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J-GLOBAL ID:202102282103621967   整理番号:21A1375179

分割統治マトリソーム蛋白質(DC-MaP)戦略:プロテオミクスマトリソーム特性化へのMSフレンドリーなアプローチ【JST・京大機械翻訳】

Divide-and-Conquer Matrisome Protein (DC-MaP) Strategy: An MS-Friendly Approach to Proteomic Matrisome Characterization
著者 (7件):
資料名:
巻: 21  号: 23  ページ: 9141  発行年: 2020年 
JST資料番号: U7038A  ISSN: 1422-0067  CODEN: IJMCFK  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: スイス (CHE)  言語: 英語 (EN)
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現在,細胞外マトリックス(ECM)は,一般的に知られている機械的役割を超えて,健康および疾患において多くの生体分子機能を果たす巨大分子の重要な複雑なメッシュワークと考えられている。その組成を解明することによってのみ,関連する組織工学と薬理学的努力を利用することができる。それにもかかわらず,その不偏なプロテオーム同定は,主に沈殿による部分的ECM濃縮,非フレンドリー質量分析(MS)界面活性剤を用いた逐次分別,および分析の前に完全に除去する必要がある厳しい試薬による再懸濁によるいくつかの制限に遭遇する。これらの方法は技術的に挑戦的で労働集約的であり,ECM同定の再現性に影響し,蛋白質損失を誘導する。ここでは,10mg以上の組織断片に適用できる簡単な新しい方法を示した。本法は,ヒト卵巣組織で検証され,MS適合性界面活性剤と複合遠心分離による試料処理のための標準化手順を含む。この2段階プロトコールは,困難な試料清澄化の必要性を排除し,著者らの試料を2つの画分,可溶性および不溶性に分割し,マトリソーム関連(ECM相互作用)およびコアマトリソーム(構造ECM)蛋白質で連続的に濃縮した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (1件):
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細胞生理一般 
引用文献 (50件):
  • Randles, M.J.; Lennon, R. Applying Proteomics to Investigate Extracellular Matrix in Health and Disease. Co Transp. Syst. 2015, 76, 171-196.
  • Taha, I.N.; Naba, A. Exploring the extracellular matrix in health and disease using proteomics. Essays Biochem. 2019, 63, 417-432.
  • Aebersold, R.; Mann, M. Mass-spectrometric exploration of proteome structure and function. Nature 2016, 537, 347-355.
  • Socovich, A.M.; Naba, A. The cancer matrisome: From comprehensive characterization to biomarker discovery. Semin. Cell Dev. Biol. 2019, 89, 157-166.
  • Byron, A.; Humphries, J.D.; Humphries, M.J. Defining the extracellular matrix using proteomics. Int. J. Exp. Pathol. 2013, 94, 75-92.
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