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J-GLOBAL ID：202102279088650194   整理番号：21A0290600

モデルマメ科植物Medicago truncatulaにおける土壌起源と植物遺伝子型構造は異なるマイクロバイオーム区画【JST・京大機械翻訳】

Soil origin and plant genotype structure distinct microbiome compartments in the model legume Medicago truncatula

著者 (9件)： Brown Shawn P. (Department of Plant Biology, University of Illinois, Urbana, USA) ,  Brown Shawn P. (Department of Biological Sciences, The University of Memphis, Memphis, USA) ,  Brown Shawn P. (Center for Biodiversity Research, The University of Memphis, Memphis, USA) ,  Grillo Michael A. (Department of Plant Biology, University of Illinois, Urbana, USA) ,  Grillo Michael A. (Department of Biology, Loyola University Chicago, Chicago, USA) ,  Podowski Justin C. (Department of Plant Biology, University of Illinois, Urbana, USA) ,  Podowski Justin C. (Department of Geophysical Sciences, University of Chicago, Chicago, USA) ,  Heath Katy D. (Department of Plant Biology, University of Illinois, Urbana, USA) ,  Heath Katy D. (Carl R. Woese Institute for Genomic Biology, University of Illinois, Urbana, USA)
資料名： Microbiome (Web)  (Microbiome (Web))
巻： 8  号： 1  ページ： 1-17  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7333A  ISSN： 2049-2618  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 農業,保存,および持続可能性における重大なニーズに取り組むために,これらの相互作用を活用するために植物ミクロビオームを構造化する遺伝的および環境的因子を理解することが必要である。窒素固定根粒菌と根根粒シンビオースを形成するマメ科は,数十年間有益な植物-微生物相互作用の遺伝学と進化を理解するためのモデル植物として役立ち,植物-微生物相互作用のモデルとして付加価値を持つ。ここでは,16S rRNA遺伝子アンプリコンとショットガンメタゲノム配列決定による一般的な庭園実験を用いて,2つの自然土壌群落で生育したモデルマメ科植物Medicago truncatulaの3遺伝子型におけるミクロビオーム多様性と組成の駆動因子を研究した。細菌多様性は,外部(根圏)と内部植物区画(根端圏,根粒内圏,および葉内圏)の間で減少した。群集組成は強い区画×土壌起源と区画×植物遺伝子型相互作用によって形成され,根圏における有意な土壌起源効果と根端圏における有意な植物遺伝子型効果によって駆動された。それにもかかわらず,全ての区画はEnsifer,M.truncatulaと根根粒共生を形成する根粒菌属,および追加のショットガンメタゲノム配列決定によって支配され,根粒形成Ensiferは植物における他と遺伝的に区別できないことを示唆した。また,根粒組織に共通するOTUの手ごろいを同定し,これは根端圏からコロニー形成されるようである。著者らの結果は,宿主遺伝学によって駆動される土壌起源と内部植物区画によって駆動される根圏で,強い宿主フィルタリング効果を実証し,自然範囲で根粒菌と共存するいくつかの重要な根粒生息分類群を同定した。著者らの結果は,植物ミクロビオームのより機構的理解に向けたマメ科-rhizobium共生のペアワイズ理解の拡大を目的とした将来の機能的遺伝的実験の段階を設定した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  *遺伝 ,  *遺伝子 ,  *遺伝子型 ,  根圏 ,  根粒 ,  窒素固定 ,  *マメ科 ,  根粒菌属 ,  群落
準シソーラス用語： *Medicago truncatula ,  アンプリコン ,  コロニー形成 ,  根粒形成 ,  群集構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 一般的庭園 ,  進化 ,  遺伝的変異 ,  相利共生 ,  根粒マイクロバイオーム

分類 (2件)： 土壌生物  (FB04050N) ,  異種生物間相互作用  (EE01050A)

引用文献 (141件)：

• Annu Rev Plant Biol; Structure and functions of the bacterial microbiota of plants; D Bulgarelli, K Schlaeppi, S Spaepen, EVL Themaat, P Schulze-Lefert; 64; 2013; 807-838; citation_id=CR1
• Appl Environ Microbiol; Protection of Arabidopsis thaliana against leaf-pathogenic Pseudomonas syringae by Sphingomonas strains in a controlled model system; G Innerebner, C Knief, JA Vorholt; 77; 2011; 3202-3210; citation_id=CR2
• Nature Plants; Associations with rhizosphere bacteria can confer an adaptive advantage to plants; CH Haney, BS Samuel, J Bush, FM Ausubel; 1; 2015; 1-9; citation_id=CR3
• New Phytol; The microbiome of the leaf surface of Arabidopsis protects against a fungal pathogen; U Ritpitakphong, L Falquet, A Vimoltust, A Berger, J-P Métraux, F L’Haridon; 210; 2016; 1033-1043; citation_id=CR4
• Proc Natl Acad Sci USA; Native root-associated bacteria rescue a plant from a sudden-wilt disease that emerged during continuous cropping; R Santhanam, VT Luu, A Weinhold, J Goldberg, Y Oh, IT Baldwin; 112; 2015; E5013-E5020; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (9件)： モデル ,  マメ科植物 ,  Medicago ,  土壌 ,  起源 ,  植物 ,  遺伝子型 ,  マイクロバイオーム ,  区画