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J-GLOBAL ID：202102277035333351   整理番号：21A2363017

ダイズにおけるWOX遺伝子ファミリーの全ゲノム解析とGmWOX18の機能探索【JST・京大機械翻訳】

Genome-Wide Analysis of the WOX Gene Family and Function Exploration of GmWOX18 in Soybean

著者 (8件)： Hao Qingnan (Oil Crops Research Institute of Chinese Academy of Agriculture Sciences, Wuhan 430062, China) ,  Hao Qingnan (Chinese Academy of Agricultural Sciences/Key Laboratory for Biological Sciences of Oil Crops, Ministry of Agriculture, Wuhan 430062, China) ,  Zhang Ling (Jilin Provincial Key laboratory of Agricultural Biotechnology, Jilin Academy of Agricultural Sciences, Changchun, Jilin 130033, China) ,  Yang Yanyan (Oil Crops Research Institute of Chinese Academy of Agriculture Sciences, Wuhan 430062, China) ,  Shan Zhihui (Oil Crops Research Institute of Chinese Academy of Agriculture Sciences, Wuhan 430062, China) ,  Shan Zhihui (Chinese Academy of Agricultural Sciences/Key Laboratory for Biological Sciences of Oil Crops, Ministry of Agriculture, Wuhan 430062, China) ,  Zhou Xin-an (Oil Crops Research Institute of Chinese Academy of Agriculture Sciences, Wuhan 430062, China) ,  Zhou Xin-an (Chinese Academy of Agricultural Sciences/Key Laboratory for Biological Sciences of Oil Crops, Ministry of Agriculture, Wuhan 430062, China)
資料名： Plants (Web)  (Plants (Web))
巻： 8  号： 7  ページ： 215  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7261A  ISSN： 2223-7747  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： WUSCHEL関連ホメオボックス(WOX)は植物に特有な転写因子ファミリーであり,ホメオドメインの存在により特性化される。WOX転写因子は,植物成長と発育の調節および非生物的ストレスに対する応答において重要な役割を果たす。ダイズは世界的に最も重要な油作物の1つである。本研究では,ダイズの利用可能なゲノムデータに基づいて,WOX遺伝子ファミリーをバイオインフォマティクス分析により同定した。このファミリーの染色体分布,遺伝子および蛋白質構造,系統発生関係および遺伝子発現パターンを包括的に比較した。結果は,ダイズゲノムにおける合計33の推定WOX遺伝子を発見し,次にGmWOX1-GmWOX33として指定し,染色体16を除く19の染色体に分布した。GmWOX遺伝子ファミリーの多重配列分析は,高度に保存されたホメオドメインを明らかにした。系統樹分析は,33のWOX遺伝子がダイズの3つの主要なクレード(モード/WUS,中間と古代)に分割できることを示した。これらの33のWOX遺伝子のうち,いくつかは,試験組織(葉,豆莢,開放および開放花,根粒,種子,根毛,茎頂分裂組織およびシュート先端)において異なる発現パターンを示した。さらに,発現プロファイルおよびqRT-PCR分析は,GmWOX遺伝子の大部分が異なる非生物的ストレス処理(寒冷および乾燥)に応答することを示した。高再生能力ダイズ材料P3におけるGmWOX遺伝子の発現パターンに従って,GmWOX18の過剰発現を機能分析のために選択した。GmWOX18の過剰発現は,クラスタ化芽の再生能力を増加させた。結果は,ダイズにおけるWOX遺伝子の機能的同定および分析の基礎と同様に,ダイズ成長,非生物的ストレスに対する発育および応答の調節におけるWOX遺伝子の役割に関するさらなる研究のための貴重な情報を提供するであろう。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  染色体 ,  *ダイズ ,  系統樹 ,  系統発生 ,  クラスタ化 ,  *ゲノム ,  転写因子 ,  ホメオボックス遺伝子
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  ホメオドメイン ,  非生物的ストレス ,  *遺伝子ファミリー ,  過剰発現 ,  *全ゲノム解析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ダイズ ,  ホメオボックス遺伝子 ,  進化 ,  発現 ,  機能

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  発生,成長,分化  (EH02030U)

引用文献 (55件)：

• Kamiya, N.; Nagasaki, H.; Morikami, A.; Sato, Y.; Matsuoka, M. Isolation and characterization of a rice WUSCHEL-type homeobox gene that is specifically expressed in the central cells of a quiescent center in the root apical meristem. Plant J. Cell Mol. Biol. 2003, 35, 429-441.
• Mayer, K.F.; Schoof, H.; Haecker, A.; Lenhard, M.; Jurgens, G.; Laux, T. Role of WUSCHEL in regulating stem cell fate in the Arabidopsis shoot meristem. Cell 1998, 95, 805-815.
• van der Graaff, E.; Laux, T.; Rensing, S.A. The WUS homeobox-containing (WOX) protein family. Genome Biol. 2009, 10, 248.
• Haecker, A.; Gross-Hardt, R.; Geiges, B.; Sarkar, A.; Breuninger, H.; Herrmann, M.; Laux, T. Expression dynamics of WOX genes mark cell fate decisions during early embryonic patterning in Arabidopsis thaliana. Development 2004, 131, 657-668.
• Laux, T.; Mayer, K.F.; Berger, J.; Jurgens, G. The WUSCHEL gene is required for shoot and floral meristem integrity in Arabidopsis. Development 1996, 122, 87-96.

タイトルに関連する用語 (4件)： ダイズ ,  ファミリー ,  全ゲノム解析 ,  探索