代謝特徴による原核生物種のクラスタリングのためのエキスパートシステム【JST・京大機械翻訳】

Higuera Clara; Higuera Clara; Pajares Gonzalo; Tamames Javier; Moran Federico

文献

J-GLOBAL ID：202102276635254061 整理番号：21A2870985

代謝特徴による原核生物種のクラスタリングのためのエキスパートシステム【JST・京大機械翻訳】

Expert system for clustering prokaryotic species by their metabolic features

出版者サイト複写サービスで全文入手
高度な検索・分析はJDreamⅢで {{ this.onShowJLink("http://jdream3.com/lp/jglobal/index.html?docNo=21A2870985&from=J-GLOBAL&jstjournalNo=W0178A") }}

著者 (5件)： , , , ,
資料名：
巻： 40 号： 15 ページ： 6185-6194 発行年： 2013年
JST資料番号： W0178A ISSN： 0957-4174 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

微生物種のコミュニティの研究は,多くの自然および人工プロセスが単一エンティティよりむしろ微生物群によって媒介されるので,非常に重要である。それらの研究の1つの方法は,微生物種間の一般的な代謝特性の探索であり,それは密接に関連する生物の分化および分類のための潜在的尺度であるだけでなく,それらの研究は,全生物または種の生命の方法を記述することができる共通の機能特性の発見を可能にする。本研究において,著者らは,いくつかの種に対して不完全であるかもしれない114の代謝特徴によって,365の原核生物種の複雑なデータセットをクラスター化するために,主要な貢献をするエキスパートシステム(ES)を提案した。人間のエキスパート推論にヒントを得て,階層的クラスタリング戦略に基づいて,提案ESはデータセットを分割するのに適したクラスタの最適数を推定し,その後,自己組織化マップ(SOM)アプローチに基づいてクラスタリングの反復プロセスを開始し,そこでは,よく知られたDavies Bordin(DB)指数に触発された新しい妥当性指数によって,異なるステップで関連するクラスタを見つける。プロセスをモニターし,ESの挙動を評価するために,各ステップで得られた分配をDB妥当性指数で検証した。生じたクラスターは,ESと組み合わせた代謝特徴の使用が,基礎となる情報の抽出を助けることができる複雑なデータセットを処理でき,他の既存の手法よりも利点を獲得し,原核生物種における表現型,環境または進化特性と代謝を関連づける可能性があることを証明した。Copyright 2021 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

, , , , , , , ,
, , , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： , , , , ,

代謝と栄養

, , ,

前のページに戻る