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J-GLOBAL ID：202102272837113996   整理番号：21A2364875

完全な葉緑体ゲノムに基づくTribe Desmodieae(マメ科:Papilionoideae)におけるChristia vespertilionisとUrariopsis brevissimaの比較ゲノミクスと系統発生解析【JST・京大機械翻訳】

Comparative Genomics and Phylogenetic Analyses of Christia vespertilionis and Urariopsis brevissima in the Tribe Desmodieae (Fabaceae: Papilionoideae) Based on Complete Chloroplast Genomes

著者 (2件)： Zhao Xue-Li (College of Forestry, Southwest Forestry University, Kunming 650224, China) ,  Zhu Zhang-Ming (School of Ecology and Environmental Science & Yunnan Key Laboratory for Plateau Mountain Ecology and Restoration of Degraded Environments, Yunnan University, Kunming 650500, China)
資料名： Plants (Web)  (Plants (Web))
巻： 9  号： 9  ページ： 1116  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7261A  ISSN： 2223-7747  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Christia,Urariopsis,Uraria,および関連属のトリベDesmodieae(Fabaceae:Papilionoideae)内のタキソノミーおよび系統発生学的関係は,長い間議論の余地がある。ここでは,Christia vespertiorisとUrariopsis brevisimaの完全な葉緑体(cp)ゲノムを報告し,DesmodieaeにおけるUrariaラグポジoidesと他の相対物との比較と系統発生解析を行った。C.vespertilonisおよびU.brevisimaのcpゲノムは,それぞれ128のユニークな遺伝子(83の蛋白質コード遺伝子,37のtRNA遺伝子および8つのrRNA遺伝子)を有する149,656および14930bp長であった。比較分析は,6つのDesmodieae種の間で95-129の単純配列反復(SSRs)と11の高度可変領域(trnK-rbcL,rbcL-atpB,ndhJ-trnF,trnL-trnT,psbD-rpoB,accD-cemA,rps11-rps19,ndhF-ccsA,およびrps15-ycf1)を明らかにした。系統発生分析は,単系統としてDesmodieaeの2つのサブトリベ(DesmodiinaeとLespedezae)を明確に解決し,新たに報告されたC.vespertilinisとU.brevissimaは,亜鳥類Desmodiinaeにクラスタ化した。U.lagopodioidesに対するC.vespertitionisの姉妹関係を支持した。Urariopsisの処理を支持する証拠を,Urariaとの同義ではなく,異なる属として示した。結果は,Desmodieaeにおける種分化,系統発生学,個体群遺伝学,およびスペシエーションの進化過程に関するさらなる研究のための貴重な情報を提供する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  *葉緑体 ,  タンパク質 ,  *系統発生 ,  クラスタ化 ,  *ゲノム ,  *マメ科 ,  集団遺伝 ,  スペシエーション ,  rRNA遺伝子 ,  種分化
準シソーラス用語： 系統解析 ,  *葉緑体ゲノム ,  *比較ゲノミクス ,  進化過程 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 色素体ゲノム ,  次世代シークエンシング ,  ゲノムの特徴 ,  系統発生 ,  Uraria ,  Fabaceae

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (59件)：

• Lewis, G.P. Legumes of the World; Royal Botanic Gardens Kew: Richmond, UK, 2005; p. 592.
• Bruneau, A.; Doyle, J.J.; Herendeen, P.; Hughes, C.; Kenicer, G.; Lewis, G.; Mackinder, B.; Pennington, R.T.; Sanderson, M.J.; Wojciechowski, M.F.; et al. Legume phylogeny and classification in the 21st century: Progress, prospects and lessons for other species-rich clades. Taxon 2013, 62, 217-248.
• Azani, N.; Babineau, M.; Bailey, C.D.; Banks, H.; Barbosa, A.R.; Pinto, R.B.; Boatwright, J.S.; Borges, L.M.; Brown, G.K.; Bruneau, A.; et al. A new subfamily classification of the Leguminosae based on a taxonomically comprehensive phylogeny. Taxon 2017, 66, 44-77.
• Ohashi, H. Desmodieae. In Legumes of the World; Lewis, G.P., Ed.; Royal Botanic Gardens Kew: Richmond, UK, 2005; pp. 433-446.
• Jabbour, F.; Gaudeul, M.; Lambourdiere, J.; Ramstein, G.; Hassanin, A.; Labat, J.N.; Sarthou, C. Phylogeny, biogeography and character evolution in the tribe Desmodieae (Fabaceae: Papilionoideae), with special emphasis on the New Caledonian endemic genera. Mol. Phylogenet. Evol. 2018, 118, 108-121.

タイトルに関連する用語 (5件)： 葉緑体ゲノム ,  マメ科 ,  比較ゲノミクス ,  系統発生 ,  解析