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J-GLOBAL ID：202102279240611991   整理番号：21A0162796

in vitroで異なる条件下で選択されたシプロフロキサシン耐性Acholeplasma laidlawii株のゲノムおよびプロテオームプロファイルに関するデータ【JST・京大機械翻訳】

Data on the genome and proteome profiles of ciprofloxacin-resistant Acholeplasma laidlawii strains selected under different conditions in vitro

著者 (7件)： Mouzykantov Alexey (Kazan Institute of Biochemistry and Biophysics, FRC Kazan Scientific Center of RAS, Russia) ,  Medvedeva Elena (Kazan Institute of Biochemistry and Biophysics, FRC Kazan Scientific Center of RAS, Russia) ,  Baranova Natalia (Kazan Institute of Biochemistry and Biophysics, FRC Kazan Scientific Center of RAS, Russia) ,  Lopuhov Victor (Kazan (Volga Region) Federal University, Russia) ,  Usachev Konstantin (Kazan Institute of Biochemistry and Biophysics, FRC Kazan Scientific Center of RAS, Russia) ,  Chernova Olga (Kazan Institute of Biochemistry and Biophysics, FRC Kazan Scientific Center of RAS, Russia) ,  Chernov Vladislav (Kazan Institute of Biochemistry and Biophysics, FRC Kazan Scientific Center of RAS, Russia)
資料名： Data in Brief  (Data in Brief)
巻： 33  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： W3049A  ISSN： 2352-3409  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Acoleplasma lawlawiiは,ヒト,動物,植物を感染させ,細胞培養およびワクチン製剤の主要な汚染物質である,広く超変異可能な細菌(クラスモリカット)である。この細菌の抗菌剤耐性の発達機構は細胞外小胞の分泌と関連し,抗生物質耐性決定因子の側方移動を仲介する。異なるin vitro条件下で選択したシプロフロキサシン耐性A.laidlawii株PG8r1(MIC10μg/ml)およびPG8r3(MIC10μg/ml)のゲノムプロファイルを,シプロフロキサシン感受性(MIC0.5μg/ml)A.laidlawii PG8B株を培養液培地単独のシプロフロキサシン濃度増加で培養し,シプロフロキサシン耐性(MIC 20μg/ml)A.laidlawii PG8R_10c-2株由来の小胞を用いて培養した。PG8c-3(株PG8Bの単一コロニーから得た)とPG8R10c-2のゲノムプロファイルも分析した。PG8c-3,PG8R10c-2,PG8r1およびPG8r3の細胞外小胞に含まれるキノロン標的遺伝子(gyrA,gyrB,parE,parC)のパターンを測定した。ゲノム配列決定は,NextSeq Illuminaプラットフォームで行った。単一ヌクレオチド多型の探索と注釈を,それぞれSamtoolsとSnpEffを用いて実行した。また,PG8c-3,PG8r1およびPG8r3の細胞プロテオームを比較した。2次元ゲル電気泳動とMALDI-TOF/TOF MSにより,A.layerwii株の細胞プロテオームプロファイルを測定した。本研究では,in vitroで異なる条件下で選択したシプロフロキサシン耐性株の細胞で差次的に発現した,異なるin vitro条件および蛋白質下で選択したシプロフロキサシン耐性株のゲノムに見られる一塩基多型(SNP)に関するデータを示した。Copyright 2021 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 汚染物質 ,  動物 ,  抗細菌薬 ,  細胞培養 ,  タンパク質 ,  ヒト ,  ワクチン ,  *ゲノム ,  コロニー ,  *Acholeplasma ,  *in vitro実験 ,  一塩基多型 ,  *プロテオーム ,  脂環式化合物 ,  窒素複素環化合物 ,  芳香族フッ素化合物 ,  芳香族縮合化合物 ,  ケト酸
準シソーラス用語： ゲノム配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： Acholeplasma laidlawii ,  シプロフロキサシン耐性株ゲノム ,  プロテオーム

分類 (2件)： 微生物生理一般  (EG03051L) ,  病原体に作用する抗生物質の基礎研究  (GX05020C)

物質索引 (1件)： シプロフロキサシン

タイトルに関連する用語 (5件)： シプロフロキサシン ,  耐性 ,  Acholeplasma ,  株 ,  ゲノム