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J-GLOBAL ID：202102280016171870   整理番号：21A2842458

dsRNA-Seq:dsRNAの精製および配列決定によるウイルス感染の同定【JST・京大機械翻訳】

dsRNA-Seq: Identification of Viral Infection by Purifying and Sequencing dsRNA

著者 (13件)： Decker Carolyn J. (Department of Biochemistry, University of Colorado, Boulder, CO 80303, USA) ,  Decker Carolyn J. (Howard Hughes Medical Institute, University of Colorado, Boulder, CO 80303, USA) ,  Steiner Halley R. (Department of Biochemistry, University of Colorado, Boulder, CO 80303, USA) ,  Hoon-Hanks Laura L. (Department of Microbiology, Immunology, and Pathology, Colorado State University, Fort Collins, CO 80523, USA) ,  Morrison James H. (Division of Infectious Diseases, University of Colorado School of Medicine, Aurora, CO 80045, USA) ,  Haist Kelsey C. (Department of Immunology and Microbiology, University of Colorado School of Medicine, Aurora, CO 80045, USA) ,  Stabell Alex C. (Department of Molecular, Cellular and Developmental Biology, University of Colorado, Boulder, CO 80302, USA) ,  Poeschla Eric M. (Division of Infectious Diseases, University of Colorado School of Medicine, Aurora, CO 80045, USA) ,  Morrison Thomas E. (Department of Immunology and Microbiology, University of Colorado School of Medicine, Aurora, CO 80045, USA) ,  Stenglein Mark D. (Department of Microbiology, Immunology, and Pathology, Colorado State University, Fort Collins, CO 80523, USA) ,  Sawyer Sara L. (Department of Molecular, Cellular and Developmental Biology, University of Colorado, Boulder, CO 80302, USA) ,  Parker Roy (Department of Biochemistry, University of Colorado, Boulder, CO 80303, USA) ,  Parker Roy (Howard Hughes Medical Institute, University of Colorado, Boulder, CO 80303, USA)
資料名： Viruses (Web)  (Viruses (Web))
巻： 11  号： 10  ページ： 943  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7293A  ISSN： 1999-4915  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： RNAウイルスは世界中の新興および再出現感染症の主要源である。RNAウイルスが二本鎖RNA(dsRNA)を複製するという事実に基づくRNAウイルスを同定する方法を開発した。感染組織から分離した全RNAからのdsRNAの精製と配列決定は,一本鎖RNA(ssRNA)ウイルスからdsRNAウイルス配列と複製配列の回復を可能にした。このアプローチをdsRNA-Seqと呼ぶ。コンティグにdsRNA配列を組み立てることによって,哺乳類の培養試料に感染する様々なゲノムタイプの全長または部分的RNAウイルスゲノムを同定し,実験室感染マウスにおける既知のウイルス病薬を同定し,爬虫類における自然発生RNAウイルス感染を成功裏に検出した。ここでは,dsRNA-Seqがゲノムおよび/または市販のrRNA枯渇試薬を配列決定する生物のウイルスを同定するための好ましい方法であることを示した。加えて,この方法の重要な利点は,ssRNAウイルスの複製ウイルス配列を同定する能力であり,これは感染性ウイルス薬剤を潜在的非感染性ウイルス粒子または汚染物質から区別するのに有用である。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 汚染物質 ,  *RNA【核酸】 ,  rRNA ,  *ウイルス感染 ,  哺乳類 ,  ウイルス感染症 ,  爬虫類 ,  ゲノム ,  RNAウイルス ,  感染症 ,  ビリオン ,  *二本鎖RNA
準シソーラス用語： ウイルスゲノム ,  一本鎖RNA ,  感染性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： dsRNA ,  二本鎖RNA ,  新興疾患 ,  新興ウイルス ,  RNAウイルス ,  RNA-Seq

分類 (5件)： ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y) ,  微生物検査法  (EG02020G) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  生物科学研究法一般  (EA03010K) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (53件)：

• Rosenberg, R. Detecting the emergence of novel, zoonotic viruses pathogenic to humans. Cell Mol. Life Sci. 2015, 72, 1115-1125.
• Howard, C.R.; Fletcher, N.F. Emerging virus diseases: Can we ever expect the unexpected? Emerg. Microbes Infect. 2012, 1, 1-11.
• Marston, H.D.; Felkers, G.K.; Morens, D.M.; Fauci, A.S. Emerging Viral Diseases: Confronting Threats with New Technologies. Sci. Transl. Med. 2014, 6, 1-7.
• Rojas, M.R.; Gilbertson, R.L. Emerging Plant Viruses: A Diversity of Mechanisms and Opportunities. In Plant Virus Evolution; Roossinck, M.J., Ed.; Springer: Berlin/Heidelberg, Germany, 2008; pp. 27-51.
• Nicaise, V. Crop immunity against viruses: Outcomes and future challenges. Front. Plant Sci. 2014, 5, 660.

タイトルに関連する用語 (4件)： dsRNA ,  精製 ,  ウイルス感染 ,  同定