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J-GLOBAL ID：202102270949499610   整理番号：21A0938793

ホルマリン固定パラフィン包埋サンプル全ゲノムライブラリー構築フロー最適化【JST・京大機械翻訳】

Optimization of whole genome library construction process for formalin-fixed and paraffin-embedded tissue

著者 (6件)： Ou Xiaohua (510005,广州,广州金域医学検験中心有限公司) ,  Liu Feifei (510005,广州,广州金域医学検験中心有限公司) ,  Mao Linlin (510005,广州,广州金域医学検験中心有限公司) ,  Zhou Danyan (510005,广州,广州金域医学検験中心有限公司) ,  Hu Changming (510005,广州,广州金域医学検験中心有限公司) ,  Zhao Weiwei (510005,广州,广州金域医学検験中心有限公司)
資料名： Zhonghua Linchuang Shiyanshi Guanli Dianzi Zazhi  (Zhonghua Linchuang Shiyanshi Guanli Dianzi Zazhi)
巻： 8  号： 2  ページ： 105-112  発行年： 2020年 
JST資料番号： C4484A  ISSN： 2095-5820  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:本実験室でヒト由来ホルマリン固定パラフィン包埋(Formalin-FixedandParaffin-Embedded,FFPE)サンプルに対する全ゲノム(GenomicDNA)を樹立する。gDNAライブラリーの構築方案を構築した。方法:FFPE全ゲノムライブラリーに各リンク最適化条件を構築し、設計し、FFPEDNAライブラリーの断片サイズ及びライブラリー転化率を分析し、最適なライブラリー構築プロセスを選択する。【結果】DNA開始量50ngと20分の断片化時間を決定し,4×希釈リンカーを20分間連結し,2つの特定の比率の磁気ビーズスクリーニング方式を用いてライブラリーを構築し,300bp400bpの断片長を得た。ライブラリーの変換率は60%に達した。結論:本操作フローはFFPEサンプルに対して高品質のライブラリー構築を保証でき、同時に高いライブラリー転化効率を実現した。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *最適化 ,  希釈 ,  DNA【核酸】 ,  ヒト ,  *ゲノム ,  転化率 ,  スクリーニング
準シソーラス用語： *ゲノムライブラリー ,  リンカ ,  磁性ビーズ ,  高品質 ,  *ホルマリン固定パラフィン包埋 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 遺伝子操作  (EC02050B) ,  遺伝学研究法  (EC01020N) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (6件)： ホルマリン固定パラフィン包埋 ,  サンプル ,  ゲノムライブラリー ,  構築 ,  フロー ,  最適化