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J-GLOBAL ID：202102280435206683   整理番号：21A0044019

胃癌代謝に対するHER2遺伝子の影響を,遺伝子セット濃縮分析により検討した。【JST・京大機械翻訳】

Study on the impact of HER2 expression on the metabolism of gastric cancer with gene set enrichment analysis

著者 (6件)： Liu Hu (中国科学技術大学附属第一医院西区,安徽省腫瘤医院腫瘤化療科,合肥230031) ,  Wu Sihan (中国科学技術大学附属第一医院西区,安徽省腫瘤医院腫瘤化療科,合肥230031) ,  Bao Chuyang (安徽医科大学第一附属医院腫瘤内科,合肥230022) ,  Li Wenjuan (中国科学技術大学附属第一医院西区,安徽省腫瘤医院腫瘤化療科,合肥230031) ,  Zhou Shoubing (中国科学技術大学附属第一医院西区,安徽省腫瘤医院腫瘤化療科,合肥230031) ,  Jin Wei (中国科学技術大学附属第一医院西区,安徽省腫瘤医院腫瘤化療科,合肥230031)
資料名： Anhui Yike Daxue Xuebao  (Anhui Yike Daxue Xuebao)
巻： 55  号： 9  ページ： 1339-1342,1349  発行年： 2020年 
JST資料番号： C3527A  ISSN： 1000-1492  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】ヒト上皮成長因子受容体2(HER2)の遺伝子発現状態による胃癌代謝経路への影響を,遺伝子集合濃縮分析(GSEA)によって調査する。【方法】癌ゲノム地図(TCGA),遺伝子発現合成データベース(GEO),およびヨーロッパ生物情報研究所(ArrayExpress)データベースの胃癌転写発現データベースをダウンロードし,Her2コピー数または発現レベルに従って高低発現群を選択した。GSEAソフトウェアで濃縮分析を行い、エラー発見率q値(FDRqval)<25%と/または名義P値(nomPval)0.01の代謝経路を意味のある代謝遺伝子セットとし、その結果、熱図を描いて共通性を探す。【結果】Her2の高低発現は,癌ゲノム地図の胃腺癌集合(TCGASTAD)およびGEOデータセット(GSE66229)の10のデータベースにおいて,ペルオキシドの酵素体,および,Her2の過剰発現に関連があった。N-グリカン生合成とピリミジン代謝経路遺伝子集合は影響(FDRqval<25%,nomPval),グリコシルホスファチジルイノシトール,グリセロリン脂質,スフィンゴ脂質代謝に統計学的有意差があった(nomPval<0.01)。結論:複数のデータベースのGSEA分析結果により、癌遺伝子Her2の状態は複数の代謝経路遺伝子セットと相関性があることが示唆された。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  酵素 ,  生合成 ,  ペルオキシド ,  *遺伝子 ,  ヒト ,  ゲノム ,  代謝経路 ,  ソフトウェア ,  遺伝子発現 ,  *胃腫瘍 ,  EGF受容体 ,  窒素複素環化合物
準シソーラス用語： グリコシルホスファチジルイノシトール ,  過剰発現 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  消化器の腫よう  (GH04000D)

物質索引 (1件)： ピリミジン

タイトルに関連する用語 (6件)： 胃癌 ,  代謝 ,  HER2遺伝子 ,  遺伝子 ,  濃縮 ,  分析