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J-GLOBAL ID：202102275862941103   整理番号：21A1115750

異質三倍体ポプラの異なる年齢における葉の比較プロテオーム解析【JST・京大機械翻訳】

Comparative Proteomic Analysis of Leaves at Different Ages in Allotriploid Populus

著者 (6件)： Li Jiang (Beijing Advanced Innovation Center for Tree Breeding by Molecular Design, Beijing Forestry University, Beijing 100083, China) ,  Wang Yi (Horticulture and Landscape College, Zhongkai University of Agriculture and Engineering, Guangzhou 510225, China) ,  Wei Hairong (College of Forest Resources and Environmental Science, Michigan Technological University, Houghton, MI 49931, USA) ,  Kang Xiangyang (Beijing Advanced Innovation Center for Tree Breeding by Molecular Design, Beijing Forestry University, Beijing 100083, China) ,  Kang Xiangyang (National Engineering Laboratory for Tree Breeding, Beijing Forestry University, Beijing 100083, China) ,  Kang Xiangyang (College of Biological Sciences and Technology, Beijing Forestry University, Beijing 100083, China)
資料名： Forests (Web)  (Forests (Web))
巻： 11  号： 11  ページ： 1154  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7188A  ISSN： 1999-4907  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 三倍体ポプラ樹木は,多くの成長利点,特にバイオマス増加に大きく寄与するはるかに大きな葉を持つことが示されている。本研究では,三倍体における葉齢と葉代謝間の関係に焦点を当てた。第5(FDR5),第10(FDR10)および第25(FDR25)の葉を,第1分割回復(FDR)に由来する同種異数体における頂端分裂組織から比較プロテオーム解析を行った。FDR5,FDR10およびFDR25において,それぞれ1970,1916および1850の蛋白質を同定した。主成分分析(PCA)および差次的蓄積蛋白質(DAP)分析は,FDR10およびFDR25がFDR5と比較して蛋白質蓄積パターンの高い類似性を示すことを示した。MapMan濃縮分析は,いくつかの一次代謝経路またはプロセスがDAPsにおいて有意に濃縮されることを示した。例えば,光合成,主要なCHO代謝,解糖,N代謝,レドックス,C1代謝,DNA,および蛋白質ターンオーバーはFDR5と比較してFDR10とFDR25の両方で有意に変化した。さらに,アミノ酸代謝とグルコネオゲネシス/グリオキシル酸サイクルもFDR5と比較してFDR25の有意な変化を受けた。しかし,アミノ酸代謝だけが,FDR25とFDR10の間のDAPsにおいて有意に豊富であった。さらに,DAP蓄積パターン分析は,FDR5,FDR10,およびFDR25が葉の若い,成熟,および一次老化段階に配置されたことを意味した。軽反応,光呼吸,カルビンサイクル,澱粉とスクロース代謝,ペントースリン酸経路(OPP),トリカルボン酸(TCA)サイクル,N代謝,およびC1代謝に関与する大部分のDAPは,FDR5と比較してFDR10とFDR25の両方でより高い蓄積を示した。しかし,細胞壁と脂質代謝,テトラピロール合成,ヌクレオチド代謝に関与する大部分のDAPは,FDR10とFDR25の両方で低い蓄積を示した。FDR-10とFDR-25の間のほとんどすべてのDAPは,FDR25の劇的な減少を示した。KEGG濃縮分析は,炭素代謝が異なる葉齢で著しく変化することを示した。炭素代謝に関与するDAPは,STRINGデータベースからの蛋白質相互作用(PPI)ネットワークの異なる点として予測された。最後に,DAPsに対して矛盾した転写物と蛋白質存在量が見出され,葉齢進行過程中の転写後調節の存在を示した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ネットワーク ,  DNA【核酸】 ,  アミノ酸代謝 ,  グルコネオゲネシス ,  タンパク質 ,  澱粉 ,  老化 ,  酸化還元反応 ,  バイオマス ,  *ハコヤナギ属 ,  分裂組織 ,  主成分分析 ,  *三倍体 ,  *プロテオミクス ,  *プロテオーム

著者キーワード (4件)： プロテオーム ,  葉齢 ,  炭素代謝 ,  トランスクリプトーム

分類 (3件)： 循環系の基礎医学  (GJ01020K) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  有機化合物の各種分析  (CC08034J)

引用文献 (53件)：

• Szymanski, J.; Levin, Y.; Savidor, A.; Breitel, D.; Chappell-Maor, L.; Heinig, U.; Topfer, N.; Aharoni, A. Label-free deep shotgun proteomics reveals protein dynamics during tomato fruit tissues development. Plant J. 2017, 90, 396-417.
• Jensen, O.N. Modification-specific proteomics: Characterization of post-translational modifications by mass spectrometry. Curr. Opin. Chem. Biol. 2004, 8, 33-41.
• Kaufmann, K.; Smaczniak, C.; de Vries, S.; Angenent, G.C.; Karlova, R. Proteomics insights into plant signaling and development. Proteomics 2011, 11, 744-755.
• Hossain, Z.; Nouri, M.Z.; Komatsu, S. Plant cell organelle proteomics in response to abiotic stress. J. Proteome Res. 2012, 11, 37-48.
• Pflieger, D.; Bigeard, J.; Hirt, H. Isolation and characterization of plant protein complexes by mass spectrometry. Proteomics 2011, 11, 1824-1833.

タイトルに関連する用語 (5件)： 三倍体 ,  ポプラ ,  年齢 ,  葉 ,  プロテオーム解析