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J-GLOBAL ID：202102268383900303   整理番号：21A0022963

トランスクリプトームおよびメタボロミクスに基づく統合分析はin vivoRadix Paeoniae Alba投与の潜在的な薬理学的効果および機能的パターンを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Transcriptomics- and metabolomics-based integration analyses revealed the potential pharmacological effects and functional pattern of in vivo Radix Paeoniae Alba administration

著者 (9件)： Wang Sining (Department of Pathology, School of Basic Medical Sciences, Shanghai University of Traditional Chinese Medicine, Pudong, China) ,  Chen Huihua (Department of Pathology, School of Basic Medical Sciences, Shanghai University of Traditional Chinese Medicine, Pudong, China) ,  Zheng Yufan (Department of Physiology and Pathophysiology, School of Basic Medical Sciences, Fudan University, Xuhui, China) ,  Li Zhenyu (College of Information and Computer Engineering, Northeast Forestry University, Harbin, China) ,  Cui Baiping (Department of Physiology and Pathophysiology, School of Basic Medical Sciences, Fudan University, Xuhui, China) ,  Zhao Pei (Public Laboratory Platform, School of Basic Medical Science, Shanghai University of Traditional Chinese Medicine, Shanghai, China) ,  Zheng Jiali (Department of Pathology, School of Basic Medical Sciences, Shanghai University of Traditional Chinese Medicine, Pudong, China) ,  Lu Rong (Department of Pathology, School of Basic Medical Sciences, Shanghai University of Traditional Chinese Medicine, Pudong, China) ,  Sun Ning (Department of Physiology and Pathophysiology, School of Basic Medical Sciences, Fudan University, Xuhui, China)
資料名： Chinese Medicine (Web)  (Chinese Medicine (Web))
巻： 15  号： 1  ページ： 1-13  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7464A  ISSN： 1749-8546  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Radix Paeoniae Alba(RPA)および他の天然薬剤は,顕著な治療効果を有し,漢方薬(TCM)で広く使用されている。しかしながら,それらの多成分およびマルチターゲット特性のため,in vivoでのそれらの天然薬剤の詳細な薬理学的機構を研究することは困難である。したがって,生物に及ぼすそれらの実際の影響はまだ不明である。RPAを研究対象として選択し,本研究では,マウスにおけるRPA投与後のトランスクリプトミクスに基づくRNA-seqおよびメタボロームに基づくNMRスペクトルの統合および解釈により,in vivoでのRPAの複雑な機構を検討した。種々の次元縮小アルゴリズムと分類器モデルを高スループットデータの処理に適用した。血清代謝産物の中で,PCとグルコースの含有量は有意に増加したが,種々のアミノ酸,脂質とそれらの代謝産物の含有量はRPA投与後のマウスで有意に減少した。遺伝子オントロジー(GO)と遺伝子およびゲノム(KEGG)データベースに基づいて,異なる分析は,肝臓がRPAが有意な効果を発揮する部位であり,TCMにおける理論における「メリジン指向性」の合理性を確認したことを示した。加えて,RPAは,1-アシル-sn-グリセロール-3-ホスファートアシルトランスフェラーゼ(Agpat),ホスファチジン酸ホスファターゼ(Lpin),リン脂質ホスファターゼ(Plpp)および内皮リパーゼ(Lipg)のようなグリセロ脂質代謝経路の酵素をコードする遺伝子の調節により脂質代謝において役割を果たした。また,RPAはコカイン中毒経路のような脳におけるいくつかの物質中毒経路を制御し,関連する標的はGEOデータベースにおける病理学的モデルから配列決定データに基づいて予測された。RPAの全体的有効パターンを,自己設計モデルを通して多次元レーダマップで直観的に提示し,肝臓と脳が主に従来の経線指向性理論と比較してRPAによって調節されていることを見出した。全体として,本研究は,RPAの潜在的適用を拡大し,さらに機構研究のための可能な標的と方向を提供し,一方,それはまた,TCMの全体有効パターンを表す多次元評価モデルを確立した。将来,ハイスループットデータセットに基づくそのような研究は,TCMの理論を解釈するために使用可能であり,TCM研究者と医師のための貴重な研究モデルと臨床薬物療法参照を提供する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  データベース ,  酵素 ,  アミノ酸 ,  遺伝子 ,  血清 ,  代謝産物 ,  代謝経路 ,  高次元 ,  漢方製剤 ,  *トランスクリプトーム ,  ヘキソース ,  アルドース
準シソーラス用語： *メタボロミクス ,  メタボローム ,  RNA-seq , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 生物情報学 ,  トランスクリプトーム ,  メタボロミクス ,  Radix Paeoniae Alba ,  漢方薬

分類 (3件)： 生薬一般  (GX06010Y) ,  有機化合物の各種分析  (CC08034J) ,  有機化合物のクロマトグラフィー,電気泳動分析  (CC04034H)

物質索引 (1件)： グルコース

引用文献 (34件)：

• Neuroscience; Phosphatidylinositol 3 kinase/protein kinase B is responsible for the protection of paeoniflorin upon H(2)O(2)-induced neural progenitor cell injury; YM Wu, R Jin, L Yang, J Zhang, Q Yang, YY Guo; 240; 2013; 54-62; 10.1016/j.neuroscience.2013.02.037; citation_id=CR1
• Neuroscience; Paeoniflorin inhibition of 6-hydroxydopamine-induced apoptosis in PC12 cells via suppressing reactive oxygen species-mediated PKCdelta/NF-kappaB pathway; H Dong, R Li, C Yu, T Xu, X Zhang, M Dong; 285; 2015; 70-80; 10.1016/j.neuroscience.2014.11.008; citation_id=CR2
• Cell Physiol Biochem; Paeoniflorin attenuates inflammatory pain by inhibiting microglial activation and Akt-NF-kappaB signaling in the central nervous system; B Hu, G Xu, X Zhang, L Xu, H Zhou, Z Ma; 47; 2; 2018; 842-850; 10.1159/000490076; citation_id=CR3
• MOL MED REP.; Protective effect of paeoniflorin on inflammation and apoptosis in the cerebral cortex of a transgenic mouse model of Alzheimer’s disease; X Gu, Z Cai, M Cai, K Liu, D Liu, Q Zhang; 13; 3; 2016; 2247-2252; 10.3892/mmr.2016.4805; citation_id=CR4
• Am J Chin Med; The anti-inflammatory effect of paeoniflorin on cerebral infarction induced by ischemia-reperfusion injury in Sprague-Dawley rats; NY Tang, CH Liu, CT Hsieh, CL Hsieh; 38; 1; 2010; 51-64; 10.1142/s0192415x10007786; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (6件)： トランスクリプトーム ,  メタボロミクス ,  統合 ,  分析 ,  投与 ,  薬理学