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J-GLOBAL ID：202102274898010794   整理番号：21A0002486

BHGに基づくRNA構造予測における新しいアルゴリズム【JST・京大機械翻訳】

New Algorithms in RNA Structure Prediction Based on BHG

著者 (5件)： Liu Zhendong (School of Computer Science and Technology, Shandong Jianzhu University, Jinan 250101, P. R. China) ,  Liu Zhendong (Department of Biostatistics, University of California, Los Angeles, Los Angeles 90095, USA) ,  Liu Zhendong (Department of Statistics, Harvard University, Cambridge, MA 02138, USA) ,  Li Gang (Department of Biostatistics, University of California, Los Angeles, Los Angeles 90095, USA) ,  Liu Jun S. (Department of Statistics, Harvard University, Cambridge, MA 02138, USA)
資料名： International Journal of Pattern Recognition and Artificial Intelligence  (International Journal of Pattern Recognition and Artificial Intelligence)
巻： 34  号： 13  ページ： 2050031  発行年： 2020年 
JST資料番号： T0877A  ISSN： 0218-0014  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： シンガポール (SGP)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： RNA構造の予測にはいくつかのNP困難問題がある。RNAヌクレオチド配列におけるRNA折畳み構造の予測は未解決の課題である。拡張構造と盆地ホッピンググラフに基づくRNA折りたたみ構造予測における計算アルゴリズムを調査して,それは疑似ノットを含むRNA折畳み構造予測における盆地ホッピンググラフの計算モードである。本研究は,拡張構造に基づく予測アルゴリズムを提示して,それはまた,障壁ツリーと盆地ホッピンググラフに基づく改良コンピューティングアルゴリズムを提案し,それはRNA折りたたみ構造予測における魅力的アプローチである。多くの実験をRfam14.1データベースとPseudoBaseデータベースで実行して,実験結果は著者らの2つのアルゴリズムが他の既存のアルゴリズムより効率的で正確であることを示した。Copyright 2021 World Scientific Publishing Company All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *アルゴリズム ,  データベース ,  折畳み構造 ,  流域 ,  *RNA【核酸】 ,  ヌクレオチド配列 ,  NP困難 ,  盆地
準シソーラス用語： 計算アルゴリズム ,  予測アルゴリズム ,  構造予測 ,  RNA折畳み ,  *RNA構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： RNA構造予測 ,  流域ホッピンググラフ ,  拡張構造 ,  計算アルゴリズム ,  サドル高さ

分類 (2件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (3件)： RNA構造 ,  予測 ,  アルゴリズム