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J-GLOBAL ID：202102279521764919   整理番号：21A0128842

単一細胞シークエンシングとプロテオームデータ分析に基づき,腎臓における尿酸トランスポーターの精細な発現位置を分析した。【JST・京大機械翻訳】

Analysis of precision expression localization of uric acid transporters in kidney tissues based on single cell RNA sequencing and proteome data

著者 (6件)： Chen Xiaolong (100853 北京,解放軍総医院第一医学中心腎臓病科、解放軍腎臓病研究所、腎臓疾病国家重点実験室、国家慢性腎病臨床医学研究中心、腎臓疾病研究北京市重点実験室) ,  Chi Kun (100853 北京,解放軍総医院第一医学中心腎臓病科、解放軍腎臓病研究所、腎臓疾病国家重点実験室、国家慢性腎病臨床医学研究中心、腎臓疾病研究北京市重点実験室) ,  Deng Yiyao (100853 北京,解放軍総医院第一医学中心腎臓病科、解放軍腎臓病研究所、腎臓疾病国家重点実験室、国家慢性腎病臨床医学研究中心、腎臓疾病研究北京市重点実験室) ,  Cai Guangyan (100853 北京,解放軍総医院第一医学中心腎臓病科、解放軍腎臓病研究所、腎臓疾病国家重点実験室、国家慢性腎病臨床医学研究中心、腎臓疾病研究北京市重点実験室) ,  Chen Xiangmei (100853 北京,解放軍総医院第一医学中心腎臓病科、解放軍腎臓病研究所、腎臓疾病国家重点実験室、国家慢性腎病臨床医学研究中心、腎臓疾病研究北京市重点実験室) ,  Hong Quan (100853 北京,解放軍総医院第一医学中心腎臓病科、解放軍腎臓病研究所、腎臓疾病国家重点実験室、国家慢性腎病臨床医学研究中心、腎臓疾病研究北京市重点実験室)
資料名： Zhonghua Shenbingyanjiu Dianzizazhi  (Zhonghua Shenbingyanjiu Dianzizazhi)
巻： 9  号： 4  ページ： 152-158  発行年： 2020年 
JST資料番号： C4310A  ISSN： 2095-3216  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】単一細胞配列決定,微量プロテオミクス,および免疫組織化学を用いて,腎臓尿酸輸送体の細胞分布および発現量を分析する。【方法】12の腎臓の尿酸輸送遺伝子の細胞局在と発現量は,2つの成人の健康腎臓の単細胞配列決定データセット(GSE131685)によって分析された。さらに、レーザーマイクロ切断と質量分析を用いて、ラット腎尿細管の14個の区域のタンパク質データセットの12個のタンパク質の定位と存在量を測定し、最後にProteinAtlasデータベースを用いて、上述のタンパクの腎臓における免疫組織化学染色結果を検索した。【結果】単一細胞配列決定データセットGSE131685において,12の尿酸輸送体は近位尿細管細胞に集中的に発現し,KITデータセットにおいて,ABCG2,SLC22A12およびSLC22A13を除いて,近位尿細管S1に集中的に発現した。S2とS3細胞。KEAT蛋白質データセットの分析結果はKITデータと一致した。ABCG2、SLC17A3、SLC22A12、SLC22A6とSLC22A8は近位尿細管S1、S2とS3で顕著な発現があり、特にSLC22A6はS2の腎尿細管にのみ濃縮され、ABCG2はS3段で強い濃縮がある。他の蛋白質の発現量は相対的に低かった。ProteinAtlasの免疫組織化学データは単細胞シークエンシング及びプロテオームの結果と大きな差異を示した。ABCC2、SLC17A4、SLC22A6、SLC22A11、SLC22A12、SLC22A13及びSLC2A9は近位尿細管に比較的特異的な発現定位を示し、その中にABCC2、SLC22A6、・・・SLC22A11とSLC22A13信号は強い。ABCC4、ABCG2とSLC16A9の発現量は比較的低く、特異性が悪い。結論:尿酸トランスポーターは腎臓で主に小管のS1、S2とS3細胞に集中し、プロテオームデータと単細胞シークエンシングデータは比較的近い。単細胞シークエンシングとマイクロ切断の微量蛋白の組学は蛋白の精密な定位を研究する良いツールである。本研究は、今後尿酸輸送体の機能を研究し、尿酸降下薬の開発に基礎的な根拠を提供する。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 質量分析 ,  データベース ,  遺伝子 ,  タンパク質 ,  尿細管 ,  ラット ,  定位 ,  免疫組織化学 ,  プロテオミクス ,  近位尿細管 ,  *プロテオーム
準シソーラス用語： *配列解析 ,  *尿酸トランスポーター ,  MRP2 ,  *単一細胞 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 泌尿生殖器の基礎医学  (GM01020T)

タイトルに関連する用語 (8件)： 単一細胞 ,  シークエンシング ,  プロテオーム ,  データ分析 ,  腎臓 ,  尿酸トランスポーター ,  発現 ,  分析