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J-GLOBAL ID：202102271148158780   整理番号：21A1360858

親和性捕捉濃縮対親和性枯渇:低豊富ヒト血しょう蛋白質の被覆率増加のための戦略の比較【JST・京大機械翻訳】

Affinity Capture Enrichment versus Affinity Depletion: A Comparison of Strategies for Increasing Coverage of Low-Abundant Human Plasma Proteins

著者 (6件)： Palstrom Nicolai Bjodstrup (Centre of Individualized Medicine in Arterial Diseases (CIMA), Odense University Hospital, DK-5000 Odense C, Denmark) ,  Palstrom Nicolai Bjodstrup (Centre for Clinical Proteomics, Department of Clinical Biochemistry and Pharmacology, Odense University Hospital, DK-5000 Odense C, Denmark) ,  Rasmussen Lars Melholt (Centre of Individualized Medicine in Arterial Diseases (CIMA), Odense University Hospital, DK-5000 Odense C, Denmark) ,  Rasmussen Lars Melholt (Centre for Clinical Proteomics, Department of Clinical Biochemistry and Pharmacology, Odense University Hospital, DK-5000 Odense C, Denmark) ,  Beck Hans Christian (Centre of Individualized Medicine in Arterial Diseases (CIMA), Odense University Hospital, DK-5000 Odense C, Denmark) ,  Beck Hans Christian (Centre for Clinical Proteomics, Department of Clinical Biochemistry and Pharmacology, Odense University Hospital, DK-5000 Odense C, Denmark)
資料名： International Journal of Molecular Sciences (Web)  (International Journal of Molecular Sciences (Web))
巻： 21  号： 16  ページ： 5903  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7038A  ISSN： 1422-0067  CODEN： IJMCFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究では,血漿試料からの血清アルブミンのような高含有蛋白質を除去する能力のために,アガロース固定化ベンズアミジン(ABA),O-ホスフォ-L-チロシン(pTYR),8-アミノ-ヘキシル-cAMP(cAMP)または8-アミノ-ヘキシル-ATP(ATP)に基づく4つの小分子親和性に基づくプローブを評価し,質量分析に基づくプロテオミクスによる血漿試料中の中から低量の蛋白質の検出を可能にした。最高14の最も豊富な血漿蛋白質を標的とするマルチアフィニティー除去システムヒト14(MARS14)と,無標識定量液体クロマトグラフィータンデム質量分析(LC-MSMS)分析によるProteiner蛋白質等化法も,最も一般的に使用される免疫除去法(MARS14)との性能を比較した。親和性に基づくプローブは,多親和性除去システム(MARS)14およびProteminer法と比較して,低濃縮血漿蛋白質に対する高い再現性を示し,また,高濃縮血漿蛋白質の大部分の優れた除去を示した。ABAに基づく親和性プローブとプロテオーム蛋白質等化法は,分析した蛋白質の数に関して,他のすべての方法と比較して,より良く実行した。試験したすべての方法は,6回の反復実験の相関分析で測定したように,高濃縮血漿蛋白質および低濃縮蛋白質の両方に対して高度に再現可能であった。結論として,著者らの結果は,小分子に基づく親和性に基づくプローブが,血漿中のプロテオミクスバイオマーカー発見研究のための一般的に使用される免疫枯渇法の優れた代替法であることを示した。データは,識別子PXD020727によるプロテオームX変化を介して利用可能である。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 血漿 ,  液体クロマトグラフィー ,  *血漿タンパク質 ,  血清アルブミン ,  *タンパク質 ,  ヒト ,  等化 ,  *捕獲 ,  *親和性 ,  小分子 ,  タンデム質量分析 ,  プロテオミクス ,  プロテオーム
準シソーラス用語： 相関分析 ,  無標識 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 親和性に基づく濃縮 ,  プラズマプロテオミクス ,  免疫枯渇 ,  蛋白質等化

分類 (1件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

引用文献 (27件)：

• Khoonsari, P.E.; Haggmark, A.; Lonnberg, M.; Mikus, M.; Kilander, L.; Lannfelt, L.; Bergquist, J.; Ingelsson, M.; Nilsson, P.; Kultima, K. Analysis of the Cerebrospinal Fluid Proteome in Alzheimer’s Disease. PLoS ONE 2016, 11, e0150672.
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• Zhu, P.; Bowden, P.; Zhang, D.; Marshall, J.G. Mass spectrometry of peptides and proteins from human blood. Mass Spectrom. Rev. 2011, 30, 685-732.
• Tian, R.; Jiang, X.; Li, X.; Jiang, X.; Feng, S.; Xu, S.; Han, G.; Ye, M.; Zou, H. Biological fingerprinting analysis of the interactome of a kinase inhibitor in human plasma by a chemiproteomic approach. J. Chromatogr. A 2006, 1134, 134-142.
• Ray, S.; Reddy, P.J.; Jain, R.; Gollapalli, K.; Moiyadi, A.; Srivastava, S. Proteomic technologies for the identification of disease biomarkers in serum: Advances and challenges ahead. Proteomics 2011, 11, 2139-2161.

タイトルに関連する用語 (8件)： 親和性 ,  捕捉 ,  濃縮 ,  枯渇 ,  ヒト ,  血しょう蛋白質 ,  被覆率 ,  戦略