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J-GLOBAL ID：202102270546913291   整理番号：21A1151220

ダイズにおけるSLAF-Sequeningアプローチを用いた分子支援特異性と均一性試験【JST・京大機械翻訳】

Molecular-Assisted Distinctness and Uniformity Testing Using SLAF-Sequencing Approach in Soybean

著者 (6件)： Zhang Shengrui (The National Engineering Laboratory for Crop Molecular Breeding, MARA Key Laboratory of Soybean Biology (Beijing), Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, 12 Zhongguancun South Street, Beijing 100081, China) ,  Li Bin (The National Engineering Laboratory for Crop Molecular Breeding, MARA Key Laboratory of Soybean Biology (Beijing), Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, 12 Zhongguancun South Street, Beijing 100081, China) ,  Chen Ying (The National Engineering Laboratory for Crop Molecular Breeding, MARA Key Laboratory of Soybean Biology (Beijing), Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, 12 Zhongguancun South Street, Beijing 100081, China) ,  Shaibu Abdulwahab S. (The National Engineering Laboratory for Crop Molecular Breeding, MARA Key Laboratory of Soybean Biology (Beijing), Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, 12 Zhongguancun South Street, Beijing 100081, China) ,  Zheng Hongkun (Biomarker Technologies Corporation, Beijing 101300, China) ,  Sun Junming (The National Engineering Laboratory for Crop Molecular Breeding, MARA Key Laboratory of Soybean Biology (Beijing), Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, 12 Zhongguancun South Street, Beijing 100081, China)
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 11  号： 2  ページ： 175  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 形態学的記述子による栽培品種の特異性,均一性および安定性(DUS)試験は,ダイズ育種の重要で強制的部分である。分子マーカーは,通常,栽培品種の同定と純度評価のための遺伝的特徴を記述するのに,より効果的で正確である。本研究では,特異的遺伝子座増幅断片配列決定(SLAF-seq)技術および単純配列反復(SSR)マーカーにより開発された単一ヌクレオチド多型(SNP)マーカーを用いて,5つのダイズ品種の識別性と均一性を評価した。SLAF-seqとSSR法の両方からの系統樹と主成分分析(PCA)は,栽培品種Zhonghuang18,Zhonghuang68とZhonghuang35の間の明確な区別を示したが,一方,栽培品種Zhonghuang13とHedou13の間には明白な区別は全く観察されなかった。SLAF-seq法を用いて,5つのダイズ品種に対するホモ接合遺伝子座の割合を決定した。各個々の植物のヘテロ接合性は,品種純度の評価のために推定され,5つのダイズ栽培品種の純度レベルは91.89%から93.96%の範囲であった。識別試験のためのSLAF-seqアプローチの適用性をさらに検証するために,異なる起源の150のダイズ品種のSNP情報を用いた。品種も明らかに識別された。まとめると,SLAF-seqはダイズ品種の識別性と均一性の評価において正確で信頼できる方法として使用できる。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝 ,  純度 ,  *ダイズ ,  系統樹 ,  適応性 ,  育種 ,  品種 ,  指紋 ,  主成分分析 ,  栽培品種 ,  モルフォロジー ,  一塩基多型
準シソーラス用語： 分子マーカー ,  ヘテロ接合性 ,  特異性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ダイズ(Glycine max(L.)Merrill) ,  SSR ,  SNP ,  SLAF-seq ,  指紋 ,  品種同定

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  豆類  (FC03035U)

引用文献 (48件)：

• Sohn, H.B.; Kim, S.J.; Hwang, T.Y.; Park, H.M.; Lee, Y.Y.; Markkandan, K.; Lee, D.; Lee, S.; Hong, S.Y.; Song, Y.H.; et al. Barcode system for genetic identification of soybean [Glycine max (L.) Merrill] cultivars using inDel markers specific to dense variation blocks. Front. Plant Sci. 2017, 8, 520-531.
• Song, Q.; Quigley, C.; Nelson, R.; Carter, T.; Boerma, H.; Strachan, J.; Cregan, P. A selected set of trinucleotide simple sequence repeat markers for soybean cultivar identification. Plant Var. Seeds 1999, 12, 207-220.
• Bonow, S.; Von Pinho, E.V.; Vieira, M.G.; Vosman, B. Microsatellite markers in and around rice genes: applications in variety identification and DUS testing. Crop Sci. 2009, 49, 880-886.
• Tian, H.; Wang, F.; Zhao, J.; Yi, H.; Wang, L.; Wang, R.; Yang, Y.; Song, W. Development of maizeSNP3072, a high-throughput compatible SNP array, for DNA fingerprinting identification of Chinese maize varieties. Mol. Breed. 2015, 35, 136-146.
• Tommasini, L.; Batley, J.; Arnold, G.; Cooke, R.; Donini, P.; Lee, D.; Law, J.; Lowe, C.; Moule, C.; Trick, M.; et al. The development of multiplex simple sequence repeat (SSR) markers to complement distinctness, uniformity and stability testing of rape (Brassica napus L.) varieties. Theor. Appl. Genet. 2003, 106, 1091-1101.

タイトルに関連する用語 (6件)： ダイズ ,  分子 ,  支援 ,  特異性 ,  均一性 ,  試験