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J-GLOBAL ID：202102268978174142   整理番号：21A0826794

RTCAシステムとHough変換ベースアルゴリズムの組合せによる動的セル形態特性の推定【JST・京大機械翻訳】

Estimating Dynamic Cellular Morphological Properties via the Combination of the RTCA System and a Hough-Transform-Based Algorithm

著者 (5件)： Zhang Lejun (Department of Pharmacology, School of Basic Medical Sciences, Zhejiang University, Hangzhou, Zhejiang 310058, China) ,  Ye Yang (College of Environmental and Resource Sciences, Zhejiang University, Hangzhou, Zhejiang 310058, China) ,  Dhar Rana (Department of Pharmacology, School of Basic Medical Sciences, Zhejiang University, Hangzhou, Zhejiang 310058, China) ,  Deng Jinsong (College of Environmental and Resource Sciences, Zhejiang University, Hangzhou, Zhejiang 310058, China) ,  Tang Huifang (Department of Pharmacology, School of Basic Medical Sciences, Zhejiang University, Hangzhou, Zhejiang 310058, China)
資料名： Cells (Web)  (Cells (Web))
巻： 8  号： 10  ページ： 1287  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7155A  ISSN： 2073-4409  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： xCELLigenceリアルタイム細胞分析(RTCA)システムは,細胞増殖,移動,細胞毒性,接着およびリモデリングを検出する可能性を有する。RTCAシステムは細胞運命のリアルタイムモニタリングのための非侵襲的で効率的なツールとして広く認識されているが,長さや強度のような詳細な細胞形態学的パラメータを記述することはできない。形質転換成長因子ベータ(TGF-)は上皮間葉転換(EMT)を誘導し,細胞形態で有意な変化を生じるので,本研究ではA549上皮細胞を治療するためにTGFを用いた。刺激剤としてリポ多糖類(LPS)およびタバコ煙抽出物(CSE)と比較した。形態学的細胞変化を定量化する効率的なアルゴリズムを開発した。このアルゴリズムは,画像前処理,Hough変換(HT),および後処理の3つの主要部分から成る。RTCAシステムを用いてA549細胞指数を記録した。ウェスタンブロットを用いてEMTを確認した。RTCAシステムは,異なる刺激装置が異なる細胞指数曲線を生成することを示した。アルゴリズムは細胞の検出線の長さを決定し,結果はTGF群のRTCA系と類似していた。ウェスタンブロット結果は,TGFがEMTマーカーを変化したが,他の刺激因子は変化しなかったことを示した。オプティックスベースのコンピュータビジョン技術は,結果間の良好な対応に基づくRTCAシステムに必要な情報を供給できる。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *アルゴリズム ,  リポ多糖類 ,  細胞増殖 ,  細胞毒性 ,  コンピュータビジョン ,  上皮細胞 ,  TGFβ ,  モルフォロジー ,  A549細胞
準シソーラス用語： 細胞形態 ,  リモデリング ,  非侵襲 ,  細胞運命 ,  上皮間葉転換 ,  リアルタイムモニタリング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： xCELLigenceリアルタイムセル解析 ,  細胞形態 ,  TGF-β ,  上皮間葉転換 ,  Hough変換

分類 (1件)： 細胞生理一般  (EF02010S)

引用文献 (38件)：

• Hilsenbeck, O.; Schwarzfischer, M.; Skylaki, S.; Schauberger, B.; Hoppe, P.S.; Loeffler, D.; Kokkaliaris, K.D.; Hastreiter, S.; Skylaki, E.; Filipczyk, A.; et al. Software tools for single-cell tracking and quantification of cellular and molecular properties. Nat. Biotechnol. 2016, 34, 703-706.
• Xie, L.; Law, B.K.; Chytil, A.M.; Brown, K.A.; Aakre, M.E.; Moses, H.L. Activation of the Erk pathway is required for TGF-β1-induced EMT in vitro. Neoplasia 2004, 6, 603-610.
• Cardner, M.; Meyer-schaller, N.; Christofori, G.; Beerenwinkel, N. Inferring signalling dynamics by integrating interventional with observational data. Bioinformatics 2019, 35, i577-i585.
• Hay, E.D. An overview of epithelio-mesenchymal transformation. Cells Tissues Organs 1995, 154, 8-20.
• Nieto, M.A. The Ins and Outs of the Epithelial to Mesenchymal Transition in Health and Disease. Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 2011, 27, 347-376.

タイトルに関連する用語 (7件)： RTCA ,  Hough変換 ,  アルゴリズム ,  組合せ ,  セル ,  形態特性 ,  推定