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J-GLOBAL ID:202102276339574651   整理番号:21A0177281

発見的計算モデリングによるBacillus thuringiensisのCry11変異体の生成【JST・京大機械翻訳】

Generation of Cry11 Variants of Bacillus thuringiensis by Heuristic Computational Modeling
著者 (7件):
資料名:
巻: 16  ページ: 1176934320924681  発行年: 2020年 
JST資料番号: W5210A  ISSN: 1176-9343  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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指向性進化法は,in vitro Darwinian進化を模倣し,遺伝子におけるランダム変異と選択的圧力を誘導し,増強された特性を有する蛋白質を得る。これらの技術は,高い不確実性を有する実験レベルで試行錯誤試験を用いて開発された。したがって,指向性進化のin silicoモデリングは,実験分析をサポートするのに必要である。いくつかのin silicoアプローチは,実験条件を再現する試みにおいて,統計的,熱力学的および速度論的モデルを用いて,指向性進化を再現した。同様に,発見的モデルを用いた最適化技法を用いて,有向進化の最良シナリオを理解し,発見した。本研究は,Bacillus thuringiensisの2つの親遺伝子cry11Aaとcry11Baからキメラライブラリーを生成するために設計された遺伝的アルゴリズムに基づく,HeurItics DirecteD EvolutioNと名付けられたin silicoモデルを使用した。これらの遺伝子は3つの保存ドメインを持つ結晶形δ-エンドトキシンをコードする。Cry11毒素は,疾患拡大ベクターのための生物農薬として有効であることが示されているので,バイオテクノロジー的興味がある。発見的モデルにより,DNA断片化長,世代数またはシミュレーションサイクル数,突然変異率などの実験パラメータを検討し,個体群同一性の割合,内部停止コドンの存在から得られた変異体の切断,熱力学的多様性の割合,変異体の安定性などのCry11キメラライブラリーの特性を得た。本研究は,3保存ドメインのCry毒素による指向性進化のin vitroおよびin silico実験の設計に有用な実験条件に焦点を当てた。さらに,Cry11変異体のin silicoライブラリーを得て,野生型Cryファミリーの構造特性をin silico配列の試料のレビューで観察した。ここでは,将来の研究が,ここで示唆した1つとして,指示進化のin vitro実験を支持するため,in silicoライブラリーおよび発見的計算モデルを使用できると考える。Copyright The Author(s) 2020 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (2件):
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酵素一般  ,  分子遺伝学一般 
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