文献

J-GLOBAL ID：202102274636131103   整理番号：21A0156995

SNPベースCAPSマーカーによるメロンの形態および果実品質関連形質のための遺伝的連鎖マッピングおよびQTL同定【JST・京大機械翻訳】

Genetic linkage mapping and QTLs identification for morphology and fruit quality related traits of melon by SNP based CAPS markers

著者 (15件)： Amanullah Sikandar (College of Horticulture and Landscape Architecture, Northeast Agricultural University, No. 600, Changjiang Road, Harbin, 150030, Heilongjiang, PR China) ,  Amanullah Sikandar (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticulture Crops (Northeast Region), Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Harbin, 150030, Heilongjiang, PR China) ,  Gao Peng (College of Horticulture and Landscape Architecture, Northeast Agricultural University, No. 600, Changjiang Road, Harbin, 150030, Heilongjiang, PR China) ,  Gao Peng (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticulture Crops (Northeast Region), Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Harbin, 150030, Heilongjiang, PR China) ,  Osae Benjamin Agyei (College of Horticulture and Landscape Architecture, Northeast Agricultural University, No. 600, Changjiang Road, Harbin, 150030, Heilongjiang, PR China) ,  Osae Benjamin Agyei (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticulture Crops (Northeast Region), Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Harbin, 150030, Heilongjiang, PR China) ,  Saroj Arvind (College of Horticulture and Landscape Architecture, Northeast Agricultural University, No. 600, Changjiang Road, Harbin, 150030, Heilongjiang, PR China) ,  Saroj Arvind (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticulture Crops (Northeast Region), Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Harbin, 150030, Heilongjiang, PR China) ,  Yang Tiantian (College of Horticulture and Landscape Architecture, Northeast Agricultural University, No. 600, Changjiang Road, Harbin, 150030, Heilongjiang, PR China) ,  Yang Tiantian (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticulture Crops (Northeast Region), Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Harbin, 150030, Heilongjiang, PR China) ,  Liu Shi (College of Horticulture and Landscape Architecture, Northeast Agricultural University, No. 600, Changjiang Road, Harbin, 150030, Heilongjiang, PR China) ,  Liu Shi (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticulture Crops (Northeast Region), Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Harbin, 150030, Heilongjiang, PR China) ,  Weng Yiqun (USDA-ARS, Vegetable Crops Research Unit, Horticulture Department, University of Wisconsin-Madison, Madison, WI, 53706, USA) ,  Luan Feishi (College of Horticulture and Landscape Architecture, Northeast Agricultural University, No. 600, Changjiang Road, Harbin, 150030, Heilongjiang, PR China) ,  Luan Feishi (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticulture Crops (Northeast Region), Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Harbin, 150030, Heilongjiang, PR China)
資料名： Scientia Horticulturae  (Scientia Horticulturae)
巻： 278  ページ： Null  発行年： 2021年 
JST資料番号： W1940A  ISSN： 0304-4238  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： メロンは形態及び果実品質形質の巨大な多様性を示し,これらの形質は世界中の育種研究においてまだ調べられている。有益な利点のために,単一ヌクレオチド多型(SNP)に基づく遺伝子マーカーは,推定上のQTL/遺伝子の解離に広く使用されている。本研究では,全ゲノム再配列決定および新たに開発されたSNPに基づく切断増幅多型配列(CAPS)マーカーを用いて,メロンの卵巣,果実および種子形質に対する遺伝的連鎖マッピングおよびQTL検出を報告した。14百万(96%,360Mb)および20百万(85.62%,319Mb)再配列読取り,404,083候補SNP,および6474CAPS遺伝子座を参照ゲノムにわたって曝露した2つの異なるメロン系統の再配列決定分析を行った。148個体から成るF_2マッピング集団を,全ゲノム隣接マーカー間で全1545.44cM遺伝距離と平均9.48cMに及ぶ遺伝的連鎖マッピングのための163SNP-CAPSマーカーで遺伝子型を決定した。全体で,26の推定QTL(6主要および20マイナーQTL)を,異なる染色体(1,2,3,4,6,8,9および12)上で検出し,多面的影響を有する12の表現型形質に対する1.83%17.67%の表現型変異を説明した。これらのQTLの中で,卵巣の6つのQTL,果実品質の17のQTLおよび種子形質の3つのQTLを同定し,多くのQTLを染色体1,9および12にクラスタ化した。表現型の高度に有意な関係と正規分布頻度も,相関とPCAの分析で注目された。cruxにおいて,著者らの検出されたQTL洞察は,微細マッピングとマーカー支援選抜(MAS)によってメロンの未調査植物群で貴重で,さらに調査できた。Copyright 2021 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 正規分布 ,  遺伝子 ,  遺伝子型 ,  染色体 ,  表現型 ,  *メロン ,  卵巣 ,  クラスタ化 ,  ゲノム ,  育種 ,  *果実【器官】 ,  *遺伝的連鎖 ,  一塩基多型
準シソーラス用語： 遺伝子マーカ ,  *果実品質 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： メロン ,  SNP ,  CAPSマーカー ,  卵巣 ,  果実 ,  種子 ,  QTL

分類 (2件)： 果樹  (FC03042G) ,  植物の生化学  (EH01050J)

タイトルに関連する用語 (10件)： SNP ,  CAPSマーカー ,  メロン ,  形態 ,  果実品質 ,  形質 ,  遺伝的連鎖 ,  マッピング ,  QTL ,  同定