利得をもたらすことを見出した。アルギニンの異常な喪失は,p53のような顕著な腫瘍抑制蛋白質の機能におけるアルギニンの重要性と同様に,そのコドンの組成にある程度起因するかもしれない。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アミノ酸 ,  遺伝子 ,  コドン ,  腫瘍 ,  腫瘍細胞 ,  突然変異 ,  ヌクレオチド ,  *利得 ,  p53タンパク質 ,  *プロテオーム ,  窒素複素環化合物 ,  第一アミン ,  脂肪族アミン ,  チオール ,  脂肪族カルボン酸 ,  含硫アミノ酸 ,  芳香族縮合化合物
準シソーラス用語： アミノ酸置換 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 癌における突然変異 ,  アミノ酸置換 ,  体細胞進化 ,  アルギニン

分類 (1件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

物質索引 (4件)： ヒスチジン ,  システイン ,  トリプトファン ,  アルギニン

引用文献 (20件)：

• Lawrence, M.S.; Stojanov, P.; Polak, P.; Kryukov, G.V.; Cibulskis, K.; Sivachenko, A.; Carter, S.L.; Stewart, C.; Mermel, C.H.; Roberts, S.A.; et al. Mutational heterogeneity in cancer and the search for new cancer genes. Nature 2014, 499, 214-218.
• Alexandrov, L.B.; Nik-Zainal, S.; Wedge, D.C.; Aparicio, S.A.; Behjati, S.; Biankin, A.V.; Bignell, G.R.; Bolli, N.; Borg, A.; Børresen-Dale, A.L.; et al. Signatures of mutational processes in human cancer. Nature 2013, 500, 415-421.
• Tan, H.; Bao, J.; Zhou, X. Genome-wide mutational spectra analysis reveals significant cancer-specific heterogeneity. Sci. Rep. 2015, 5, 12566.
• Barretina, J.; Caponigro, G.; Stransky, N.; Venkatesan, K.; Margolin, A.A.; Kim, S.; Wilson, C.J.; Lehár, J.; Kryukov, G.V.; Sonkin, D.; et al. The Cancer Cell Line Encyclopedia enables predictive modeling of anticancer drug sensitivity. Nature 2012, 483, 603-607.
• Forbes, S.A.; Beare, D.; Gunasekaran, P.; Leung, K.; Bindal, N.; Boutselakis, H.; Ding, M.; Bamford, S.; Cole, C.; Ward, S.; et al. COSMIC: Exploring the world’s knowledge of somatic mutations in human cancer. Nucleic Acids Res. 2015, 43, D805-D811.

タイトルに関連する用語 (8件)： がん ,  変異 ,  アルギニン ,  損失 ,  システイン ,  ヒスチジン ,  トリプトファン ,  利得