蛍光データから蛋白質-配位子結合定数を計算する方程式の比較及び応用研究【JST・京大機械翻訳】

Zhang Jing; Gao Xuan; Jin Liang; Wang Honghui; Chen Haichao; Zhou Xiping

文献

J-GLOBAL ID：202102276548476139 整理番号：21A0043482

蛍光データから蛋白質-配位子結合定数を計算する方程式の比較及び応用研究【JST・京大機械翻訳】

Comparisons and Applications of Functional Equations for the Calculation of the Protein-Ligand Binding Constant Based on Fluorescence Spectral Data

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資料名：
巻： 40 号： 11 ページ： 3494-3498 発行年： 2020年
JST資料番号： C2093A ISSN： 1000-0593 CODEN： GYGFED 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：中国 (CHN) 言語：中国語 (ZH)

タンパク質とリガンドの結合作用は生物体の生理生物化学過程で重要な役割を果たし、多くの分野の研究焦点である。タンパク質-リガンド結合作用の一つの重要な目標は、両者の結合定数(Kb)を獲得し、その結合作用の強弱を評価することである。蛍光分光法は,高感度,迅速,低コストの利点を有し,蛋白質-リガンド結合相互作用の研究に広く用いられる。蛍光スペクトル法を適用した時、関数方程式による蛍光データの数学分析を通じて、Kb値を得るのは一つの重要なステップである。しかし、異なる方程式の適用範囲が異なるため、同じシステムに応用されるKb値に差異がある。この問題に対して、蛍光スペクトルデータを利用してタンパク質と配位子結合のKb値を計算する関数方程式の導出過程及びその適用条件を検討し、異なる前提条件下のタンパク質-配位子1:1と1:n(n≧2)の結合時に選択可能な計算Kb値の最適方程式をまとめた。分析により、最適な方程式を選択するのは2つの前提:a:タンパク質とリガンドの結合後に形成された複合体が蛍光を産生するかどうか、b:添加した配位子の濃度がタンパク質濃度より遥かに大きいかどうかを表明した。一方、ヒト血清アルブミン(HSA)-ノルフロキサシン(NFX)結合体系をモデルとし、異なる方程式でフィッティングしたKb値の差異を比較し、相応の原因を検討した。その結果,HSAとNFXは1:1結合は、この系の方程式(S12)を用いて、298KでのKb値5.0×104L・mol-1を適合させ、方程式(S6)と方程式(S24)のフィッティングで得られたKb値は、それぞれこの値より28.8%と48.6%大きい。方程式(S17)から得られた値は,この値より約2桁高い。不適切な方程式の選択が得られた結果に与える影響を直観的に示した。また、蛍光スペクトル法で得られたKb値を他の方法で得たデータと比較し、蛍光スペクトル法によるタンパク質-配位子Kb値の相対信頼性を計算し、同時にこの方法の限界を指摘した。その結果、蛍光スペクトルデータを利用してタンパク質-配位子結合のKb値が得られた場合、前提条件(即ちaと/またはbが成立するかどうか)によって最適な関数方程式を選ぶことが必要であり、得られた結果の信頼性を決定することが分かった。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

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