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J-GLOBAL ID：202102279956101866   整理番号：21A0500451

サツマイモカルコンイソメラーゼ遺伝子IbCHIのクローニングと発現特性【JST・京大機械翻訳】

Cloning and expression characteristics of chalcone isomerase gene IbCHI from Ipomoeabatatas

著者 (7件)： Rao Liping (湖北省農業科学院粮食作物研究所,湖北 武漢430064;長江大学農学院,湖北 荊州434025) ,  Su Wenjin (湖北省農業科学院粮食作物研究所,湖北 武漢430064;長江大学農学院,湖北 荊州434025) ,  Liu Yi (湖北省農業科学院粮食作物研究所,湖北 武漢430064;海南大学園芸学院, 海南 海口570228) ,  Song Tianxiao (湖北省農業科学院粮食作物研究所,湖北 武漢430064;長江大学農学院,湖北 荊州434025) ,  SOVIGUIDI Deka Reine Judess (湖北省農業科学院粮食作物研究所,湖北 武漢430064) ,  Zhang Wenying (長江大学農学院,湖北 荊州434025) ,  Yang Xinsun (湖北省農業科学院粮食作物研究所,湖北 武漢430064)
資料名： Zhiwu Ziyuan Yuhuanjing Xuebao  (Zhiwu Ziyuan Yuhuanjing Xuebao)
巻： 29  号： 6  ページ： 1-10  発行年： 2020年 
JST資料番号： C3054A  ISSN： 1674-7895  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： サツマイモ(Ipomoeabatas(Linn.)Lam.)のトランスクリプトームデータに基づき、サツマイモ品種「福菜薯7-6」(’Fucaishu7-6’)から1つのカルコンイソメラーゼをコードする遺伝子をクローニングし、IbCHIと命名した。IbCHI遺伝子の全長は732bpであり、GC含量は55.19%であり、合計243個のアミノ酸をコードしている。バイオインフォマティクス分析結果は,以下のことを示したIbCHI遺伝子がコードするアミノ酸配列は12から214位に1つのChalconeドメインを含む。IbCHI蛋白質分子はC1156H1831N291O351S7であり、理論相対分子量は25646.41であり、理論等電点はpI5.25で、1つの膜貫通螺旋領域があり、細胞核と細胞膜に定位している。そのアミノ酸配列には、24個の正電荷と27個の負電荷を持つアミノ酸残基が含まれ、アラニン、セリン、バリンとグリシンが占める割合が高く、システインが占める割合が最も低かった。IbCHI蛋白質の不安定指数と総親水性の平均係数は,それぞれ38.49と0.074であり,IbCHI蛋白質が安定な親水性蛋白質であることを示した。IbCHI蛋白質の二次構造において,αヘリックス,ランダムコイル,伸長鎖およびβターンオーバーの割合は,それぞれ39.51%,31.69%,20.16%および8.64%であった。多重アラインメント結果は,以下を示した。IbCHI遺伝子は,同属種(I.pureaLam.)とアサガオ(I.nil(Linn.)Roth)CHI遺伝子にコードされたアミノ酸配列と高度に類似しており(類似度90%以上),系統発生樹上で同じ枝に集まった。IbCHI遺伝子プロモーター領域はプロモーター基本要素TA-boxとCAAT-box、ストレス応答要素、ジャスモン酸メチル応答要素と光応答要素などの26個のシス作用要素を含む。qRT-PCR分析結果は以下のことを示した。IbCHI遺伝子は4つのサツマイモ品種「EC15」、「EC16」、「福菜薯18」(’Fucaishu18’)と「福菜薯7-6」の根、茎先と葉に発現があったが、異なる品種と器官間の相対発現量には明らかな差があった。そのうち、「福菜薯7-6」の茎と葉中のIbCHI遺伝子の相対発現量はその他の3品種より明らかに高かった。30%PEG6000と0.2molL-1NaClの乾燥処理の後,IbCHI遺伝子の発現は,最初減少し,次に増加した。24時間処理後,この遺伝子の相対的発現量は有意に増加した(P<0.05)。総合分析の結果、サツマイモIbCHIタンパク質はChalconeスーパーファミリーに属し、高い保守性を持ち、IbCHI遺伝子の発現は組織や品種特異性を持ち、サツマイモの非生物的ストレスに対する応答過程の調節に重要な役割を果たしていることが分かった。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 分子量 ,  アミノ酸 ,  アミノ酸配列 ,  *遺伝子 ,  *サツマイモ ,  タンパク質 ,  系統樹 ,  二次構造 ,  品種 ,  プロモーター領域 ,  アミノ酸残基 ,  脂肪族アミン ,  チオール ,  脂肪族カルボン酸 ,  含硫アミノ酸 ,  第一アミン
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  αヘリックス ,  *クローニング , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

物質索引 (1件)： システイン

タイトルに関連する用語 (5件)： サツマイモ ,  カルコンイソメラーゼ ,  遺伝子 ,  クローニング ,  発現