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J-GLOBAL ID：202102268111404256   整理番号：21A2113019

構造研究のためのATP類似体:DnaBヘリカーゼとABC輸送体の事例研究【JST・京大機械翻訳】

ATP Analogues for Structural Investigations: Case Studies of a DnaB Helicase and an ABC Transporter

著者 (11件)： Lacabanne Denis (Laboratory of Physical Chemistry, ETH Zurich, 8093 Zurich, Switzerland) ,  Lacabanne Denis (Medical Research Council Mitochondrial Biology Unit University of Cambridge, Cambridge Biomedical Campus, Keith Peters Building, Hills Road, Cambridge CB2 0XY, UK) ,  Wiegand Thomas (Laboratory of Physical Chemistry, ETH Zurich, 8093 Zurich, Switzerland) ,  Wili Nino (Laboratory of Physical Chemistry, ETH Zurich, 8093 Zurich, Switzerland) ,  Kozlova Maria I. (Department of Physics, Osnabrueck University, 49069 Osnabrueck, Germany) ,  Cadalbert Riccardo (Laboratory of Physical Chemistry, ETH Zurich, 8093 Zurich, Switzerland) ,  Klose Daniel (Laboratory of Physical Chemistry, ETH Zurich, 8093 Zurich, Switzerland) ,  Mulkidjanian Armen Y. (Department of Physics, Osnabrueck University, 49069 Osnabrueck, Germany) ,  Mulkidjanian Armen Y. (School of Bioengineering and Bioinformatics and Belozersky Institute of Physico-Chemical Biology, Lomonosov Moscow State University, 119234 Moscow, Russia) ,  Meier Beat H. (Laboratory of Physical Chemistry, ETH Zurich, 8093 Zurich, Switzerland) ,  Bockmann Anja (Molecular Microbiology and Structural Biochemistry UMR 5086 CNRS/Universite de Lyon, Labex Ecofect, 69367 Lyon, France)
資料名： Molecules (Web)  (Molecules (Web))
巻： 25  号： 22  ページ： 5268  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7014A  ISSN： 1420-3049  CODEN： MOLEFW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヌクレオシド三リン酸(NTP)は,様々な細胞系における化学エネルギー源として使用される。NTP加水分解反応座標に沿った構造スナップショットは,蛋白質に安定な非加水分解性アデノシン三リン酸(ATP)-類似体を加えることにより典型的に得られ,生理学的に適切な状態,例えば,前加水分解,転移および後加水分解状態のような状態を模倣する状態を停止する。ここでは,異なる類似体に対して観測された最良の使用と予想外の落とし穴に関する2つの異なるATPアーゼについて学んだ教訓を示した。検討した蛋白質は,Helicobacter pylori由来の細菌DnaBヘリカーゼ及びBacillus subtilis由来の多剤ATP結合カセット(ABC)輸送体BmrAであり,両者はPループ折畳みNTPアーゼの同一分裂に属する。ATP-模倣体の結合をプローブし,蛋白質または結合分子の炭素-13,リン-31,およびバナジウム-51固体核磁気共鳴(NMR)スペクトルを示す磁気共鳴戦略をレビューし,ATP模倣体の結合における立体配座および動的変化を解明した。Electron常磁性共鳴(EPR),特にWバンド電子-電子二重共鳴(ELDOR)検出NMRは,バナジウム酸塩の結合を評価するために相補的な利用である。DnaBヘリカーゼおよびABC輸送体BmrAに対する異なる加水分解状態を最もよく模倣する類似体を検討した。これらは他のNTPアーゼの構造的および機能的研究にも関連する可能性がある。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： NMR【磁気共鳴】 ,  立体配座 ,  加水分解 ,  ATPアーゼ ,  ヌクレオシド ,  常磁性共鳴 ,  スペクトル ,  折畳み ,  バナジウム酸塩 ,  炭素13 ,  枯草菌 ,  *事例研究 ,  Helicobacter pylori ,  *ABC輸送体
準シソーラス用語： *輸送体 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 固体NMR ,  ELDOR検出NMR ,  ATP加水分解 ,  ATPアナログ ,  DnaBヘリカーゼ ,  ABCトランスポーター

分類 (2件)： 抗腫よう薬の基礎研究  (GW16010A) ,  細胞膜の輸送  (EF04020R)

引用文献 (136件)：

• Manna, R.N.; Dutta, M.; Jana, B. Mechanistic study of the ATP hydrolysis reaction in dynein motor protein. Phys. Chem. Chem. Phys. 2020, 22, 1534-1542.
• Mächtel, R.; Narducci, A.; Griffith, D.A.; Cordes, T.; Orelle, C. An integrated transport mechanism of the maltose ABC importer. Res. Microbiol. 2019, 170, 321-337.
• Prieß, M.; Göddeke, H.; Groenhof, G.; Schäfer, L.V. Molecular mechanism of ATP hydrolysis in an ABC transporter. ACS Central Sci. 2018, 4, 1334-1343.
• Brosh, R.M.; Matson, S.W. History of DNA Helicases. Genes 2020, 11, 255.
• Ma, W.; Schulten, K. Mechanism of substrate translocation by a ring-shaped ATPase motor at millisecond resolution. J. Am. Chem. Soc. 2015, 137, 3031-3040.

タイトルに関連する用語 (5件)： 研究 ,  ATP ,  類似体 ,  DnaBヘリカーゼ ,  ABC輸送体