インド,ニューデリーにおける急性散発性胃腸炎の小児におけるノロウイルスおよびサポウイルスの遺伝的多様性【JST・京大機械翻訳】

Rachakonda Girish; Choudekar Avinash; Parveen Shama; Bhatnagar Shinjini; Patwari Ashok; Broor Shobha

文献

J-GLOBAL ID：202102281011922085 整理番号：21A2910857

インド,ニューデリーにおける急性散発性胃腸炎の小児におけるノロウイルスおよびサポウイルスの遺伝的多様性【JST・京大機械翻訳】

Genetic diversity of noroviruses and sapoviruses in children with acute sporadic gastroenteritis in New Delhi, India

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資料名：
巻： 43 号： 1 ページ： 42-48 発行年： 2008年
JST資料番号： W3241A ISSN： 1386-6532 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

ヒトカリシウイルス(HuCV)は世界中で胃腸炎を引き起こす。インドを含む発展途上国からのカリシウイルスの分子疫学について,限られた情報が利用できる。HuCVsのための2段階多重RT-PCRアッセイの標準化と評価と菌株の特性化。インド,ニューデリーのAGEの子供におけるHuCVの有病率と多様性を研究するために,226の便サンプルを1年間と半年間にわたり急性胃腸炎(AGE)の子供から採取した。RdRp遺伝子からの3セットの外部および4セットの内部プライマーを用いた多重2段階RT-PCRを,NoVおよびSaVの検出のために標準化した。いくつかのHuCV株の分子特性化を配列決定とそれに続く系統発生分析によって行った。59のHuCVs株は,試料の54(24%)で検出された。5試料は混合感染を有した。これらの59のHuCVのうち,36(61%)はノロウイルス(34はGGII,2はGGI),23(39%)はサポウイルス(22はGGI,1はGGII)であった。12のHuCV株の部分RdRp遺伝子の系統解析により,NoVにおける3つの遺伝子型(GGI/4,GGII/3および新たに同定されたGIIb/Hilversumクラスタ)およびSaVにおける1つの遺伝子型(GGI/1)を同定した。これは,多重RT-PCRアッセイによるHuCVの検出と特性化に関するインドからの少数の報告の1つである。このアッセイはHuCV感染の疫学研究に有用なツールである。Copyright 2021 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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微生物検査法 , 感染症・寄生虫症の診断 , 消化器の疾患 , 食品衛生一般 , 感染症・寄生虫症一般

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