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J-GLOBAL ID：202102280099362482   整理番号：21A2060857

ハイブッシュブルーベリー遺伝子型および交差誘導体における遺伝的関連性および親系統分布を明らかにする遺伝子型決定を用いた混合解析【JST・京大機械翻訳】

Admixture Analysis Using Genotyping-by-Sequencing Reveals Genetic Relatedness and Parental Lineage Distribution in Highbush Blueberry Genotypes and Cross Derivatives

著者 (8件)： Kulkarni Krishnanand P. (Department of Agriculture and Natural Resources, Delaware State University, Dover, DE 19901, USA) ,  Vorsa Nicholi (Department of Plant Biology, Rutgers University, New Brunswick, NJ 08901, USA) ,  Vorsa Nicholi (Philip E. Marucci Center for Blueberry and Cranberry Research and Extension, Chatsworth, NJ 08019, USA) ,  Natarajan Purushothaman (Department of Biology, West Virginia State University, Institute, WV 25112, USA) ,  Elavarthi Sathya (Department of Agriculture and Natural Resources, Delaware State University, Dover, DE 19901, USA) ,  Iorizzo Massimo (Department of Horticultural Science and Plants for Human Health Institute, NC State University, Kannapolis, NC 28081, USA) ,  Reddy Umesh K. (Department of Biology, West Virginia State University, Institute, WV 25112, USA) ,  Melmaiee Kalpalatha (Department of Agriculture and Natural Resources, Delaware State University, Dover, DE 19901, USA)
資料名： International Journal of Molecular Sciences (Web)  (International Journal of Molecular Sciences (Web))
巻： 22  号： 1  ページ： 163  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7038A  ISSN： 1422-0067  CODEN： IJMCFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ブルーベリー(Vaccinium section Cyanococcus)は食用果実に広く栽培されている多年生潅木である。本研究において,著者らは,北部ハイブッシュ(NHB,主にV.corymbosum)と南部ハイブッシュ(SHB,V.corymbosumのV.darrowii,V.virgatum,またはV.tenellum)ブルーベリー遺伝子型,およびBNJ16-5交雑(V.corymbosum V.darrowii)の子孫の,混合と遺伝的関連性解析を行った。遺伝子タイピング(GBS)を用いて,334百万以上の読取(75bp)を発生した。GBS読取をV.corymbosum cv.Draper v1.0参照ゲノム配列に整列させ,ΔΨ2.8百万読み取りをマッピングすることに成功した。配列から,主成分,ハプロタイプおよび混和分析に用いた2,44,039の一塩基多型を同定した。主成分分析は3つの主なグループを明らかにした。1)NHB品種,2)SHB品種,3)BNJ16-5子孫。NHBおよびSHB品種に対する全体的固定指数(FST)およびヌクレオチド多様性は,広い遺伝的分化を示し,ハプロタイプ分析は,SHB品種がNHB品種より遺伝的に多様であることを明らかにした。混和分析は,親のゲノム移入の様々な系統の混合物を同定した。本研究は,遺伝的関連性を明らかにし,ブルーベリーにおける親系統を調べるために,遺伝的および混和分析におけるGBS由来単一ヌクレオチド多型マーカーの有効性を実証し,将来の育種計画に有用である可能性がある。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝 ,  *遺伝子型 ,  *ブルーベリー ,  ゲノム ,  交雑 ,  品種 ,  灌木 ,  主成分分析 ,  ハプロタイプ ,  スノキ属 ,  一塩基多型 ,  種分化
準シソーラス用語： ゲノム配列 ,  ハプロタイプ分析 ,  ヌクレオチド多様性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Vaccinium ,  混合物分析 ,  遺伝子タイピング ,  遺伝的関連性

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (49件)：

• Galletta, G.; Ballington, J. Blueberries, cranberries and lingonberries. Fruit Breed. 1996, 2, 107.
• Ratnaparkhe, M.B. Blueberry. In Fruits and Nuts; Springer: Berlin/Heidelberg, Germany, 2007; pp. 217-227.
• Die, J.V.; Rowland, L.J. Advent of genomics in blueberry. Mol. Breed. 2013, 32, 493-504.
• Yang, B.; Kortesniemi, M. Clinical evidence on potential health benefits of berries. Curr. Opin. Food Sci. 2015, 2, 36-42.
• Kalt, W.; Cassidy, A.; Howard, L.R.; Krikorian, R.; Stull, A.J.; Tremblay, F.; Zamora-Ros, R. Recent research on the health benefits of blueberries and their anthocyanins. Adv. Nutr. 2020, 11, 224-236.

タイトルに関連する用語 (9件)： ハイブッシュブルーベリー ,  遺伝子型 ,  交差 ,  誘導体 ,  遺伝的関連性 ,  系統 ,  分布 ,  遺伝子型決定 ,  解析