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J-GLOBAL ID：202102273014652675   整理番号：21A1151213

偽発見率制御による非正規グラフィカルモデルの下での差動遺伝子ネットワークの試験【JST・京大機械翻訳】

Testing Differential Gene Networks under Nonparanormal Graphical Models with False Discovery Rate Control

著者 (1件)： Zhang Qingyang (Department of Mathematical Sciences, University of Arkansas, Arkansas, AR 72701, USA)
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 11  号： 2  ページ： 167  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 非正規グラフィカルモデルは,Gaussグラフィカルモデルの良好な解釈性と計算利便性を維持しながら,非Gaussデータに柔軟であるので,変数間の依存性構造をモデル化するための重要なツールとして出現した。本論文では,偽発見率制御による2つの非正規グラフィカルモデル間の差分サブ構造を検出する問題を考察した。バイアス補正サンプル共分散と共に,未知変換関数の短縮推定器に基づく新しい統計を構築した。さらに,新しいテスト統計量は,そのオラクル対応物と同じ分布に収束することを示した。合成データと実際の癌ゲノムデータの両方を用いて,新しい方法の有望性を説明した。提案した試験フレームワークは簡単でスケーラブルであり,大規模データへの適用を容易にした。計算パイプラインは,包括的Rアーカイブネットワークを通して自由に利用可能なRパッケージDetFinderに実装した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ネットワーク ,  共分散 ,  統計量
準シソーラス用語： オラクル ,  変換関数 ,  Rパッケージ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 遺伝子調節ネットワーク ,  非正規グラフィカルモデル ,  ネットワーク下部構造 ,  誤発見率制御

分類 (3件)： 数値計算  (JE02000J) ,  グラフ理論基礎  (IA02020S) ,  統計学  (AB08000H)

引用文献 (24件)：

• Guo, J.; Levina, E.; Michailidis, G.; Cai, T.T. Joint estimation of multiple graphical models. Biometrika 2015, 98, 1-15.
• Danaher, P.; Wang, P.; Witten, D.M. The joint graphical lasso for inverse covariance estimation across multiple classes. J. R. Stat. Soc. Ser. B 2014, 76, 373-397.
• Zhao, S.; Cai, T.T.; Li, H. Direct estimation of differential networks. Biometrika 2014, 101, 253-268.
• Liu, W. Structural similarity and difference testing on multiple sparse Gaussian graphical models. Ann. Stat. 2017, 45, 2680-2707.
• Liu, H.; Lafferty, J.; Wasserman, L. The nonparanormal: Semiparametric estimation of high dimensional undirected graphs. J. Mach. Learn. Res. 2009, 10, 2295-2328.

タイトルに関連する用語 (5件)： 発見率 ,  グラフィカルモデル ,  差動 ,  遺伝子ネットワーク ,  試験