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J-GLOBAL ID：202102280773689004   整理番号：21A0104849

フルボ酸による低酸素誘導ヒト網膜微小血管内皮細胞遺伝子発現プロファイルのMiSeqシークエンシング分析【JST・京大機械翻訳】

MiSeq analysis of gene expression profiles in human retinal capillary endothelial cells induced by fulvic acid

著者 (5件)： Xu Manhong (天津医科大学眼科医院、眼視光学院、眼科研究所 天津市視网膜功能与疾病重点実験室天津市眼科学与視覚科学国際聯合研究中心 300384) ,  Dong Lijie (天津医科大学眼科医院、眼視光学院、眼科研究所 天津市視网膜功能与疾病重点実験室天津市眼科学与視覚科学国際聯合研究中心 300384) ,  Wang Linni (天津医科大学眼科医院、眼視光学院、眼科研究所 天津市視网膜功能与疾病重点実験室天津市眼科学与視覚科学国際聯合研究中心 300384) ,  Huang Xinyuan (天津医科大学眼科医院、眼視光学院、眼科研究所 天津市視网膜功能与疾病重点実験室天津市眼科学与視覚科学国際聯合研究中心 300384) ,  Li Xiaorong (天津医科大学眼科医院、眼視光学院、眼科研究所 天津市視网膜功能与疾病重点実験室天津市眼科学与視覚科学国際聯合研究中心 300384)
資料名： Zhonghua Yandibing Zazhi  (Zhonghua Yandibing Zazhi)
巻： 36  号： 10  ページ： 795-803  発行年： 2020年 
JST資料番号： C2304A  ISSN： 1005-1015  CODEN： ZYAZEE  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:フルボ酸(FA)による低酸素誘導ヒト網膜微小血管内皮細胞(hRMEC)遺伝子発現プロファイルのMiSeqシークエンシング分析結果を観察する。方法:hRMECを体外培養し、低酸素群(低酸素処理)とFA介入群(即ち低酸素後FA干渉)に分けた。hRMEC活性に及ぼすFAの影響をMTT比色分析で測定した。FAの最適な作用濃度を選択し、リアルタイム蛍光定量PCR(RT-PCR)により、FAが低酸素誘導hRMECにおける細胞間接着分子-1(ICAM-1)、IL-1β、IL-4、IL-6、IL-8、IL-10、MMP-2、IL-6、IL-10、MMP-2、IL-10、IL-6、IL-8、IL-10、ILTNF-α,TNF-βなどの炎症因子および炎症関連因子mRNA発現の影響。対数増殖期にある低酸素群とFA介入群細胞を収集し、MiSeqシークエンシング技術を用いて、両群の細胞に対して全トランスクリプトームシークエンシングを行い、生物学的大データを獲得し、それに基づいて差異発現miRNAを分析した。遺伝子注釈(GO)機能の著しい濃縮分析及び京都遺伝子とゲノム百科全書(KEGG)経路の顕著性濃縮分析を通じて、差異miRNAの機能及びシグナル経路を分析した。炎症因子と炎症関連因子の発現を比較した場合,miRNAmicにより細胞中のmiRNAの発現レベルを調節し,細胞機能への影響を観察し,このmiRNAの作用を判断した。結果:異なる濃度及び異なる作用様式のFAはhRMECの細胞活性に影響を及ぼさなかった。RT-PCT検査の結果,低酸素群のhRMECにおけるICAM-1,IL-1β,IL-6およびTNF-βのmRNA発現は,正常群に比して有意に高かった(t=3.426,6.011,5.282,6.500)。P=0.027,0.004,0.006,0.003;hRMECにおけるICAM-1,IL-6,TNF-αおよびTNF-βのmRNA発現は,酸素欠乏群に比して有意に低かった(t=9.961,3.676,3.613,3.387,P=0.001,P<0.05)。021,0.023,0.028)。低酸素群とFA介入群の間に14個の差次的発現miRNAがあり,そのうち9個は上方制御遺伝子,5個はダウンレギュレーション遺伝子であった。全部で4つの差次的miRNA(hsa-miR-1285-3p,hsa-miR-30d-3p,hsa-miR-3170,hsa-miR-7976)の予測標的遺伝子はすべてICAM-1であった。GO機能の著しい濃縮分析結果により、差異遺伝子の機能は主に細胞発育、細胞分化と単生物発育過程中に濃縮された。KEGG経路の顕著性濃縮分析結果により、差次的miRNAの発現が高度に濃縮されたのは、癌におけるプロテオグリカン経路とサイトカイン-サイトカイン受容体相互作用経路であり、差次的発現は比較的明らかで、アラキドン酸代謝経路とアンフェタミン中毒性経路であることが明らかになった。結論:FAは複数のmiRNAの発現を調節することにより、下流ICAM-1mRNAの発現量に影響を与え、低酸素によるhRMEC後の細胞の炎症状態への影響を影響する。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 蛍光 ,  相互作用 ,  *遺伝子 ,  炎症 ,  ヒト ,  *酸素欠乏 ,  代謝経路 ,  ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション ,  細胞分化 ,  インターロイキン1
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  *配列解析 ,  mRNA発現 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 眼の基礎医学  (GP01020C)

タイトルに関連する用語 (9件)： フルボ酸 ,  低酸素 ,  誘導 ,  ヒト ,  網膜 ,  微小血管内皮細胞 ,  遺伝子発現プロファイル ,  シークエンシング ,  分析