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J-GLOBAL ID：202102279021798919   整理番号：21A1373779

単一細胞レベルでの造血幹細胞のゲノム分析:細胞固定と全ゲノム増幅(WGA)プロトコルの最適化【JST・京大機械翻訳】

Genomic Analysis of Hematopoietic Stem Cell at the Single-Cell Level: Optimization of Cell Fixation and Whole Genome Amplification (WGA) Protocol

著者 (12件)： Carretta Chiara (Centre for Regenerative Medicine “S. Ferrari”, University of Modena and Reggio Emilia, 41125 Modena, Italy) ,  Mallia Selene (Centre for Regenerative Medicine “S. Ferrari”, University of Modena and Reggio Emilia, 41125 Modena, Italy) ,  Genovese Elena (Centre for Regenerative Medicine “S. Ferrari”, University of Modena and Reggio Emilia, 41125 Modena, Italy) ,  Parenti Sandra (Centre for Regenerative Medicine “S. Ferrari”, University of Modena and Reggio Emilia, 41125 Modena, Italy) ,  Rontauroli Sebastiano (Centre for Regenerative Medicine “S. Ferrari”, University of Modena and Reggio Emilia, 41125 Modena, Italy) ,  Bianchi Elisa (Centre for Regenerative Medicine “S. Ferrari”, University of Modena and Reggio Emilia, 41125 Modena, Italy) ,  Fantini Sebastian (Centre for Regenerative Medicine “S. Ferrari”, University of Modena and Reggio Emilia, 41125 Modena, Italy) ,  Sartini Stefano (Centre for Regenerative Medicine “S. Ferrari”, University of Modena and Reggio Emilia, 41125 Modena, Italy) ,  Tavernari Lara (Centre for Regenerative Medicine “S. Ferrari”, University of Modena and Reggio Emilia, 41125 Modena, Italy) ,  Tagliafico Enrico (Center for Genome Research, University of Modena and Reggio Emilia, 41125 Modena, Italy) ,  Tagliafico Enrico (Department of Medical and Surgical Sciences, University of Modena and Reggio Emilia, 41125 Modena, Italy) ,  Manfredini Rossella (Centre for Regenerative Medicine “S. Ferrari”, University of Modena and Reggio Emilia, 41125 Modena, Italy)
資料名： International Journal of Molecular Sciences (Web)  (International Journal of Molecular Sciences (Web))
巻： 21  号： 19  ページ： 7366  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7038A  ISSN： 1422-0067  CODEN： IJMCFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 単一細胞ゲノミクスは,異種細胞集団の研究のための選択の方法になり,血液学的新生物における構造とクローン進化を定義するための選択的応用を示す。したがって,腫瘍集団のクローン進化の再構築は,腫瘍の病因をより深く理解する主要な方法であるが,治療に対する反応に関して腫瘍集団の進化を理解するための可能性のあるツールである。単一細胞ゲノム解析のための前分析相は,単一細胞選別に適した細胞集団を得るために重要であり,全ゲノム増幅は,配列決定で進行するために単一細胞から必要なDNA量を得るために必要である。ここでは,単一細胞配列決定の効率および収量に対する細胞免疫染色,固定および全ゲノム増幅の異なる方法の影響を評価した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *最適化 ,  DNA【核酸】 ,  腫瘍 ,  *ゲノム ,  クローン ,  *造血幹細胞 ,  病因 ,  免疫染色
準シソーラス用語： ゲノミクス ,  血液学 ,  *単一細胞 ,  クローン進化 ,  *全ゲノム増幅 ,  細胞集団 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 単一細胞ゲノミクス ,  造血幹細胞 ,  骨髄増殖性腫瘍 ,  全ゲノム増幅 ,  単一細胞分離 ,  クローンアーキテクチャ ,  クローン不均一性

分類 (1件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

引用文献 (19件)：

• Navin, N.; Kendall, J.; Troge, J.; Andrews, P.; Rodgers, L.; McIndoo, J.; Cook, K.; Stepansky, A.; Levy, D.; Esposito, D.; et al. Tumour evolution inferred by single-cell sequencing. Nature 2011, 472, 90-U119.
• Xu, X.; Hou, Y.; Yin, X.Y.; Bao, L.; Tang, A.F.; Song, L.T.; Li, F.Q.; Tsang, S.; Wu, K.; Wu, H.J.; et al. Single-Cell Exome Sequencing Reveals Single-Nucleotide Mutation Characteristics of a Kidney Tumor. Cell 2012, 148, 886-895.
• Yu, C.; Yu, J.; Yao, X.T.; Wu, W.K.K.; Lu, Y.Y.; Tang, S.W.; Li, X.C.; Bao, L.; Li, X.X.; Hou, Y.; et al. Discovery of biclonal origin and a novel oncogene SLC12A5 in colon cancer by single-cell sequencing. Cell Res. 2014, 24, 701-712.
• Alexander, J.; Kendall, J.; McIndoo, J.; Rodgers, L.; Aboukhalil, R.; Levy, D.; Stepansky, A.; Sun, G.L.; Chobardjiev, L.; Riggs, M.; et al. Utility of Single-Cell Genomics in Diagnostic Evaluation of Prostate Cancer. Cancer Res. 2018, 78, 348-358.
• Kuipers, J.; Jahn, K.; Beerenwinkel, N. Advances in understanding tumour evolution through single-cell sequencing. Biochim. Biophys. Acta Rev. Cancer 2017, 1867, 127-138.

タイトルに関連する用語 (7件)： 単一細胞 ,  造血幹細胞 ,  細胞 ,  全ゲノム増幅 ,  WGA ,  プロトコル ,  最適化