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J-GLOBAL ID：202102274213558640   整理番号：21A1152090

トランスクリプトーム解析は,Gossypium barbadenseにおける高温により誘導されるFuzz線維開始に関連する遺伝子発現パターンを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome Analysis Reveals a Gene Expression Pattern Associated with Fuzz Fiber Initiation Induced by High Temperature in Gossypium barbadense

著者 (9件)： Cheng Gongmin (College of Agronomy, Northwest Agriculture and Forestry University, Yangling 712100, China) ,  Cheng Gongmin (State Key Laboratory of Cotton Biology, Institute of Cotton Research, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang 455000, China) ,  Zhang Longyan (State Key Laboratory of Cotton Biology, Institute of Cotton Research, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang 455000, China) ,  Zhang Longyan (College of Agronomy, Hebei Agricultural University, Baoding 071001, China) ,  Wei Hengling (State Key Laboratory of Cotton Biology, Institute of Cotton Research, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang 455000, China) ,  Wang Hantao (State Key Laboratory of Cotton Biology, Institute of Cotton Research, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang 455000, China) ,  Lu Jianhua (State Key Laboratory of Cotton Biology, Institute of Cotton Research, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang 455000, China) ,  Yu Shuxun (College of Agronomy, Northwest Agriculture and Forestry University, Yangling 712100, China) ,  Yu Shuxun (State Key Laboratory of Cotton Biology, Institute of Cotton Research, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang 455000, China)
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 11  号： 9  ページ： 1066  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Gossypium barbadenseは,Gossypium hirsutumのように天然繊維の重要な供給源である。綿繊維の発達は,異常な温度のような様々な環境因子によってしばしば影響を受ける。しかし,ファジィ繊維開始を制御する温度の根底にある機構についてはほとんど知られていない。本研究では,高温(HT)が繊維発生を促進し,繊維品質を改善し,熱感受性G.barbadense品種L7009のフズ開始を誘導することを明らかにした。ファジィ開始は低温(LT)によって阻害され,4dpaはファジィ開始期間において温度ストレスに最も感受性が高い段階であった。合計43,826の差次的発現遺伝子(DEG)を,比較トランスクリプトーム分析を通して同定した。これらのうち,9667は,901の転写因子遺伝子および植物ホルモンシグナル伝達に関連する189の遺伝子による繊維発達および温度応答に関与していた。遺伝子発現パターンのさらなる分析は,240の遺伝子が,高温によって誘発されるファジィ開始に潜在的に関与することを明らかにした。機能的アノテーションは,ファジィ開始に関連する候補遺伝子がアスパラギン生合成過程,細胞壁生合成およびストレス応答に有意に関与することを明らかにした。RNA-seqデータからランダムに選択した16遺伝子の発現傾向はqRT-PCRの結果とほぼ一致した。本研究は,高温により誘導されるフズ開始に関連するいくつかの潜在的候補遺伝子と経路を明らかにした。これは,Gossypium barbadenseにおける温度誘導組織と器官発生の新しい見解を提供する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *高温 ,  生合成 ,  RNA【核酸】 ,  *遺伝子 ,  細胞壁 ,  植物ホルモン ,  品種 ,  *遺伝子発現 ,  細胞情報伝達 ,  転写因子 ,  *ワタ属 ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： ストレス応答 ,  候補遺伝子 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Gossypium barbadense ,  高温 ,  ファジィ開始 ,  RNA-seq ,  遺伝子発現

分類 (2件)： 繊維料作物  (FC03077U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (79件)：

• Qin, Y.M.; Zhu, Y.X. How cotton fibers elongate: A tale of linear cell-growth mode. Curr. Opin. Plant Biol. 2011, 14, 106-111.
• Graves, D.A.; Stewart, J.M. Chronology of the differentiation of cotton (Gossypium hirsutum L.) fiber cells. Planta 1988, 175, 254-258.
• Lee, J.J.; Hassan, O.S.; Gao, W.; Wei, N.E.; Kohel, R.J.; Chen, X.Y.; Payton, P.; Sze, S.H.; Stelly, D.M.; Chen, Z.J. Developmental and gene expression analyses of a cotton naked seed mutant. Planta 2006, 223, 418-432.
• Zhang, D.Y.; Zhang, T.Z.; Sang, Z.Q.; Guo, W.Z. Comparative development of lint and fuzz using different cotton fiber-specific developmental mutants in Gossypium hirsutum. J. Integr. Plant Biol. 2007, 49, 1038-1046.
• Snowden, M.C.; Ritchie, G.L.; Simao, F.R.; Bordovsky, J.P. Timing of episodic drought can be critical in cotton. Agron. J. 2014, 106, 452-458.

タイトルに関連する用語 (4件)： トランスクリプトーム解析 ,  Gossypium ,  誘導 ,  遺伝子発現パターン