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J-GLOBAL ID：202102275538043036   整理番号：21A2842108

in vivoで不完全にパッケージされたDNAによるファージT3カプシドのATP駆動収縮【JST・京大機械翻訳】

ATP-Driven Contraction of Phage T3 Capsids with DNA Incompletely Packaged In Vivo

著者 (2件)： Serwer Philip ,  Wright Elena T.
資料名： Viruses (Web)  (Viruses (Web))
巻： 9  号： 5  ページ： 119  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7293A  ISSN： 1999-4915  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： T3を含むファージの予め集合したカプシドにおける二本鎖DNA(dsDNA)分子のアデノシン三リン酸(ATP)開裂パワーパッケージング。いくつかの観察は,カプシドの殻が包装中にエネルギー的に不活性であるという従来の見解への挑戦を構成する。ここでは,in vivoでDNAパッケージングにより生成されたカプシドの殻に対するATPのin vitro効果を解析することにより,この課題を試験した。これらのカプシドは不完全にパッケージされたDNA(ipDNA)を保持し,ipDNAカプシドと呼ばれる;ipDNAカプシドは未熟ゲノム成熟開裂の産物であると想定されている。それらを分取Nycodenz浮力密度遠心分離によって分離した。一部のipDNA-カプシドでは,Nycodenz im透過性は水和を増加させ,密度を生成し,シェルの超膨張は関連水に適応するために存在しなければならない。Electron顕微鏡(EM)は,高膨張および低透過性を確認し,3.0mMのマグネシウムATP(生理学的濃度)が,成熟サイズ以下の高拡張,低透過性ipDNAカプシドの収縮を引き起こすことを明らかにした。5.0mMのマグネシウムATP(超生理学的濃度の順序)は,それらを破壊した。さらに,過剰なナトリウムADPは3.0mMのマグネシウムATP誘導収縮を逆転させ,高膨張を回復させる。Nycodenz不透過性は,DNAパッケージングにおける機能の選択を示唆する集合完全性を意味する。これらの知見は,上記の課題を支持し,T3 DNAパッケージングがATP駆動カプシド収縮と超拡張のバックアップサイクルを含むという仮定により説明できる。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 電子顕微鏡 ,  浮力 ,  ナトリウム ,  マグネシウム ,  遠心分離 ,  水和 ,  *DNA【核酸】 ,  *バクテリオファージ ,  ゲノム ,  分取 ,  バックアップ ,  *カプシド ,  in vitro実験
準シソーラス用語： DNAパッケージング ,  二本鎖DNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： アガロースゲル電気泳動 ,  バクテリオファージ集合 ,  生物モータ ,  水和に基づく浮力密度分別 ,  電子顕微鏡

分類 (1件)： ウイルスの生化学  (EG04030F)

引用文献 (27件)：

• Koonin, E.V.; Krupovic, M.; Yutin, N. Evolution of double-stranded DNA viruses of eukaryotes: From bacteriophages to transposons to giant viruses. Ann. N. Y. Acad. Sci. 2015, 1341, 10-24.
• Serwer, P. Proposed ancestors of phage nucleic acid packaging motors (and cells). Viruses 2011, 3, 1249-1280.
• Serwer, P.; Wright, E.T.; Chang, J.T.; Liu, X. Enhancing and initiating phage-based therapies. Bacteriophage 2014, 4, e961869.
• Liu, S.; Chistol, G.; Bustamante, C. Mechanical operation and intersubunit coordination of ring-shaped molecular motors: Insights from single-molecule studies. Biophys. J. 2014, 25, 1844-1858.
• Kim, H.; Ha, T. Single molecule nanometry for biological physics. Rep. Prog. Phys. 2013, 76, 016601.

タイトルに関連する用語 (7件)： パッケージ ,  DNA ,  ファージ ,  T3 ,  カプシド ,  ATP ,  収縮