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J-GLOBAL ID：202102279072339257   整理番号：21A0383940

急性A型大動脈解離に対する統合mRNA-miRNAネットワーク解析による調節マスター遺伝子同定と薬剤再配置【JST・京大機械翻訳】

Regulatory Master Genes Identification and Drug Repositioning by Integrative mRNA-miRNA Network Analysis for Acute Type A Aortic Dissection

著者 (7件)： Fang Junjun (Surgical Intensive Critical Care Unit, The First Affiliated Hospital, College of Medicine, Zhejiang University, Zhejiang, China) ,  Pan Zongfu (Department of Pharmacy, Zhejiang Provincial People’s Hospital, Zhejiang, China) ,  Yu Hao (Thoracic Surgery, Sir Run Run Shaw Hospital, College of Medicine, Zhejiang University, Zhejiang, China) ,  Yang Si (Department of Clinical Pharmacy, The First Affiliated Hospital, College of Medicine, Zhejiang University, Zhejiang, China) ,  Hu Xiaoping (Department of Pharmacy, Zhejiang Provincial People’s Hospital, Zhejiang, China) ,  Lu Xiaoyang (Department of Clinical Pharmacy, The First Affiliated Hospital, College of Medicine, Zhejiang University, Zhejiang, China) ,  Li Lu (Department of Clinical Pharmacy, The First Affiliated Hospital, College of Medicine, Zhejiang University, Zhejiang, China)
資料名： Frontiers in Pharmacology (Web)  (Frontiers in Pharmacology (Web))
巻： 11  ページ： 575765  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7091A  ISSN： 1663-9812  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 急性A型大動脈解離(ATAAD)は生命を脅かす疾患である。その病因と治療アプローチの理解は不明のままである。本研究では,2つのATAADデータセットGSE52093とGSE98770からの差次的発現遺伝子(DEG)をろ過した。転写因子TEAD4は,蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)ネットワークにおける重要な調節因子として予測された。加重相関ネットワーク分析(WGCNA)はGSE52093の5つのモジュールを同定し,GSE98770の4つのモジュールはATAADと高度に相関した。高相関モジュールの71のコンセンサスDEGを定義し,機能的に注釈付けした。L1000CDS2は,ATAAD治療における薬物再配置のための薬物を予測するために実行した。8つの化合物を,潜在的薬物として濾過した。統合解析は,5つの差次的に発現したmiRNAと16の標的DEGの相互作用ネットワークを明らかにした。最後に,マスターDEGをヒトATAAD試料とin vitroでのAD細胞モデルで検証した。TIMP3およびSORBS1はATAADサンプルおよびAD細胞モデルでダウンレギュレートされたが,PRUNE2はin vitroでのみ減少した。カルシウムチャンネル遮断薬とグルココルチコイド受容体アゴニストは,ATAADのための潜在的薬剤である可能性がある。本研究は,潜在的標的および根底にある分子機構ATAAD病因,予防および薬物発見を提供する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  *ネットワーク ,  *mRNA ,  *遺伝子 ,  ヒト ,  in vitro実験 ,  病因
準シソーラス用語： *マイクロRNA ,  アゴニスト ,  蛋白質間相互作用 ,  分子機構 ,  調節因子 ,  細胞モデル ,  差次的遺伝子発現 ,  *遺伝子同定 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 急性大動脈解離 ,  差次的発現遺伝子 ,  重み付き相関ネットワーク解析 ,  薬物再配置 ,  差次的に発現するmiRNA

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

引用文献 (38件)：

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• AshburnT. T.ThorK. B. (2004). Drug repositioning: identifying and developing new uses for existing drugs. Nat. Rev. Drug Discov. 3, 673-683. doi: 10.1038/nrd1468
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• CorbittH.MorrisS. A.GravholtC. H.MortensenK. H.Tippner-HedgesR.SilberbachM. (2018). Timp3 and timp1 are risk genes for bicuspid aortic valve and aortopathy in turner syndrome. PLoS Genet. 14, e1007692. doi: 10.1371/journal.pgen.1007692

タイトルに関連する用語 (10件)： 急性A型大動脈解離 ,  統合 ,  mRNA ,  miRNA ,  ネットワーク解析 ,  調節 ,  マスター ,  遺伝子同定 ,  薬剤 ,  再配置