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J-GLOBAL ID：202102281903068623   整理番号：21A2844104

ブラジル,Pantanalにおける自然感染馬から得たウマ伝染性Anemiaウイルスの高いゲノム変動:流行地域の場合【JST・京大機械翻訳】

High Genomic Variability in Equine Infectious Anemia Virus Obtained from Naturally Infected Horses in Pantanal, Brazil: An Endemic Region Case

著者 (10件)： Malossi Camila Dantas (Institute for Biotechnology, Sao Paulo State University (Unesp), Botucatu 18607-440, Brazil) ,  Fioratti Eduardo Gorzoni (Agrarian Sciences Institute (ICA), Vales do Jequitinhonha e Mucuri Federal University (UFVJM), Unai 39803-371, Brazil) ,  Cardoso Jedson Ferreira (Center for Technological Innovation, Evandro Chagas Institute, Ananindeua 67030-000, Brazil) ,  Magro Angelo Jose (Institute for Biotechnology, Sao Paulo State University (Unesp), Botucatu 18607-440, Brazil) ,  Kroon Erna Geessien (Virology Laboratory, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte 31270-901, Brazil) ,  Aguiar Daniel Moura de (Virology and Rickettsiosis Laboratory, Mato Grosso Federal University, Cuiaba 78060-900, Brazil) ,  Borges Alice Mamede Costa Marque (Virology and Rickettsiosis Laboratory, Mato Grosso Federal University, Cuiaba 78060-900, Brazil) ,  Nogueira Marcia Furlan (EMBRAPA Pantanal, Corumba 79320-900, Brazil) ,  Ullmann Leila Sabrina (Institute for Biotechnology, Sao Paulo State University (Unesp), Botucatu 18607-440, Brazil) ,  Araujo Joao Pessoa, Jr. (Institute for Biotechnology, Sao Paulo State University (Unesp), Botucatu 18607-440, Brazil)
資料名： Viruses (Web)  (Viruses (Web))
巻： 12  号： 2  ページ： 207  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7293A  ISSN： 1999-4915  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ウマ感染性貧血ウイルス(EIAV)はウマ感染性貧血(EIA)を引き起こす持続性レンチウイルスである。ブラジルでは,EIAVはパンタナール地域の風土病であり,安楽死はこの地域で必須ではない。野外ウイルスからの完全なゲノム配列の全ては,北アメリカ,アジア,およびヨーロッパからであり,プロウイルスゲノム配列だけが利用可能である。ブラジルEIAVからの配列は,現在,gagおよびLTR領域に対してのみ利用可能である。従って,本研究はブラジルの風土病地域由来の自然感染ウマにおける全EIAVゲノムRNAの配列を初めて行った。自然感染ウマからの血漿中のRNAを次世代シークエンシング(NGS)に用い,ギャップをサンガー配列決定法を用いて充填した。2頭のウマからのEIAVの完全なウイルスゲノムを得て,注釈付けした(Access number:MN56070とMN560971)。推定遺伝子を分析し,以前に記述した遺伝子と比較し,gagとpol遺伝子の保存とLTRとenv配列の高い変異を示した。アミノ酸変化はp26蛋白質において同定され,診断に用いられる最も一般的な標的の1つであり,p26分子モデリングはいくつかのエピトープにおける表面アミノ酸変化を示した。ブラジルのゲノム配列は,EIAV Liaoning,Wyoming,アイルランド,およびイタリアの分離株のような主要な野外株で,1つと75.8から77.3%と88.6%のヌクレオチド同一性を示した。さらに,系統発生分析は,このブラジル株が別の単系統群から成ることを示唆した。これらの結果は,EIAVをよりよく特性化することを助け,風土病地域におけるEIAの診断および制御の課題を克服した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 血漿 ,  アミノ酸 ,  RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  タンパク質 ,  ヌクレオチド ,  貧血 ,  *ゲノム ,  風土病 ,  プロウイルス ,  エピトープ
準シソーラス用語： ウイルスゲノム ,  ゲノム配列 ,  分離株 ,  次世代シークエンシング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ウマ伝染性貧血ウイルス ,  分子キャラクタリゼーション ,  固有領域 ,  RNAゲノム ,  ウマ

分類 (5件)： ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  ウイルスの生化学  (EG04030F) ,  抗原・抗体・補体の生化学  (ED04020L) ,  ウイルスの生理一般  (EG04041H)

引用文献 (52件)：

• Cook, R.F.; Leroux, C.; Issel, C.J. Equine infectious anemia and equine infectious anemia virus in 2013: A review. Vet. Microbiol. 2013, 167, 181-204.
• Issel, C.J.; Cook, R.F.; Mealey, R.H.; Horohov, D.W. Equine infectious anemia in 2014: Live with it or eradicate it? Vet. Clin. North. Am.-Equine Pr. 2014, 30, 561-577.
• Leroux, C.; Cadoré, J.-L.; Montelaro, R.C. Equine Infectious Anemia Virus (EIAV): What has HIV’s country cousin got to tell us? Vet. Res. 2004, 35, 485-512.
• Leroux, C.; Craigo, J.K.; Issel, C.J.; Montelaro, R.C. Equine Infectious Anemia Virus Genomic Evolution in Progressor and Nonprogressor Ponies. J. Virol. 2001, 75, 4570-4583.
• Schwartz, E.J.; Nanda, S.; Mealey, R.H. Antibody Escape Kinetics of Equine Infectious Anemia Virus Infection of Horses. J. Virol. 2015, 89, 6945-6951.

タイトルに関連する用語 (8件)： ブラジル ,  自然感染 ,  ウマ ,  伝染 ,  ウイルス ,  ゲノム ,  流行 ,  地域