文献

J-GLOBAL ID：202102280439814956   整理番号：21A0288798

共生相互作用のオントロジー表現への現実主義に基づくアプローチ【JST・京大機械翻訳】

A realism-based approach to an ontological representation of symbiotic interactions

著者 (4件)： Diller Matthew (Department of Health Outcomes and Biomedical Informatics, University of Florida, Gainesville, USA) ,  Johnson Evan (Department of Health Outcomes and Biomedical Informatics, University of Florida, Gainesville, USA) ,  Hicks Amanda (Applied Physics Laboratory, Johns Hopkins University, Baltimore, USA) ,  Hogan William R. (Department of Health Outcomes and Biomedical Informatics, University of Florida, Gainesville, USA)
資料名： BMC Medical Informatics and Decision Making (Web)  (BMC Medical Informatics and Decision Making (Web))
巻： 20  号： 1  ページ： 1-15  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7433A  ISSN： 1472-6947  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 環境中のヒトと生物の間で起こる共生相互作用は,我々の健康に多大な影響を与える。最近,微生物病原体に対するミクロビオームとヒト健康と宿主免疫との間の複雑な関係の理解に関心が寄せられている。これらの相互作用とそれらの複雑性についてのデータを収集・管理するために,科学者は現実に起こるので共生相互作用を表すオントロジーを必要とする。著者らは,生物学および生態学文献および突出した教科書における「共生および関連用語の利用をレビューした2つの論文から始めた。次に,本レビュー論文によって同定された現在の科学的利用に従って,それらが適切に定義されているかどうかを決定するために,共生相互作用の表現を含むいくつかの顕著な標準用語とオントロジーを分析した。プロセスにおいて,著者らは,共生相互作用のいくつかのサブタイプ,ならびにそれらを区別する特性を同定し,相互作用の各サブタイプに対するテキストおよび公理の定義を提案した。オントロジー表現と定義をいかに利用するかについて説明し,重要な定義に関する付加的品質保証を創造し,著者らは,生物間の共生相互作用を含む3つのシナリオの異なった追跡解析と表現を実施した。著者らは,生物学と生態学における科学的利用の広大な優勢と一致する既存のオントロジーにおける「共生の1つの定義を見出した。しかし,オントロジーは我々の研究の過程でその定義を変化させ,議論が進行中である。著者らが提案した新しい定義を提示した。また,共生の34のサブタイプを定義した。著者らの異なる追跡分析は,生物が1つの生物との共生の1つのタイプに参加し,異なる生物との共生のもう1つのタイプに関与できる複雑な性質のため,個々のレベルではなく個々のレベルで共生相互作用を定義する必要があることを示した。ここでの努力の結果として,既存の生物医学オントロジーのギャップを埋めるリアリズムに基づくアプローチを用いた共生相互作用のロバストな表現を開発した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *相互作用 ,  品質保証 ,  微生物 ,  ヒト ,  公理 ,  病原体 ,  生態学 ,  ロバスト性 ,  *オントロジー
準シソーラス用語： 複雑性 ,  常在菌叢ゲノム ,  宿主免疫 ,  生物医学オントロジー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： オントロジー ,  共生 ,  現実主義 ,  宿主-病原体相互作用

分類 (1件)： 異種生物間相互作用  (EE01050A)

引用文献 (32件)：

• MMWR Morb Mortal Wkly Rep; Vital signs: trends in reported Vectorborne disease cases - United States and territories, 2004-2016; R Rosenberg; 67; 2018; 496; 10.15585/mmwr.mm6717e1; citation_id=CR1
• Front Genet; Microbiome research is becoming the key to better understanding health and nutrition; D Hadrich; 9; 2018; 212; 10.3389/fgene.2018.00212; citation_id=CR2
• Die Erscheinung der Symbiose; 1879; CR3; citation_author=A Bary
• Am Nat; Symbiosis and mutualism; R Pound; 27; 1893; 12; 10.1086/275742; citation_id=CR4
• Int J Biol; Current usage of Symbiosis and associated terminology; BD Martin, E Schwab; 5; 2012; 32; 10.5539/ijb.v5n1p32; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (4件)： 共生 ,  相互作用 ,  オントロジー ,  表現