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J-GLOBAL ID:202102281970689103   整理番号:21A2363681

5種のバラ科における液胞H+-ATPアーゼ遺伝子ファミリーの全ゲノム同定とナシ(Pyrus bretschneideri)における発現解析【JST・京大機械翻訳】

Genome-Wide Identification of the Vacuolar H+-ATPase Gene Family in Five Rosaceae Species and Expression Analysis in Pear (Pyrus bretschneideri)
著者 (11件):
資料名:
巻:号: 12  ページ: 1661  発行年: 2020年 
JST資料番号: U7261A  ISSN: 2223-7747  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: スイス (CHE)  言語: 英語 (EN)
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液胞H+-ATPアーゼ(V-ATPアーゼ)はATP加水分解駆動プロトンポンプとして機能する多サブユニット複合体である。それらは,発生,代謝,ストレス,および成長などの生理学的過程において中心的な役割を果たす。しかし,Rosaceae種におけるV-ATPアーゼ(VHA)遺伝子の特性化に関する研究はほとんどない。したがって,本研究では,ゲノムワイド分析を実施し,5つのRosaceae種(Pyrus breschneideri,Malus domestica,Prunus persica,Fragaria vesca,およびPrunus mume)におけるVHA遺伝子ファミリーメンバーを同定した。合計159のVHA遺伝子を同定し,系統発生分析に従って13のサブファミリーに分類した。VHA蛋白質の構造は,同じサブグループ内の異なるVHA遺伝子間で高い類似性を明らかにした。遺伝子重複事象分析は,全ゲノム重複がPyrus bretschneideri VHA遺伝子(PbrVHA遺伝子)の拡大の主要な経路を表すことを明らかにした。ナシの組織特異的発現分析は,36のPbrVHA遺伝子が主要な組織で発現することを示した。花粉管成長が停止したとき,7つのPbrVHA遺伝子は,有意に下方制御された。さらに,多くのPbrVHA遺伝子は果実発育と貯蔵時に差次的に発現し,VHA遺伝子が発生と老化において特異的役割を果たすことを示唆した。本研究は,発生と老化の間のVHA遺伝子の潜在的役割をさらに解明するための基本的情報を提供する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (3件):
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遺伝子発現  ,  遺伝子の構造と化学  ,  植物の生化学 
引用文献 (54件):
  • Shimada, T.; Takagi, J.; Ichino, T.; Shirakawa, M.; Hara-Nishimura, I. Plant Vacuoles. Annu. Rev. Plant Biol. 2018, 69, 123-145.
  • Tan, X.; Li, K.; Wang, Z.; Zhu, K.; Tan, X.; Cao, J. A Review of Plant Vacuoles: Formation, Located Proteins, and Functions. Plants 2019, 8, 327.
  • Krebs, M.; Beyhl, D.; Gorlich, E.; Al-Rasheid, K.A.; Marten, I.; Stierhof, Y.D.; Hedrich, R.; Schumacher, K. Arabidopsis V-ATPase activity at the tonoplast is required for efficient nutrient storage but not for sodium accumulation. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2010, 107, 3251-3256.
  • Jiang, Y.T.; Tang, R.J.; Zhang, Y.J.; Xue, H.W.; Ferjani, A.; Luan, S.; Lin, W.H. Two tonoplast proton pumps function in Arabidopsis embryo development. New Phytol. 2020, 225, 1606-1617.
  • Vasanthakumar, T.; Rubinstein, J.L. Structure and roles of V-type ATPases. Trends Biochem. Sci. 2020, 45, 295-307.
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