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J-GLOBAL ID：202102268361167488   整理番号：21A1553425

トランスクリプトミクスに基づくアングルス牛と中国シメンタール牛脂肪沈着関連差異発現遺伝子研究【JST・京大機械翻訳】

Study on Differentially Expressed Genes Related to Fat Deposition Gene in Angus and Chinese Simmental Cattle Base on Transcriptome

著者 (5件)： Han Xinrong (内蒙古民族大学動物科技学院,内蒙古通遼028042) ,  Wu Huiguang (内蒙古民族大学動物科技学院,内蒙古通遼028042;揚州大学獣医学院,江蘇揚州225009) ,  Wu Jianghong (内蒙古民族大学動物科技学院,内蒙古通遼028042) ,  Wang Guofu (内蒙古民族大学動物科技学院,内蒙古通遼028042;内蒙古民族大学黄牛遺伝繁育研究所,内蒙古通遼028000) ,  Gao Shuxin (内蒙古民族大学動物科技学院,内蒙古通遼028042;内蒙古民族大学黄牛遺伝繁育研究所,内蒙古通遼028000)
資料名： Huabei Nongxuebao  (Huabei Nongxuebao)
巻： 35  号： 6  ページ： 208-216  発行年： 2020年 
JST資料番号： C2462A  ISSN： 1000-7091  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： アングラス牛と中国西門塔爾牛の脂肪沈着に関連する差異発現遺伝子を明らかにするために、その背脂肪組織を研究対象とし、総RNAを抽出し、シークエンシングライブラリーを構築し、華大BGISEQ-500を用いてシークエンシングを行い、バイオインフォマティクス分析で差次的発現遺伝子を選別した。差次的発現遺伝子に対してGO機能濃縮とKEGG経路分析を行い、最後に、蛍光定量qPCR(qRT-PCR)を用いて、トランスクリプトームシークエンシングデータの正確性を検証した。中国西門塔爾牛のアングルス牛のトランスクリプトームデータに対する結果は、1296個の差次的発現遺伝子があり、そのうち、アップレギュレーション遺伝子は802個、ダウンレギュレート遺伝子は494個であった。トランスクリプトームデータに対するGO機能濃縮分析結果により、生物過程、分子機能、細胞成分がそれぞれ2205、890、3149の項目に濃縮され、KEGG経路分析の結果、差異遺伝子は6つの分枝に著しく濃縮されていることが明らかになった。脂肪沈着に関連するcAMP経路を分析し、脂肪沈着に関連する差異発現遺伝子の3つを選別し、それぞれDKKL1、ACBとPTGS2であり、qRT-PCRにより遺伝子DKKL1、ACBとPTGS2に対して検証を行った。脂肪沈着の候補遺伝子である。中国西門塔爾牛とアングルス牛の背脂肪組織をシークエンシングして得られた大量の差次的発現遺伝子により、後続の脂肪沈着関連遺伝子のスクリーニングに基礎を築いた。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 蛍光 ,  *遺伝子 ,  塔状構造物 ,  細胞構成体 ,  アップレギュレーション ,  トランスクリプトーム ,  アデニンヌクレオチド ,  リボヌクレオチド ,  環状ヌクレオチド
準シソーラス用語： 配列解析 ,  バイオインフォマティクス ,  *トランスクリプトーム解析 ,  背脂肪 ,  候補遺伝子 ,  KEGG ,  差次的遺伝子発現 ,  *脂肪沈着 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  牛  (FD02020Y)

物質索引 (1件)： cAMP

タイトルに関連する用語 (8件)： トランスクリプトミクス ,  牛 ,  中国 ,  脂肪沈着 ,  差異 ,  発現 ,  遺伝子 ,  研究