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J-GLOBAL ID：202102270944545024   整理番号：21A1150011

Cunninghamia lanceolata(Lamb.)Hookの根におけるアルミニウム毒性応答に関与するフェノール化合物のトランスクリプトーム的解明【JST・京大機械翻訳】

Transcriptomic Revelation of Phenolic Compounds Involved in Aluminum Toxicity Responses in Roots of Cunninghamia lanceolata (Lamb.) Hook

著者 (3件)： Ma Zhihui (Institute for Forest Resources and Environment of Guizhou, Guizhou University, Guiyang 550025, China) ,  Lin Sizu (State Forestry Administration Engineering Research Center of Chinese Fir, Fuzhou 350002, China) ,  Lin Sizu (College of Forestry, Fujian Agricultural and Forestry University, Fuzhou 350002, China)
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 10  号： 11  ページ： 835  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 中国モミ(Cunninghamia lanceolata (Lamb.) Hook.)は,強いおよび硬い木材の速い成長および生産の望ましい属性のため,中国南部における最も重要な針葉樹常緑樹木種の1つである。しかし,中国モミの収量は,中国南部の酸性土壌におけるアルミニウム(Al)毒性によってしばしば阻害される。Al毒性に対する中国のモミ根応答の分子機構を理解することは,その生産性をさらに増加させるのを助けるかもしれない。ここでは,Al毒性条件を受けた中国のモミ根のトランスクリプトーム解析を行うために,Illumina Hiseq4000プラットフォームを使用した。クリーンデータの合計88.88Gbを12試料から作成し,105732の異なる単一遺伝子に集合させた。これらの単一遺伝子の平均長さとN50長さは,それぞれ839bpと1411bpであった。それらの中で,58362のユニジーンを5つの公開データベース(Nr:NCBI非冗長蛋白質配列,Swiss-Prot:A手動注釈,およびレビューされた蛋白質配列データベース,GO:遺伝子オントロジー,KOG/COG:蛋白質のオルソロググループ,およびKEGG:遺伝子およびゲノムデータベースの京都エンシクロペディア)の検索を通して注釈付けして,それは44のGO用語とユニジーンの会合に導いた。1615の転写因子(TF)を機能的に分類した。次に,差次的発現遺伝子(DEG,|log2(倍変化)|1およびFDR0.05)を,標識TC1(CK-72h/CK-1h)およびTC2(Al-72h/Al-1h)の比較において同定した。多くのTC2 DEG群が同定され,Alストレス下ではほとんどダウンレギュレートされたが,TC1 DEGは主にアップレギュレートされた。GO,KEGGおよびMapMan経路分析を組み合わせると,多くのDEGが細胞壁代謝および脂質代謝を含む一次代謝に関与するが,他のDEGはフラボノイドおよびフェニルプロパノイド代謝を含むシグナル伝達経路および二次代謝と関連することを示した。さらに,TC1とTC2 DEGで同定されたTFは,それぞれ21と40の転写因子ファミリーを示した。それらの中で,bHLH,C2H2,ERF,bZIP,GRAS,およびMYB TFの発現は,Alストレス下でかなり変化し,これらのTFがAl毒性に対する中国のモミ根応答において重要な役割を果たす可能性があることを示唆した。これらの差別的に発現されたTFは,Al毒性に応答する中国のモミ根における主要な役割の充足において,フラボノイドおよびフェニルプロパノイド経路遺伝子と協調して作用する可能性がある。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  *アルミニウム ,  アミノ酸配列 ,  遺伝子 ,  細胞壁 ,  タンパク質 ,  *フェノール類 ,  フラボノイド ,  転写因子 ,  アノテーション ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： オルソログ ,  トランスクリプトーム解析 ,  フェニルプロパノイド ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 中国モミ ,  Al毒性 ,  酸性土壌 ,  フラボノイド経路 ,  フェニルプロパノイド代謝 ,  フェノール化合物

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (43件)：

• Dong, T.; Duan, B.; Zhang, S.; Korpelainen, H.; Niinemets, Ü.; Li, C. Growth, biomass allocation and photosynthetic responses are related to intensity of root severance and soil moisture conditions in the plantation tree Cunninghamia lanceolata. Tree Physiol. 2016, 36, 807-817.
• Zhang, Y.; Han, X.; Sang, J.; He, X.; Liu, M.; Qiao, G.; Zhuo, R.; Hu, J. Transcriptome analysis of immature xylem in the Chinese fir at different developmental phases. PeerJ 2016, 4, e2097.
• Von Uexkull, H.R.; Mutert, E.; Uexkull, H.R. Global extent, development and economic impact of acid soils. Plant Soil 1995, 171, 1-15.
• Bojórquez-Quintal, E.; Escalante-Magaña, C.; Echevarría-Machado, I.; Martínez-Estévez, M. Aluminum, a Friend or Foe of Higher Plants in Acid Soils. Front. Plant Sci. 2017, 8, 1767.
• Zahra, T.; Amin, B.; Shekofeh, E. The effects of aluminum and phosphorous on Brassica napus. Am. Eurasian J. Agric. Environ. Sci. 2009, 6, 137-142.

タイトルに関連する用語 (6件)： Cunninghamia ,  根 ,  アルミニウム毒性 ,  応答 ,  フェノール化合物 ,  トランスクリプトーム