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J-GLOBAL ID：202102277167705683   整理番号：21A1116093

Liquidambar formosanaの単純配列反復マーカーの開発と特性評価および遺伝的多様性解析【JST・京大機械翻訳】

Development and Characterization of Simple Sequence Repeat Markers for, and Genetic Diversity Analysis of Liquidambar formosana

著者 (8件)： Chen Siyuan (Beijing Advanced Innovation Center for Tree Breeding by Molecular Design, National Engineering Laboratory for Tree Breeding, Key Laboratory of Genetics and Breeding in Forest Trees and Ornamental Plants of Ministry of Education, Key Laboratory of Forest Trees and Ornamental Plants Biologi...) ,  Dong Mingliang (Beijing Advanced Innovation Center for Tree Breeding by Molecular Design, National Engineering Laboratory for Tree Breeding, Key Laboratory of Genetics and Breeding in Forest Trees and Ornamental Plants of Ministry of Education, Key Laboratory of Forest Trees and Ornamental Plants Biologi...) ,  Zhang Yan (Beijing Advanced Innovation Center for Tree Breeding by Molecular Design, National Engineering Laboratory for Tree Breeding, Key Laboratory of Genetics and Breeding in Forest Trees and Ornamental Plants of Ministry of Education, Key Laboratory of Forest Trees and Ornamental Plants Biologi...) ,  Zhang Yan (College of Landscape Architecture, Beijing University of Agriculture, Beijing 102206, China) ,  Qi Shuaizheng (Beijing Advanced Innovation Center for Tree Breeding by Molecular Design, National Engineering Laboratory for Tree Breeding, Key Laboratory of Genetics and Breeding in Forest Trees and Ornamental Plants of Ministry of Education, Key Laboratory of Forest Trees and Ornamental Plants Biologi...) ,  Liu Xuezeng (Henan Longyuan Flowers & Trees Co., Ltd., Yanling 461200, China) ,  Zhang Jinfeng (Beijing Advanced Innovation Center for Tree Breeding by Molecular Design, National Engineering Laboratory for Tree Breeding, Key Laboratory of Genetics and Breeding in Forest Trees and Ornamental Plants of Ministry of Education, Key Laboratory of Forest Trees and Ornamental Plants Biologi...) ,  Zhao Jian (Beijing Advanced Innovation Center for Tree Breeding by Molecular Design, National Engineering Laboratory for Tree Breeding, Key Laboratory of Genetics and Breeding in Forest Trees and Ornamental Plants of Ministry of Education, Key Laboratory of Forest Trees and Ornamental Plants Biologi...)
資料名： Forests (Web)  (Forests (Web))
巻： 11  号： 2  ページ： 203  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7188A  ISSN： 1999-4907  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Liquidambar formosana(Hamamelidaceae)は,中国に固有の高い観賞価値の比較的速い成長落葉樹である。しかし,種またはその近縁種に対する分子マーカーはほとんどない。これはゲノムおよび遺伝学的研究を妨げた。ここでは,L.formosanaのゲノム分析のための一連の転写可能発現配列タグ単純配列反復(EST-SSR)を開発した。バイオテクノロジー情報データベースの国立センターからL.formosanaトランスクリプトームの配列をダウンロードし,UnigeneライブラリーにおけるSSR遺伝子座を同定した。著者らは,34,491の組み立てられたユニジーンをマイニングすることによって,3284のEST-SSRを発見した。8つのL.formosana個体の検証のために100のランダムプライマー対を合成した。100対のうち,32は多型であった。著者らは,3つの関連Liquidambar種にわたって12のEST-SSRマーカーを成功裏に転写した。マーカーは,優れた交差種移転性を示し,液体mbarの遺伝子研究と育種を促進するであろう。3つのLiquidambar種の合計72のクローンを,3つの主クラスタにユニークに分割した。主座標解析(PCoA)はこの分割を支持した。さらに,非特異的増幅を示さない20のSSRマーカーのセットを用いて,53L.formosana樹木より遺伝子型を遺伝子型化した。対立遺伝子の平均数(Na)は5.75であり,平均多型情報量(PIC)は0.578であり,それは天然L.formosana個体群(0.390)より高かった。換言すれば,プラスL.formosana集団の遺伝的多様性は増加したが,優れた表現型特徴を維持した。プライマーはゲノムマッピング,生殖質特性化,遺伝子標識,さらに遺伝的研究にとって貴重である。L.formosanaにおける遺伝的多様性の解析は,L.formosana育種プログラムの遺伝子材料および合理的管理の効率的適用のための基礎を提供するであろう。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  遺伝子型 ,  表現型 ,  ゲノム ,  クラスタ ,  対立遺伝子 ,  クローン ,  個体群 ,  *フウ属 ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： 発現配列タグ ,  分子マーカー ,  マイクロサテライトマーカー ,  近縁種 ,  遺伝子マッピング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： EST-SSRマーカー ,  Liquidambar formosana ,  プラスツリー ,  トランスクリプトーム ,  交差増幅 ,  遺伝的多様性

分類 (2件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  植物の生化学  (EH01050J)

引用文献 (56件)：

• Zhou, G.Y. Chinese sweetgum. J. Ningbo Univ. 1995, 2, 34-41.
• Zheng, Y.Q.; Pan, B.; Itohl, T. Chemical induction of traumatic gum ducts in Chinese sweetgum, Liquidambar formosana. IAWA J. 2015, 36, 58-68.
• Merkle, S.A.; Neu, K.A.; Battle, P.J.; Bailey, R.L. Somatic embryogenesis and plantlet regeneration from immature and mature tissues of sweetgum (Liquidambar styraciflua). Plant Sci. 1998, 132, 169-178.
• Kathleen, B.P.; Ickert-Bond, S.M.; Wen, J. Anatomically preserved Liquidambar (Altingiaceae) from the middle Miocene of Yakima Canyon, Washington state, USA, and its biogeographic implications. Am. J. Bot. 2004, 91, 499-509.
• Jiang, P.C. A survey of studies on Liquidambar formosana. Guangxi Med. J. 1998, 20, 241-242.

タイトルに関連する用語 (7件)： Liquidambar ,  反復 ,  マーカー ,  開発 ,  特性評価 ,  遺伝的多様性 ,  解析