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J-GLOBAL ID：202102271278668760   整理番号：21A1085909

新疆野生リンゴのNAC遺伝子分析及び抗腐敗病遺伝子選別【JST・京大機械翻訳】

Identification, classification and expression analysis of NAC transcriptional factor genes in Malus sieversii during canker disease response

著者 (6件)： Zhou Tong (中国科学院新疆生態与地理研究所・荒漠与緑洲生態国家重点実験室,烏魯木斉830011;石河子大学生命科学学院,新疆石河子832003) ,  Li Xiaoshuang (中国科学院新疆生態与地理研究所・荒漠与緑洲生態国家重点実験室,烏魯木斉830011;中国科学院吐魯番沙漠植物園,新疆吐魯番838008) ,  Liu Xiaojie (中国科学院新疆生態与地理研究所・荒漠与緑洲生態国家重点実験室,烏魯木斉830011;中国科学院大学,北京100049) ,  Ding Yu (中国科学院新疆生態与地理研究所・荒漠与緑洲生態国家重点実験室,烏魯木斉830011;中国科学院大学,北京100049) ,  Wen Xuejing (中国科学院新疆生態与地理研究所・荒漠与緑洲生態国家重点実験室,烏魯木斉830011;中国科学院大学,北京100049) ,  Zhang Daoyuan (中国科学院新疆生態与地理研究所・荒漠与緑洲生態国家重点実験室,烏魯木斉830011;中国科学院吐魯番沙漠植物園,新疆吐魯番838008)
資料名： Guoshu Xuebao  (Guoshu Xuebao)
巻： 37  号： 8  ページ： 1111-1121  発行年： 2020年 
JST資料番号： C2018A  ISSN： 1009-9980  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： [目的]新疆野リンゴ(Malussieversii)におけるNAC遺伝子資源を究明し、潜在的抗腐敗病NAC遺伝子をスクリーニングした。[方法]モデル植物シロイヌナズナ(Arabidopsisthaliana)のNACタンパク質を種子として隠れマルコフモデルを構築し、新疆野リンゴのトランスクリプトームデータベースからNAC転写因子を同定した。Protparam及びqRT-PCRを用いて、その物理化学的性質、亜細胞定位、保存モチーフ、系統進化及び腐敗病菌感染後の発現スペクトルを分析した。[結果]新疆の野生リンゴから165個のNAC遺伝子を同定し、タンパク質系統の進化関係により12個の亜群に分け、MsNACsは各亜群間の分布が不均一であった。蛋白質の物理化学的特性分析の結果,MsNACsは酸性であり,親水性蛋白質であった。保存モチーフ分析の結果、大多数のMsNAC転写因子は7つの保存モチーフからなる完全なNACドメインを持ち、少数にはサブドメインの欠失が存在することが分かった。膜結合ドメイン分析の結果、18個のMsNACsタンパク質は膜結合ドメインを持ち、多くは細胞核に局在し、少数は小胞体、ミトコンドリアなどの他の細胞器官に局在することが分かった。発現分析の結果、34個のMsNACsは腐敗病菌の感染後に差異的に発現され、発現パターンによってA、B、Cの三つのサブクラスターに分類でき、そのうちMsNAC073とMsNAC102の発現変化は激しく、それぞれ5dpiで6倍近く、約140倍アップレギュレーションした。[結論]新疆野リンゴのトランスクリプトームデータに基づき、初めてMsNACファミリー遺伝子を同定し、分類し、発現量を分析し、新疆野リンゴの抗病応答の重要なNAC遺伝子の機能研究に基礎を築き、他の種における抗病遺伝子のスクリーニングに参考を提供した。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  *遺伝子 ,  細胞核 ,  タンパク質 ,  ミトコンドリア ,  スペクトル ,  系統発生 ,  結合部位 ,  クラスタ ,  *腐敗病 ,  アップレギュレーション ,  Arabidopsis thaliana ,  隠れMarkovモデル ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： ドメイン構造 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 果樹  (FC03042G) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (7件)： 新疆 ,  リンゴ ,  NAC ,  遺伝子分析 ,  腐敗病 ,  遺伝子 ,  選別