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J-GLOBAL ID：202102280705258884   整理番号：21A0077436

比較トランスクリプトームとメタボロミクスプロファイリングはタバコ葉の発生動態の基礎となる複雑な機構を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Comparative transcriptome and metabolomic profiling reveal the complex mechanisms underlying the developmental dynamics of tobacco leaves

著者 (23件)： Chang Wei (College of Agronomy and Biotechnology, Southwest University, Beibei, Chongqing 400715, China) ,  Zhao Huina (Molecular Genetics Key Laboratory of China Tobacco, Guizhou Academy of Tobacco Science, Guiyang 550081, China) ,  Zhao Huina (Upland Flue-Cured Tobacco Quality and Ecology Key Laboratory of China Tobacco, Guizhou Academy of Tobacco Science, Guiyang 550081, China) ,  Yu Shizhou (Molecular Genetics Key Laboratory of China Tobacco, Guizhou Academy of Tobacco Science, Guiyang 550081, China) ,  Yu Jing (Molecular Genetics Key Laboratory of China Tobacco, Guizhou Academy of Tobacco Science, Guiyang 550081, China) ,  Cai Kai (Molecular Genetics Key Laboratory of China Tobacco, Guizhou Academy of Tobacco Science, Guiyang 550081, China) ,  Cai Kai (Upland Flue-Cured Tobacco Quality and Ecology Key Laboratory of China Tobacco, Guizhou Academy of Tobacco Science, Guiyang 550081, China) ,  Sun Wei (College of Agronomy and Biotechnology, Southwest University, Beibei, Chongqing 400715, China) ,  Liu Xumei (College of Agronomy and Biotechnology, Southwest University, Beibei, Chongqing 400715, China) ,  Li Xiaodong (College of Agronomy and Biotechnology, Southwest University, Beibei, Chongqing 400715, China) ,  Yu Mengna (College of Agronomy and Biotechnology, Southwest University, Beibei, Chongqing 400715, China) ,  Ali Shahzad (College of Agronomy and Biotechnology, Southwest University, Beibei, Chongqing 400715, China) ,  Zhang Kai (College of Agronomy and Biotechnology, Southwest University, Beibei, Chongqing 400715, China) ,  Qu Cunmin (College of Agronomy and Biotechnology, Southwest University, Beibei, Chongqing 400715, China) ,  Qu Cunmin (Academy of Agricultural Sciences, Southwest University, Chongqing 400715, China) ,  Qu Cunmin (Engineering Research Center of South Upland Agriculture, Ministry of Education, Chongqing 400715, China) ,  Lei Bo (Molecular Genetics Key Laboratory of China Tobacco, Guizhou Academy of Tobacco Science, Guiyang 550081, China) ,  Lei Bo (Upland Flue-Cured Tobacco Quality and Ecology Key Laboratory of China Tobacco, Guizhou Academy of Tobacco Science, Guiyang 550081, China) ,  Lei Bo (College of Life Sciences, Yangtze University, Jingzhou 434025, Hubei, China) ,  Lu Kun (College of Agronomy and Biotechnology, Southwest University, Beibei, Chongqing 400715, China) ,  Lu Kun (Academy of Agricultural Sciences, Southwest University, Chongqing 400715, China) ,  Lu Kun (Engineering Research Center of South Upland Agriculture, Ministry of Education, Chongqing 400715, China) ,  Lu Kun (College of Life Sciences, Yangtze University, Jingzhou 434025, Hubei, China)
資料名： Genomics  (Genomics)
巻： 112  号： 6  ページ： 4009-4022  発行年： 2020年 
JST資料番号： T0422A  ISSN： 0888-7543  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 葉は大部分の植物で最も重要な光合成器官であるが,葉の発育動態の根底にある多くの分子機構は調査されていない。葉発生に関与する転写調節機構をより良く理解するために,タバコ(Nicotiana tabacum)植物上の7つの位置からの葉の比較トランスクリプトミクスとメタボローム分析を実施した。合計35,622のユニークな差次的発現遺伝子と79の代謝産物を同定した。時系列発現解析により,葉発生時に継続的なアップレギュレーションを示す10,197の遺伝子から成る2つの興味深い転写プロファイル,および継続的なダウンレギュレーションを示す4696の遺伝子から成る他の2つの転写プロファイルを検出した。これらのデータを共発現ネットワーク結果と組み合わせて,光呼吸とトリカルボン酸サイクルに関与する4つの重要な調節ネットワークを同定した。これらのネットワークは,葉発達中の炭素/窒素バランスを調節する可能性がある。また,転写因子NtGATA5は植物ホルモンの調節を通して葉発生時のCおよびN代謝および葉緑体発生と関連するハブとして作用することを見出した。さらに,タバコ葉発生時のオーキシン,サイトカイニンおよびジャスモン酸生合成およびシグナル伝達経路に関与する遺伝子の転写動力学を調べた。全体として,著者らの研究は,植物葉における発育動態を制御する調節ネットワークの理解を大きく拡大した。Copyright 2021 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ネットワーク ,  *タバコ ,  遺伝子 ,  オーキシン ,  サイトカイニン ,  ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション ,  転写因子 ,  *トランスクリプトーム ,  オレフィン化合物 ,  脂環式ケトン ,  ケト酸
準シソーラス用語： *メタボロミクス ,  トランスクリプトーム解析 ,  メタボローム ,  共発現 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Nicotiana tabacum ,  RNA配列決定 ,  メタボロミクスプロファイリング ,  共発現ネットワーク ,  葉の発達

分類 (2件)： 植物生理学一般  (EH02010Y) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

物質索引 (1件)： ジャスモン酸

タイトルに関連する用語 (3件)： トランスクリプトーム ,  タバコ葉 ,  基礎